Войско Тимура двигалось с невероятной скоростью. Они преодолевали километр за километром, несмотря на падеж лошадей — те не выдерживали таких нагрузок. Люди тоже мучились, но великий эмир не обращал на это внимания. Он был одержим желанием наказать неблагодарного хана. Тактика, которую использовал Тимур в этом случае, была очень дерзкой, опасной, она, при определенных обстоятельствах, даже могла грозить поражением. Но именно эта внезапность появления войск Тамерлана привела его противника в замешательство, и Тохтамыш, отступая, снова удалился в степь.
А после того как Тимур обезопасил Самарканд, он расправился с изменниками. За добровольную сдачу Золотой Орде мятежный Хорезм заплатил очень дорого. Его главный город, Ургенч, был стерт с лица земли, и на его месте посеяли ячмень. Горожан угнали в Самарканд, где, приравняв к рабам, поставили на самые тяжелые работы. Именно в ходе этой кампании умер хан-марионетка Чагатаидов и на освободившийся трон немедленно сел его сын.
Итак, знамя великого эмира вновь взвилось над Самаркандом. Набег Тохтамыша показался коротким неприятным приключением. Мирная жизнь продолжалась. Но передышка оказалась недолгой. Уже следующей зимой, которая была крайне суровой, Тохтамыш стал серьезно готовиться к войне с Тимуром. Однако невиданные снегопады затруднили передвижение его войск. Остались лишь горные тропы, двигаться по которым можно было с невероятным трудом — лошади и без всадников проваливались по грудь в снег.
В 1391 году наступила решающая стадия борьбы между Тохтамышем и Тимуром. Тимур сам выступил навстречу войскам хана, о продвижении которых ему докладывали гонцы. И хотя войско он собрал небольшое, но решил, что откладывать поход не стоит. Тохтамышева рать была заметно многочисленнее, но недостаточно сплоченной. Опрокинув вражеский авангард, Тимур направил удар на центр золотоордынской армии. Но двигался он медленно и, если бы не помощь его сына Умар-шейха, то не смог бы победить упрямого противника. Всадники Умар-шейха ударили тюрко-монголов с тыла и вызвали в их рядах панику, которая вскоре перешла в полное беспорядочное отступление. Войска Тохтамыша и его союзников спешно перешли Сырдарью и рассеялись в степных просторах. Их бегство озадачило Тимура. Это могла быть обычная уловка для того, чтобы увлечь врага за собой, измотать и заставить сделать жесткий выбор: погибнуть или вернуться обратно. Но Тамерлан теперь не желал прощать неблагодарного бывшего друга. Только его смерть могла успокоить великого эмира.
Тимур женил своего сына Шейх-мирзу и после этого объявил о новом походе, стратегия которого была продумана заранее. Тамерлан отправился в Ташкент, где должны были собраться все его войска — там загодя были сделаны запасы хлеба и фуража. Снявшись с лагеря в начале зимы, великий эмир рассчитывал перейти Голодную степь, чтобы весной оказаться в крае менее диком, где мартовское солнце превращает степи в цветник. Но его первоначальные планы нарушила болезнь, ставшая результатом ранения в Систане, и полтора месяца Тимуру пришлось пролежать. Выздоровев, он тут же отправился в путь, возглавив полностью подготовленное войско. Не один месяц ушел на то, чтобы обнаружить Тохтамыша, поэтому войско великого эмира было истощено долгим походом. Тимур уже находился в Сибири, под Тоболом. Надо было решать — подниматься ли дальше по реке или же пойти к Уралу. Тимур приказал удвоить усилия разведки, и случай ему улыбнулся: лазутчики напали на след недавно прошедшего немногочисленного отряда — требовалось ускорить движение.
Пойманных пленников пытали, в результате удалось узнать, что Тохтамыш находится ближе, чем думали — западнее Урала. Сын Тимура получил задание как можно быстрее обнаружить противника, и это ему удалось. К начавшемуся сражению присоединился Тимур. Трое суток шла беспощадная битва, исходом которой стало бегство Тохтамыша. Великий эмир одержал победу. Золотоордынские земли он распределил между своими подданными. Более трех недель длился пир, после чего Тамерлан вернулся в Самарканд. Меньше чем за год он совершил поразительные деяния, однако, насколько они были оправданы?..
Через четыре года после иранской кампании Тимур решил туда вернуться. То, что там происходило, вновь требовало участия великого эмира — непокорных он привык наказывать. В конце июля 1392 года, наскоро собрав войска, он поднял новое знамя с серебряным драконом. Но, едва прибыв на место, Тимур заболел, как это было в Ташкенте перед походом на Тохтамыша. Эмир мучился ужасно, и все думали, что он вот-вот умрет. Читали молитвы, раздавали милостыню. К ложу Тамерлана были созваны его жены. Прибыл назначенный наследником внук Мухаммед-Султан.