В группе лидеров чемпионата «Зенит» держался весь сезон, до последнего претендуя на серебряные медали. Но в последнем туре досрочно ставший чемпионом «Спартак» проиграл московскому «Локомотиву», и «Локо» набрал столько же очков, сколько «Зенит». По результатам личных встреч «Зениту» досталась «бронза».
Достижение это в Петербурге встретили восторженно. В Спортивно-концертном комплексе, помнившем чемпионский триумф, при огромном стечении народа состоялась церемония награждения призёров, не уступающая празднеству 1984 года.
Андрей Аршавин:
Юрий Андреевич был любителем больших нагрузок – это же школа Лобановского, много беговых упражнений. Тренер он был требовательный, человек – жёсткий и эмоциональный. Помню, за два или три матча перед окончанием чемпионата России 2000 года Морозов сказал мне: «Так, Аршавин, бери свою сумку и можешь идти, тебя больше в команде нет». Прямо на тренировке, перед всей командой, на следующий день после какой-то игры! Я так и не понял, за что, и до сих пор не понимаю. Взял сумку, собрался, ушёл. После окончания сезона мне звонит президент клуба: «Андрей приезжай в офис, будем подписывать контракт». Я отвечаю: «Виталий Леонтьевич, я из команды отчислен, какой контракт?» Он: «Ничего-ничего, мы всё решим». Приехал, подписал новый контракт. Было ли это какой-то комбинацией Морозова и Мутко, что это вообще было, я так и не понял, мне никто ничего не объяснил.
Бронзовыми призёрами первенства России стали также зенитовские дублёры, возглавляемые Анатолием Давыдовым.
Чествование зенитовцев – бронзовых призёров чемпионата России 2001 г.
После окончания самого удачного для «Зенита» за последние несколько лет чемпионата стан сине-бело-голубых по разным причинам покинули Андрей Кобелев, Александр Горшков и Максим Деменко. Им на смену пришли первые в истории «Зенита» игроки из дальнего зарубежья. Это были сербские футболисты: защитник Милан Вьештица, полузащитник Владимир Мудринич и нападающий Предраг Ранджелович.
В полной мере заменить ушедших новички не сумели. Сезон 2002 года бронзовый призёр чемпионата начал не слишком удачно, к тому же в апреле оказался в больнице главный тренер Юрий Морозов. Удивительно зарифмованы оказались судьбы Павла Садырина и Юрия Морозова. У Юрия Андреевича так же, как и у Павла Садырина, было диагностировано онкологическое заболевание…
Президент клуба В. Л. Мутко отстранил Юрия Андреевича от руководства командой. «Я не хочу, чтобы он умер на стадионе», – признавался мне Виталий Леонтьевич. Но артист мечтает умереть на сцене. Морозов был приговорён, но рвался в бой. Юрий Андреевич звонил мне: «Попроси Мутко, чтобы он вернул меня в команду, я же готов, я же могу». Я передавал просьбу Юрия Андреевича президенту клуба, но тот отвечал: «Морозов гений, но я не могу его вернуть, я боюсь за его здоровье».
Андрей Кобелев – удивительный москвич, быстро заслуживший в «Зените» уважение партнеров, капитанскую повязку и любовь питерской торсиды
Морозова сменил его помощник Михаил Бирюков, при котором «Зенит» играл очень хорошо: в пяти матчах – четыре победы и ничья. При этом, победив 24 апреля в полуфинале Кубка России раменский «Сатурн» на его поле (гол забил Андрей Аршавин в дополнительное время), «Зенит» в пятый раз в своей истории вышел в финал Кубка.
12 мая на финале с ЦСКА «Зенитом» вновь руководил Юрий Морозов. Понятно, что этот матч был очень важен для него: он столько лет и сил отдал и «Зениту» и ЦСКА… ЦСКА победил 2:0. Вскоре Юрий Андреевич покинул свой пост, теперь уже навсегда…
Его место в качестве исполняющего обязанности ожидаемо занял Михаил Бирюков.