Но они сами терпели при этом поражение и посрамление: просвещаемый Духом Святым, Стефан говорил так убедительно, что иудеи со стыдом прекращали свой спор. Не имея возможности победить Стефана в споре, они в озлоблении возбудили против него народ, схватили его и привели на суд архиереев и старейшин; при этом они представили лжесвидетелей, которые обвиняли Стефана в хулении закона Моисея и храма Иерусалимского. Обвинение было тяжкое. Взоры всех присутствовавших в сонмище невольно обратились в ту сторону, где стоял подсудимый, и увидели, что лицо его сияло подобно ангельскому лику. Благодать Божия, которой наполнена была душа Стефана, в эту минуту отразилась на лице его небесным светом, он выглядел как небожитель. Первосвященник спросил Стефана: «Так ли это? Вправду ли ты хулил закон Моисеев?» На этот вопрос Стефан, воодушевленный благодатью Христовой, отвечал вдохновенной речью, в которой с силой обличал неверующих иудеев. Сначала, приводя доводы в свою защиту, он напомнил судьям историю народа Божия, начиная от его праотца Авраама и кончая Соломоном, который, по повелению Божию, построил храм в Иерусалиме. «Но Всевышний, – продолжал вдохновенно Стефан, – не в рукотворенных храмах живет, как говорит пророк: небо – престол Мой, и земля – подножие ног Моих. Какой дом построите Мне, говорит Господь, или какое место для покоя Моего? Не Моя ли рука сотворила все это? (см.: Пс. 66, 1, 2) Жестоковыйные! Люди с необрезанным сердцем и ушами! Вы всегда противитесь Духу Святому, как отцы ваши, так и вы. Кого из пророков не гнали отцы ваши? Они убили предвозвестивших пришествие Праведника, Господа Иисуса Христа, предателями и убийцами Которого вы сделались ныне, вы, которые приняли закон при служении Ангелов и не сохранили». После этих слов Стефан уже не мог ожидать себе пощады от озлобленных иудеев. Сердца их наполнялись злобой, когда они слушали его, от злости они скрежетали зубами. Тогда Господь благоволил подкрепить мужество святого апостола небесным видением. Исполненный Духа Святого, Стефан увидел отверстые небеса и Господа Иисуса в образе Сына Человеческого, стоящего одесную Бога. Стефан не устрашился исповедать это видение перед свирепевшими злобою врагами – судьями. «Вот, – громко воскликнул он, – я вижу небеса отверстые и Сына Человеческого, стоящего одесную Бога». После этого иудеи уже не сдерживали своей ярости. Закричав громкими голосами, они заткнули уши свои, чтобы не слышать его речей, и бросились схватить его. Как богохульника, святого Стефана вывели за город и, приведя в долину Иосафатову, лежащую между горой Елеонской и Иерусалимом, начали побивать камнями. Чтобы верхняя одежда не мешала им с большей силой бросать камни в святого первомученика Христова, убийцы сняли ее с себя и отдали стеречь родственнику его, юноше Савлу. Савл, будущий первоверховный апостол Христов Павел, тогда еще ревностно следовал ветхому закону и всей душой ненавидел христиан. Он стерег у ног своих одежду убийц своего родственника, душа его была полна ярости, и он поощрял убийц на убиение святого архидиакона Стефана. В отдалении, на горе Елеонской, стояла на камне Пречистая Матерь Божия со святым апостолом Иоанном Богословом и, взирая на мученическую кончину святого Стефана, прилежно молила о нем Сына Своего – Господа Иисуса Христа, чтобы Он укрепил святого мученика в терпении и принял душу его с миром и любовью. Осыпаемый градом камней, святой Стефан лицезрел в небесах взирающего на кончину его Господа Иисуса и с терпением предал себя воле Божией. Во все время страданий своих он прилежно молился Богу, пока наконец не настала минута кончины. В ужасном страдании, весь обагренный кровью, святой первомученик Христов произнес: «Господи Иисусе! Приими дух мой!» – и, преклонив колена, громогласно вознес последнее моление свое ко Господу, молитву об убийцах своих: «Господи! Не вмени им греха сего!» С этой молитвой на устах он предал святую душу свою Богу. Таким образом, святой апостол и архидиакон Стефан первым принял мученический венец за Христа, почему и назван первомучеником. Он был поставлен святыми апостолами в архидиакона вскоре после праздника Сошествия Святого Духа и принял мученический венец в тот же самый год, 27 декабря.
Убийцы святого первомученика Стефана бросили тело его на съедение зверям и птицам, и весь день и ночь оно лежало непогребенным. Но во вторую ночь славный законоучитель еврейский Гамалиил, который сам с сыном Авивом веровал во Христа и потом проповедовал Его как апостол, причтенный Господом к лику святых, послал верных людей тайно взять мощи святого Стефана и отнести их в село свое Кафаргамалу, отстоящее на двадцать стадий от Иерусалима, предал их там с почестями погребению, положив в пещере в новом гробе, который он приготовил для себя.