Первое, на что нацеливается глаз, высматривая потенциальную угрозу в ископаемой летописи, это эпохи великих вымираний. Обычно говорят о "большой пятерке": конец ордовикского периода (419 миллионов лет назад), конец девонского периода (364 миллиона лет назад), рубеж пермского и триасового (248 миллионов лет назад), конец триасового периода (206 миллионов лет назад) и рубеж мелового и палеогенового периодов (65 миллионов лет назад).
В такие времена за короткий (с точки зрения геологической науки!) срок в сотни тысяч — первые миллионы лет вымирали более половины прежних видов организмов, исчезали крупные, прежде заметные группы живых существ, значительно менялся состав сообществ. Например, в течение пермско-триасового кризиса, по некоторым расчетам, было сменено свыше 75 процентов палеозойской фауны, то есть фауны предыдущей эры. На место пассивных фильтраторов во многих ipynnax пришли активные, что существенно изменило характер потоков биогенных элементов в экосистеме океана и т.д. Под эти параметры подходят еще два события: поздневендское (550 миллионов лет назад) и позднераннекембрийское (525 миллионов лет назад), когда исчезали многочисленные группы живых существ, совершенно не похожие ни на какие из нынешних.
Сейчас лишь в околонаучной прессе продолжает обсуждаться связь подобных явлений с падением крупных метеоритов или астероидов. На самом деле, основные причины крылись в накопившихся нарушениях связей внутри отдельных сообществ и всей биосферы в целом, а спусковым крючком к началу каскада катастрофических событий могло послужить любое, казалось бы, прежде незначительное событие.
Так постепенные изменения в пермских наземных, прежде всего растительных, сообществах подстегнули развитие событий в море. Более совершенные измельчители и потребители древесины среди грибов и клещей ускорили оборот углерода. Накопление угля практически прекратилось. Как следствие усилилась подача питательных веществ с континентов в океан.
Дополнительный "корм" подсыпали вулканы. Ведь с пеплом, газами и водными растворами они выделяют довольно много марганца, железа, меди, цинка и других металлических "витаминов". А их в океанах так недостает планктонным водорослям для роста и воспроизводства! (Вокруг марганца, например, выстраиваются молекулы основного фотосинтезирующего пигмента — хлорофилла.) Можно подсчитать, сколько их попало в водную толщу, когда всего за 600 тысяч лет в Сибири вылилось на поверхность 1,5 миллиона кубометров жидкой лавы.
Производство органического вещества на морских "нивах" поддерживалось на уровне самых высокопродуктивных областей современного океана. Неподвижные фильтраторы палеозойских морей (брахиоподы, мшанки, морские лилии) не справлялись с выпавшими на их незавидную долю темпами поступления пищи и начали сходить на нет. По существу, прекратила сушествование вся фауна предыдущей эры.
Фауна меняла условия жизни на Земле, и новая фауна была приспособлена к ним лучше, чем предыдущая.
В довершение ко всему образовался суперконтинент Пангея, что привело к очередному падению уровня моря. Привычный ход жизни настолько нарушился за последние несколько миллионов пермских лет, что вымерло более 90 процентов видов морских животных.
А позднемеловой кризис длился не менее 50 миллионов лет, пока цветковые растения вытесняли из наземных сообществ голосеменные, что опять же привело к существенному изменению потока биогенных веществ с суши в океан. В целом же выстраивается кривая замедления крупных кризисных событий (25 миллионов лет прошло между первыми двумя; 106 миллионов лет — между следующими, далее — 126, 116,42 и 151 миллион лет, соответственно) и увеличения длительности самих событий. Да и дня самих организмов кризисные явления со временем становятся не столь драматичными. Меньше исчезает крупных групп, больше выживает отдельных видов, быстрее восстанавливаются сообщества, даже самые сложные из них, например рифовая экосистема. Во время мел-палеогенового вымирания она распалась на несколько миллионов лет, но затем восстановилась в прежнем виде, чего не случилось в результате прежних кризисов, когда новые рифовые организмы практически полностью замещали прежние.