22 июля 1999 г. китайские власти запретили деятельность секты и начали активно преследовать ее приверженцев. Сам Ли Хунчжи был объявлен в розыск (пустая, в общем формальность), 4 ноября Китай обратился за помощью в этом «розыске» в Интерпол.
В первую очередь, пострадали члены коммунистической партии, практиковавшие «Фалуньгун». 31 октября состоялся суд над четырьмя партийными руководителями, которые были приговорены к тюремному заключению от 7 до 18 лет. КПК обвиняла секту Ли Хунчжи в распространении ложных учений, мошенничестве, организации беспорядков, шпионаже, угрозе общественному строю, убийствах и доведении до самоубийств. Власти сообщали, что сектой уже доведено до смерти более полуторы тысяч человек.
Сектанты же как будто решили дать властям побольше следственного материала. В январе 2000 г. на площади Тяньань-мынь состоялась манифестация. Через месяц была пресечена попытка еще одной демонстрации, участники которой пытались закрыть портрет Мао Цзе Дуна на воротах Тяньаньмыня портретом Ли Хунчжи. В апреле на площади были арестованы 100 человек во время подготовки к массовой медитации.
23 января 2001 г. мир был потрясен известием о самосожжении, которому подвергла себя в знак протеста против репрессий группа сектантов на все той же главной площади китайской столицы. Среди пострадавших от ожогов была и 12-летняя девочка, пришедшая и участвовавшая в акции вместе с матерью. 25 февраля на одной из пекинских улиц облил себя бензином и поджег на глазах прохожих еще один член «Общества по изучению великого закона Фалунь» Тань Ихуэй; 30 июня 2001 г.
25 сектанток в трудовом лагере на севере Китая повесились на спинках кроватей — лишь 11 из них выжили.
Органы правопорядка применили к сектантам жесткие меры воздействия. Были изъяты миллионы изданий сектантской литературы, проведены облавы в разных уголках страны, многие члены организации оказались в больницах для душевнобольных и тюрьмах. Зарубежные борцы за права человека распространяют информацию, согласно которой репрессиям подверглось более 35 тысяч человек.
О той суровости, которую проявили власти, свидетельствует, например, такой факт. В декабре 2001 г. шестеро молодых последователей Хунчжи были задержаны и обвинены в скачивании из Интернета и распространении в китайском сегменте сети материалов «Фалуньгун». «Подпольщики» получили сроки от трех до двенадцати (!) лет. Чиновники, столкнулись с настоящей электронной войной со стороны «Фалуньгун». 5 марта 2002 г. состоялась, пожалуй, ее кульминация. Сектантам удалось прервать передачи 9-го центрального и некоторых провинциальных каналов и некоторое время передавать свои обращения и трансляции со стадионов, где происходили массовые медитации.
Для Вашингтона и некоторых других столиц события в Китае оказались прекрасным поводом, дабы в очередной раз подчеркнуть, что власти КНР регулярно нарушают права человека. 18 и 19 ноября 1999 г. палата представителей и сенат США приняли резолюцию, призывавшую правительство КНР соблюдать права человека и не оказывать давления на «Фалуньгун». Одновременно с участием сторонников «Фалуньгун» в США, Австралии, Гонконге, на Тайване развернулась шумная кампания протеста, в средствах массовой информации и в Интернете; появилось великое множество сообщений о незаконных преследованиях. «SOS! Прекратите борьбу с добром!», «Пытки в китайских тюрьмах!», «Бесчеловечное обращение с узниками совести!» — такие листовки раздавали на улицах и фотовыставках ребята в желтых одеяних из местных отделений «Фалуньгун». В борьбу за права человека вступила организация «Международная амнистия». 14 марта 2002 г. в Гонконге в акции в защиту секты приняли участие многие иностранные граждане. (Примечательно, что ни в Гонконге, ни на Тайване деятельность секты запрещена не была.) В 2004 г. парад фалуньгуновцев прошел в Париже.
Пулитцеровскую премию 2000 г. за лучшую работу в области международной журналистики получил Иэн Дножон из
На фоне всеобщего возмущения китайскими порядками одиноко звучит голос сотрудника Центра восточноазиатских исследований Гарвардского университета профессор К.-А. Шлефогта. Он почеркнул, что «Фалуньгун» манипулирует своими членами, подавляя их волю, обожествляет своего руководителя и имеет целью обогащение небольшой группы лиц. «Решительные действия властей исключительно важны, — пишет Шлефогт. — Последователи „Фалуньгун“ попали в ловушку, сами того не осознавая. Истинные преступники — это те, кто руководит сектой».