Монументальные скульптуры и вотивные рельефы от Архаического до Римского периода выставлены в зале A. В зале B представлено собрание экспонатов, демонстрирующих общественную жизнь Мегары в Классический период, а также надгробия Классического, Эллинистического и Римского периодов. В зале C выставлены предметы из погребальных комплексов, начиная с 8 в. до н.э. до I в. н.э., представляющие древние некрополи и погребальные обычаи. В зале D представлены предметы, связанные с повседневной жизнью древних мегарцев – в основном глиняные и бронзовые. Также здесь представлены находки из архаического святилища в Алепохори – в основном культовая керамика. Во дворе музея выставлены постаменты статуй и архитектурных частей зданий разных периодов.
Многие находки из Мегар попали в другие музейные собрания – прежде всего, в Национальный Археологический музей Афин.
Мыс Перахора глубоко вдается в Коринфский залив, и отсюда открывается прекрасный вид: кажется, что находишься на огромном корабле, который раздвигает море своими бортами. Неудивительно, что именно здесь древние дорийцы создали святилище. Затем святилище перешло под покровительство мегарцев, но потом вновь вернулось в подчинение Коринфу.
Святилище существовало по крайней мере с 10 в. до н. э. Почти тысячелетие сюда стекались паломники. Популярность святилища объясняется тем, что торговцы, которые плыли на кораблях в Коринф или возвращались из него, совершали здесь попутную остановку и приносили дары богине – в надежде на помощь в делах или в благодарность за помощь. Святилище приходило в упадок, когда Коринф разрушали завоеватели.
Главный храм святилища Геры, который не раз перестраивался, находился в крошечной бухте. Архаический храм Геры Акраи (окраинной) существовал здесь еще в 9-8 вв. до н.э., а потом был заброшен. Затем святилище возродилось – в 6 в. до н.э. Здесь был построен новый храм Геры Лимении (морской, портовой), вокруг храма добавлен ионический портик. Этот храм также был разрушен – вероятно, в результате землетрясения. После чего не раз ремонтировался и перестраивался.
После разгрома Коринфа римлянами во 2 в. до н.э., жизнь святилища на время угасла. Римляне построили здесь новое здание – вероятно, лечебницу. Страбон в I в. н.э. писал, что в Перахоре был оракул.
Недалеко от святилища Геры в глубине мыса находятся остатки храма и подземного сооружения, которое могло быть храмом Деметры. Может быть, это то самое место, в котором, по свидетельству Еврипида, были похоронены дети Ясона и Медеи, убитые матерью в припадке ревности.
Святилище занимает территорию размером примерно 45 м с севера на юг и 245 м с запада на восток и размещено в ложбине, протянувшейся от бухты между двумя скалистыми хребтами.
Площадка Герайона имеет три уровня.
Нижний уровень является архаичным дорическим храмом Геры Акраи и датируется 6 в. до н.э. Этот храм размещен на месте небольшого абсидального храма геометрического периода (конец 9 – начало 8 в. до н.э.), находившийся в районе алтаря. Алтарь (также архаический) был первоначально декорирован метопами и триглифами по всем четырем сторонам, а в поздний Классический период вокруг здания были добавлены ионические колонны.