В любом случае на тот момент Александр продолжал оставаться угрозой и мог превратиться в знамя для всех недовольных властью Филиппа. Кроме того, наследник пользовался в армии огромной популярностью. Поэтому царь сделал все, чтобы заставить Александра через несколько месяцев возвратиться в Пеллу, где его тут же посадили фактически под домашний арест. Теперь Филипп наконец почувствовал, что может развестись с неугомонной Олимпиадой и лишить Александра права на наследство. Это было вполне вероятно, поскольку его молодая жена все-таки родила мальчика, которого назвали Каран и о котором упоминает Юстин, либо царь мог вновь подумать о том, чтобы сделать наследником Арридея. Так или иначе, но ситуация складывалась таким образом, что Александру для того, чтобы сохранить себе жизнь, требовалось немедленно унаследовать трон. А значит, Филипп должен был умереть, и умереть быстро. И через несколько месяцев, в октябре 336 г. до н. э., царь Филипп Македонский действительно был убит молодым человеком по имени Павсаний. Тут же возникает вопрос: действовал ли этот знатный македонянин в одиночку?
Согласно сообщению Юстина, Павсаний убил Филиппа в отместку за то, что тот отказался наказать своего военачальника Аттала, который изнасиловал Павсания.
Аттал пригласил его на пир, напоил и не только сам удовлетворил с ним свою похоть, но и позволил поступить с ним, как с блудницей, всем, кто разделял с ним трапезу, из-за чего тот стал объектом насмешек со стороны своих сверстников. Разъяренный таким отношением, Павсаний часто жаловался Филиппу, однако ему под разными предлогами отказывали; продолжая подвергаться насмешкам и видя, как его враги пользуются благосклонностью военачальника, он в конце концов обратил свою обиду на самого Филиппа.
Диодор в своем сочинении также упоминает об изнасиловании, однако добавляет еще один мотив для убийства. По его словам, Павсаний был любовником македонского царя, и причиной убийства стала ревность, поскольку Филипп предпочел ему другого мужчину.
По мнению Плутарха, новая царица Клеопатра, племянница Аттала, тоже оказалась замешана в изнасиловании Павсания. Однако более интересно предположение Плутарха о том, что именно Олимпиада и Александр всячески поощряли Павсания отомстить и убить царя.
Юстин также обвиняет Олимпиаду в том, что она воздействовала на Павсания из-за того, что Филипп развелся с ней. Этот автор говорит о том, что тут был замешан и Александр, потому что его отец к тому моменту уже назначил наследником Арридея.