Первым деянием Собора стало решение о канонизации родителей преподобного Сергия Радонежского схимонаха Кирилла и схимонахини Марии, а также первого списка новомучеников XX века. Подчёркивалось, что это лишь начало церковного прославления мучеников и исповедников, пострадавших в годы революционной смуты и послереволюционного террора. Днём празднования Собора новомучеников объявили 25 января по старому стилю, в случае совпадения сего числа с воскресным днём или в ближайший воскресный день после оного. Во главе новомучеников поставили ранее канонизированного Патриарха Тихона. Следующими для рассмотрения комиссии по канонизации предусматривались члены семьи последнего российского императора. И далее всем епархиям предлагалось провести у себя на местах работу по изучению материалов о многих других новомучениках.
Далее четыре дня соборяне занимались только украинскими делами. Наконец, слово взял Предстоятель Русской Церкви:
— Нас уверяют, что предоставление автокефалии Украинской Православной Церкви решит все вопросы, как ранее нас уверяли в необходимости независимости в управлении и даровании митрополиту Филарету титула Блаженнейшего. Но титул Блаженнейшего не спас положения, предоставление независимости и «незалежности» тоже не дало результата. Не вернулись ушедшие в неканоническую автокефалию приходы, раскол укрепился. Возьмём ли мы на себя ответственность за разделение, есть ли у нас уверенность в том, что это принесёт благо святой Церкви?.. Для того чтобы говорить об автокефалии, нужна спокойная обстановка. Но в наше время — время разрушения экономических, национальных, человеческих связей, разделения и противостояния, от которых так устал народ, — желание сохранить единство Церкви является гласом Божиим. Все мы в ответе за то, что происходит на Украине, но с предстоятеля Украинской Церкви спрос особый. Мы просим владыку Филарета ради блага Православия на Украине, ради нашего единства, во имя спасения Церкви на Украине уйти со своего поста и предоставить епископам Украины возможность выбрать нового Предстоятеля.
Это был мощный удар. Денисенко пытался выразить своё возмущение, но когда соборяне предложили немедленно проголосовать о его снятии, понял, что дело совсем плохо, и пошёл на попятную, попросил не отправлять его на покой. Эти его просьбы были выполнены, но позора он наглотался вдосталь: несколько украинских архиереев выступили со словами, что ему верить нельзя, что он оборотень, и тогда Святейший Патриарх потребовал от Денисенко, чтобы тот перед крестом и Евангелием поклялся сложить полномочия, как только соберётся Собор Украинской Церкви, и немедленно восстановить смещённых им несогласных епископов. Это было уже полное унижение. Красный и потный Денисенко, целуя крест и Евангелие, дал архипастырское слово, что всё выполнит. Его ещё раз спросили:
— Точно ли то, что ты говоришь?
Он ответил:
— Мы же — христиане, и если мы говорим да, то да...
И он, конечно же, ничего не выполнит! Покажет, какой он «христианин».
Соборяне приняли определение о необходимости сохранения единства Церкви ради прекращения раздувания вражды. В определении также было чётко записано, что на предстоящем Архиерейском Соборе Украинской Церкви митрополит Филарет (Денисенко) подаст прошение об освобождении его от обязанностей предстоятеля и будет нести епископское служение на одной из кафедр. Вернувшись в Киев, Денисенко недолго оставался верен своему крестоцелованию. Уже 14 апреля он провёл пресс-конференцию, на которой заявил, что соборяне в Москве распинали его:
— Я прошёл Голгофу. Такой Собор был первым за тридцать лет моего пребывания в епископском сане. Мне дана грамота Патриарха Московского и всея Руси Алексия II в 1990 году на пожизненное возглавление Украинской Церкви. Поэтому я считаю, что в сложной нынешней ситуации в Украине я не могу идти на поводу у архиереев Русской Церкви и оставить на произвол украинскую паству. Моё обещание уйти с поста Предстоятеля Украинской Православной Церкви было сделано по дипломатическим соображениям, и я буду возглавлять Украинскую Православную Церковь до конца своих дней, поскольку я дан Богом украинскому Православию.
Филарет призвал всех украинских пастырей явиться к нему в киевскую резиденцию на улицу Пушкина, но пришёл только один — викарий Тернопольской епархии, епископ Почаевский Иаков (Панчук), наместник Почаевской лавры. За эту преданность лжепредстоятелю лаврская братия вскоре изгонит его из своих рядов.
17 апреля Патриарх Алексий отправил Лжефиларету с нарочным письмо — спрашивал, правда ли всё то, что говорят по радио и телевидению, пишут в газетах. Он также приглашал его 6 мая на заседание Синода. Ответа из Киева Святейший не дождался. Тогда Синод запретил Денисенко действовать в качестве Предстоятеля Украинской Церкви до созыва на Украине Архиерейского Собора.
Вскоре Святейший позволил себе на время забыть об украинских дрязгах: 8 мая его нога ступила на кипрскую землю, и, сойдя с трапа самолёта в Ларнаке, он радостно выдохнул: