С начала девяностых Рождество Христово стало выходным днём, а с начала нового столетия превратилось в настоящий церковно-государственный праздник, который государство стало отмечать более широко, хотя и не так, как Новый год. 8 января Патриарх совершил богослужение в Успенском соборе Московского Кремля, а на следующий день в Государственном Кремлёвском дворце поздравлял детей, пришедших на Рождественский праздник. Подумать только, что каких-нибудь двадцать лет назад подобное невозможно было представить — священникам начинают давать пенсию, глава государства с супругой приезжают поздравлять с Рождеством главу Церкви, он служит в кремлёвских соборах, поздравляет детей в Кремлёвском дворце!.. А теперь, в 2004 году, это уже вошло в привычное русло российской жизни.
3 февраля в Свято-Троицкой Сергиевой лавре на открытии VIII Всемирного Русского Народного Собора Патриарх произнёс вступительное слово, в котором заявил, что «настала пора переосмыслить роль Православия в мировой истории, в начертании судьбы человечества».
Приближался очередной — и, увы, последний! — юбилей Святейшего Патриарха Алексия II. 23 февраля ему исполнялось семьдесят пять лет.
Ожидание этой даты было омрачено двумя страшными московскими трагедиями — взрыв в поезде метро, 42 погибших, более сотни покалеченных, и обрушение крыши аквапарка «Трансвааль», под которой погибли 28 человек, в основном дети...
Прямо накануне юбилея, в Прощёное воскресенье 22 февраля, в Чистый переулок прибыли католики. Целая делегация во главе с председателем Папского совета по содействию христианскому единству кардиналом Вальтером Каспером, который передал Его Святейшеству письменное поздравление от Иоанна Павла II. Предстоятель Русской Православной Церкви был, как положено, любезен, но выразил недовольство политикой Ватикана в отношении России. В ответах гостей Святейший не услышал ни оправданий, ни обещаний преодолеть противостояние.
А Святейший отправился в храм Христа Спасителя, где вместе с Дмитровским епископом Александром совершил Великую вечерню и Чин прощения.
— Может быть, и я кого-то огорчил, обидел, не выслушал, не помог в трудную минуту, — говорил Святейший. — Поэтому я прошу всех вас, сослужители мои, дорогие братья и сёстры: простите меня за вольные и невольные согрешения мои, чтобы и мне примирённым и с совестью, и со всей нашей паствой вступить на поприще Великого поста. Простите меня, отцы и братия!
23 февраля выпало в том году на самый первый день Великого поста, и Святейший перенёс юбилейные торжества на день своей интронизации — 10 июня. Тем не менее в Чистый переулок поздравить Патриарха с днём рождения приехал президент Путин, на сей раз один. Он вручил Предстоятелю огромный букет его любимых белых роз и наградил Его Святейшество орденом «За заслуги перед Отечеством» 1-й степени. Эта высокая государственная награда была учреждена в России в середине девяностых, и первым, кто был удостоен её 1-й степени, сколь сие ни парадоксально, — президент Франции Жак Ширак! Ельцин, выписав ему этот орден, явно позабыл, что отечество-то у Ширака французское. Сам Ельцин стал вторым по счёту кавалером 1-й степени. Третьим, в 2001 году, — председатель Совета Федерации Егор Семёнович Строев. Четвёртым в 2003-м — академик, советник президиума Российской академии наук, почётный директор Института радиотехники и радиоэлектроники Владимир Александрович Котельников, основоположник советской засекреченной радио- и телефонной связи. Святейший Патриарх Алексий стал пятым кавалером ордена «За заслуги перед Отечеством» 1-й степени.
В благодарственной речи Патриарх отметил, что за годы правления президента Путина многое в России изменилось в лучшую сторону.
Весь Великий пост Предстоятель неустанно совершал богослужения в храмах Москвы и Подмосковья, навёрстывая упущенное в прошлом году из-за болезни. В это время прошли президентские выборы, Путин был на волне успеха и популярности, победил довольно легко. Святейший поздравил его:
— Убеждён, что наши сограждане сделали правильный выбор. Россия — великая страна с уникальной историей и культурой, и чтобы возглавлять её в наше сложное время, её лидеру необходимо обладать не только выдающимися административными способностями и управленческим опытом, но и суметь зажечь в душе народа надежду на достойное будущее. Наши избиратели засвидетельствовали, что видят в Вас человека, который в наибольшей степени воплощает в себе их представления о том, какой должна быть сегодня верховная власть. Исполняя свой христианский долг, мы молились и будем молиться за Вас как за президента нашей страны, помня, что «при разумном и знающем муже она долговечна» (Притч. 28. 2). Уверен, что многие верующие отдали свой голос за Вас в надежде на то, что Церковь и впредь будет занимать достойное место в общественной жизни России.
В день Светлого Христова Воскресения Святейший поздравил страну с Пасхой, и его поздравление транслировалось по нескольким каналам телевидения. Отныне также и президент страны поздравлял своих граждан с Пасхой.