В течение января Святейший окончательно выздоровел и мог полностью вернуться к своим делам. Он принял в гостях Патриарха Антиохийского и всего Востока Игнатия. Вместе с ним побывал на приёме у Путина. Отметил шестидесятилетний юбилей «Журнала Московской Патриархии», который отныне стал выходить в красочном исполнении. Вручил премии «За выдающуюся деятельность по укреплению единства православных народов».
Тем временем всё больше набирались смелости активисты-безбожники. Отрицать Церковь и издеваться над ней становилось новой модой. 14 января в Музее и общественном центре имени Андрея Сахарова открылась выставка «Осторожно, религия!», экспонатами которой стали хулиганские изображения, нарочито оскорбительные для христиан, к примеру, реклама кока-колы с ликом Христа и надписью по-английски «Сие есть кровь Моя», и т. п. В целом довольно глупые и похабные. Авторами их были почти полсотни так называемых художников, строящих своё «искусство» на сплошном эпатаже. Разразился скандал, подогреваемый тем, что 18 января шестеро молодцов устроили этой выставке погром, уничтожив значительную часть экспонатов. Стало очевидным, что в обществе набирают силу люди, которые и впредь будут делать себе карьеру на борьбе с Православием.
Накалялась обстановка вокруг Ирака, и Предстоятель бросил все свои силы на воззвания к мировому сообществу не допустить кровавой бойни.
Из Ирака приходили страшные сообщения — благодаря вторжению натовских вандалов страна была ввергнута в хаос, отдана на разграбление. Святейший следил за происходящим и резко критиковал:
— Несмотря на дипломатические усилия многих стран, война на библейских землях Ирака, бывших некогда колыбелью человечества, всё же была развязана. Создан новый опаснейший прецедент попрания норм международного права. Миропорядок всё больше строится на «праве сильного»...
Конечно же, он прекрасно понимал, что никто не станет прислушиваться к его призывам, воззваниям, письмам, заявлениям, что банда мировых грабителей во главе с Америкой просто нацелилась на то, чтобы захватить крупнейший нефтеносный регион, и никто не в состоянии остановить эту силу. Какое дело этим хищникам до русского Патриарха!..
Зато другая задача — задача восстановления единства Русской Церкви заметно сдвинулась с мёртвой точки, и тут он мог продолжать совершать усилия, имея надежду на то, чтобы довести это дело до желаемого успеха.
В марте состоялось ежегодное Епархиальное собрание Москвы, перенесённое с декабря прошлого года ввиду болезни Святейшего. Патриаршее послание, как всегда, было обстоятельным и подробным. Но сам автор из-за плохого самочувствия так и не смог лично его прочитать. Послание зачитывали митрополит Сергий и архиепископ Арсений.
В это время, с конца 2002 года, в средствах массовой информации стало появляться всё больше материалов, авторы которых стремились опорочить Церковь, возбудить вокруг неё скандал. Говорилось и о том, что в среде церковных иерархов образовались отдельные кланы, которые борются за власть, поскольку Патриарх болен и может вообще уйти на покой. О болезнях Святейшего в печати появились совсем уж хамские выдумки. Например, что ему было явление святого преподобного Феодосия Печерского, который укорял Алексия II, предрекал ему адские муки. Зная об этих и иных появившихся в СМИ клеветнических измышлениях, Святейший со вздохом говорил:
— Печалит, что организаторы кампании в прессе пытаются таким образом скомпрометировать не только иерархов, но и высоких представителей государства. Слава Богу, что никто из церковных иерархов не позволил себе включиться во всю эту кампанию. Иначе и быть не могло, ведь единство Церкви — это одна из главных забот всех нас, кто принёс архиерейскую присягу. Но сохраняется этическая проблема: кто, зачем, по чьему указанию, на чьи средства ведёт кампанию в прессе? Почему в целом ряде СМИ появляются почти одинаковые материалы, представляющие Церковь как поле борьбы двух-трёх человек или «групп влияния»? Если желают кого-то лично обидеть — Бог им судья. Если хотят таким образом подорвать моё здоровье — и за это прощаю. Но если стремятся расколоть Церковь, столкнуть её с властью, вернуться к временам диктата и гонений — имена таких людей и их деяния мы будем предавать гласности. Без лицеприятия и страха...
Увы, ряд перенесённых болезней сильно ослабил здоровье Предстоятеля, ему больше приходилось отдыхать, совершать прогулки, отказываться от любимых дел, связанных с патриаршим служением. Но отказаться от участия в торжествах по поводу 100-летия прославления преподобного Серафима Саровского он не мог и 29 июля прибыл в Саров. На торжествах в Сарове присутствовали президент Путин, Сербский Патриарх Павел, митрополит всея Америки и Канады Герман, архиепископ Кентерберийский Роуэн Уильямс и другие высокопоставленные лица.