Участниками Собора стали 234 человека, из них архиереев Русской Православной Церкви — 72, представителей православного духовенства — 84, верующих мирян — 78. В качестве представителей 124 зарубежных приходов Московского Патриархата выступили 25 иностранных граждан. Почётными гостями стали Патриархи Николай Александрийский и Юстиниан Румынский, митрополит Исидор Назаретский, архиепископ Григорий Синайский, представитель Автокефальной Православной Церкви в Америке архиепископ Филадельфийский и Пенсильванский Киприан, представитель папы римского кардинал Иоанн Виллебрандс, генеральные секретари Всемирного Совета Церквей пастор Юджин Блейк и Конференции Европейских Церквей доктор Колин Уильямс и др. Даже от старообрядцев приехал из Литвы один представитель.
В воскресенье 30 мая после совершения Божественной литургии у гроба преподобного Сергия Радонежского торжественный лаврский колокольный звон оповестил мир об открытии Поместного Собора. Собравшиеся все вместе пропели Никео-Цареградский Символ веры. На первом заседании выслушивались многочисленные приветствия гостей. Председатель Совета по делам религии Куроедов выступил с речью, в которой прозвучало: «разрешите сердечно приветствовать от лица правительства», «между государством и Церковью существуют вполне нормальные отношения» и «государство уверено, что Русская Православная Церковь и впредь будет развивать в народе патриотические чувства». На втором заседании с докладом «Жизнь и деятельность Русской Православной Церкви» выступил местоблюститель Патриаршего престола митрополит Пимен (Извеков). Затем у гроба почившего Патриарха Алексия совершили молебен обо всех предстоятелях Русской Церкви. На третьем заседании выступал митрополит Никодим (Ротов) сразу с двумя докладами. В первом, «Экуменическая деятельность Русской Православной Церкви», он не только развивал идеи поиска христианской экумены, единого мира и взаимопонимания между христианами разных вероисповеданий, но и очертил границы сближения русских с инославными. Во втором докладе — «Об отмене клятв на старые обряды» — он делал братские шаги навстречу старообрядцам.
Митрополит Алексий (Ридигер) выступал третьим. Его доклад назывался «О миротворческой деятельности Русской Православной Церкви». В нём он подводил итог работе, проведённой в шестидесятые годы, когда во многом благодаря стараниям русских архиереев мир не сорвался в пропасть третьей мировой войны. Приходилось делать экивоки и в сторону советской власти, отметившей недавно два своих юбилея — пятьдесят лет революции и сто лет Ленину. В докладе Таллинского митрополита прозвучала фраза, которую многие до сих пор не могут простить ему:
— Мы с горечью вспоминаем тот факт, что многие иерархи Русской Православной Церкви и часть её клира не поняли исторической обусловленности Великой Октябрьской Социалистической революции 1917 года в нашей стране... Не поняли эпохальности этой революции, освободившей народы нашей родины от капиталистического рабства...
Что и говорить, эти слова не украшают героя книги. Бог — судья. Кому-то нужно было брать на себя грех, кланяться власти, которая перестала гнобить Церковь... Основной смысл речей митрополита Алексия сводился к тому, что не время враждовать, сейчас самое главное — спасти мир от ядерной катастрофы.
Весь тон Поместного Собора был направлен на укрепление дружеских связей Церкви с Советским государством. И антиканонические «Положения об управлении РПЦ», навязанные Советом по делам Церкви Архиерейскому Собору 1961 года, получили единогласное одобрение.
Киевский митрополит Филарет (Денисенко), ровесник Алексия, в своём докладе критиковал униатство и так называемый «карловацкий раскол» — создание зарубежного независимого Управления Русской Православной Церкви в сербских Сремских Карловцах. Кто бы мог подумать тогда, что пройдёт два десятилетия, и тот же митрополит Филарет сам станет раскольником, основателем самостийной Украинской Церкви, будет предан анафеме, а антирусские украинские власти наградят его орденом Мазепы!..
Главное событие Поместного Собора произошло 2 июня, когда на вдовствующую кафедру открытым голосованием новым Патриархом был избран митрополит Крутицкий и Коломенский Пимен (Извеков). На него в последнее время перед кончиной указывал и покойный Патриарх Алексий. Его избрали единогласно, о чём, конечно же, многие потом злословили, что в нашей Церкви всё точь-в-точь как в нашем государстве — сплошное единогласие и единомыслие. «Партия сказала, Синод ответил: “Есть!”». Но верующим русским людям оставалось только радоваться, что Предстоятель Русской Церкви избран без бурь и несогласий, а значит, нет угрозы какого бы то ни было нового раскола. Уж очень много было нестроений и расколов в двадцатые и тридцатые годы!