После победы над турками в 1774 году Екатерина II решила ликвидировать Новую Сечь — приют для украинских и русских беглых крепостных крестьян, в особенности в связи с крестьянской войной под предводительством Е. Пугачева 1773—1775 годов. Пугачев вел переговоры с крымским ханом о совместном походе на Москву. По приказу Г.А. Потемкина Новая Сечь 5 июня 1775 года была занята русскими войсками. Часть запорожцев ушла и организовала Задунайскую Сечь.
В 1781 году были ликвидированы Малороссийская коллегия, Генеральный суд, центральные и полковые управления на Левобережье. Гетманщину разделили на три губернии-наместничества — Киевскую, Черниговскую, Новгород-Северскую, которые составили Малороссийское генерал-губернаторство во главе с П. Румянцевым. Глухов перестал быть столицей Гетманщины. В каждой губернии введено общероссийское административное управление, российская судебная система. В 1783 году ликвидировано казацкое полковое устройство — 10 полков заменено 10 регулярными карабинерными полками; посполитым запрещено уходить с тех мест, к которым они были приписаны во время последней ревизии — на Украине было введено крепостничество. В том же году из бывших запорожцев Г. Потемкиным было организовано новое казацкое войско. Так образовалось черноморское казачество. Сначала ему была обещана Очаковская область по лиманам Днестра и Южного Буга. По окончании второй Русско-турецкой войны 1787—1791 годов часть черноморских казаков в 1792—1794 годах была переселена на Таманский полуостров. Этим было положено начало кубанскому казачеству. Указом от 3 мая 1783 года в Гетманщине была введена общероссийская подушная подать. По Левобережью были распространены жалованные грамоты дворянству и городам. В 1786 году были отобраны в казну монастырские и архиерейские вотчины. Духовенство — по званию и рангу — было переведено на жалованье. Так было осуществлено намеченное Петром I присоединение Восточной Украины к Российской империи.
В 1783 году к Российской империи был присоединен Крым. О. Субтельный писал: «Для истории Украины, как и всей Восточной Европы, это было эпохальным событием. Тюркских кочевников, чьим последним бастионом в Европе было Крымское ханство и чье последнее нападение на Украину произошло в 1769 году, наконец остановили. Степь, которая тысячелетиями была центром опасности для оседлого люда, населявшего ее границы, наконец стала доступна для сельского плуга».
В результате трех разделов 1772, 1793 и 1795 годов Россией, Австрией и Пруссией польско-литовское государство Речь Посполитая перестало существовать. 60 процентов территории и 50 процентов населения Польши вошли в состав Российской империи. К 1795 году все Правобережье вошло в состав России.
В течение почти всего XVIII века, за время польского владения, на Правобережье действовали различные народные движения, превращавшиеся в настоящие народные восстания, охватывавшие большие территории, с трудом подавляемые поляками. Так возникла Гайдаматчина.
Слово «гайдамак» тюркского происхождения, татарское слово «гайда» — «беги, убегай» перешло в этом же значении в украинский язык. Гайдамаками назвали правобережных повстанцев польские историки конца XVIII века. Народ называл гайдамаков колиями, в Галичине — опришками. Гайдаматчина стала организованной войной против польской шляхты. Народ видел в гайдамаках своих мстителей, их поддерживали запорожцы, сочувствовало Левобережье, как на борцов за православную веру смотрела на них угнетаемое поляками православное духовенство.
Гайдамацкое движение достигло значительных успехов в 1734 и 1750 годах. Воеводства Киевское и Брацлавское находились во власти гайдамаков. Наиболее крупные города — Умань, Фастов, Радомысль — были взяты и разгромлены гайдамацкими отрядами. Неорганизованное и разрозненное крестьянское движение было подавлено силами польской шляхты.
В 1768 году началось новое крестьянское восстание — Колиивщина. Восстание совпало с образованием Барской конференции, направленной против России и польского короля Станислава Понятовского. На подавление конфедератов был направлен русский корпус генерала Кречетникова, обложивший их в Бердичеве.
После взятия Умани на Черной раде повстанцы Правобережья избрали гетманом Максима Железняка, уманским полковником — Ивана Гонту, ставших предводителями восстания. На захваченных территориях было установлено казацкое управление, земли разделены на полки и сотни, униаты и католики должны были или перейти в православную веру, или уйти прочь. Поначалу Россия поддерживала восставших, но, после того, как гайдамаки сожгли турецкий город Балту, турецкое, крымское и молдавское правительства начали угрожать России войной, если она не «успокоит» восставших. Восстание было подавлено. Гонта, как польский подданный, был судим в Польше и казнен мученически. Железняк, как русский подданный, был сослан в Сибирь. Тысячи участников Колиивщины были приговорены судом к различным тяжелым наказаниям.