2-ю костромскую гимназию Федор Трухин окончил в 1914 г. и поступил на юридический факультет Московского университета. Окончив успешно два курса, Трухин добровольцем поступил во2-ю Московскую школу прапорщиков и в 1917 г.занимал должность выборного командира батальона 181-го Остроленс-кого полка 46-й пехотной дивизии. Прохладное отношение Трухина к «верноподданическому прошлому» отца и сдержанность в отношениях с чинами Белых армий имеют свое объяснение: как в плохом литературном произведении, младший сын председателя уездного земства и действительного статского советника мечтал о революции с гимназической поры. Вместе с сыном костромского вице-губернатора А. В. Гуссаковским Федор Трухин состоял в конспиративном революционном кружке, надеясь, что грядущая революция устранит разом все несуразности и несправедливости патриархальной жизни российской провинции. «Онн ушли в революцию. Оии хотели делать революцию», - вспоминала О. Н. Гуссаковская. Федор Иванович Трухин вступил в РККА в ноябре 1918 г. и начал военную карьеру в Красной армии в должности командира отделения Костромского губернского запасного кавалерийского полка.
В Гражданской войне 1917-1920 гг. он принимал участие на строевых должностях в боях с частями армии УНР Головного Атамана С. В. Петлюры н разными повстанческими отрядами, закончив войну в должности командира 362-го стрелкового полка. За личное мужество и храбрость, проявленные в боях с петлюровцами и многочисленными «батьками», в 1924 г. красном Трухин был награжден орденом Красного Знамени, к которому был представлен еще в ноябре 1920 г, Карьерный рост сопровождался постоянной и настойчивой учебой и самообразованием: в 1921 г. - командир роты на Костромских пехотных курсах РККА; в августе 1925 г. - выпускник Военной академии
РККА; в январе 1931 г. - начальник штаба 12-го стрелкового корпуса в Приволжском военном округе (далее - ВО); в апреле 1934 г. - начальник кафедры методики боевой подготовки, в ноябре 1939 г.- выпускник Академии Генерального штаба и старший преподаватель кафедры оперативного искусства.