Европейские страны были оккупированы Германией, обстановка в ней для работы разведки в 1940 году чрезвычайно осложнилась, и развертывать там новую линию работы не представлялось возможным. Поэтому основными центрами приложения усилий разведки стали Великобритания и США, в которых вероятней всего следовало ожидать существенных подвижек к атомному оружию.
Под влиянием всех этих обстоятельств в резидентуры разведки в странах, в которых могли начаться соответствующие изыскания, была послана осенью 1940 года директива выявлять центры поиска способов применения атомной энергии для военных целей и обеспечивать получение из них достоверных сведений о создании атомного оружия.
Пионером добычи информации об атомном оружии оказалась Лондонская резидентура. Уже в сентябре 1941 года были получены первые в истории разведки достоверные сведения о том, что идея создания атомного оружия приобрела в Англии в 1941 году практические очертания. Объединенный Комитет начальников штабов даже потребовал создать атомную бомбу в течение двух лет. В полученной информации были сведения о деятельности специального Уранового комитета, о величине критической массы урана-235, порядка 10 килограммов, разделенной на две полусферы для предотвращения преждевременного взрыва, скорости их соударения не ниже 2–2,5 тысяч метров в секунду в устройстве пушечного типа, специальном инициаторе для возбуждения цепной реакции в заряде бомбы, технологии извлечения этого изотопа из натурального урана методом газовой диффузии, о намеченных для участия в связанных с этим работах ведущих университетах и влиятельных монополиях «Импириал Кемикл Индастриз», «Метрополитен Виккерс», а также Вулвичского Арсенала — объектах разведывательного проникновения НТР.
Информация была доложена Берии, который отверг ее как немецкую диверсию, нацеленную на отвлечение людских и материальных ресурсов страны от ее военных усилий. Неспособность Берии оценить важность добытой информации понятна в силу его подозрительности и невежества в научных вопросах. Между тем вероятность появления атомного оружия не вызывала сомнений узнающих людей. В декабре 1941 года дальновидный отечественный физик Георгий Флёров обратился в Государственный комитет обороны с призывом безотлагательно начать в стране работы по созданию собственного атомного оружия, но ответа не получил.
Между тем события вокруг атомного оружия продолжали развиваться своим чередом. В феврале 1942 года фронтовые разведчики Красной Армии пленили немецкого офицера и находят в его портфеле тетрадь с непонятными им сведениями, которая пересылается в Наркомат Обороны, а оттуда — уполномоченному по науке Государственного комитета обороны. Здесь было установлено, что немецкая военщина намеревалась искать способы применения атомной энергии для военных целей. В марте 1942 года по дополнительной информации из Лондона НТР подготовила спецсообщение Сталину о реальности появления в недалеком будущем атомного оружия с предложением образовать при ГКО полномочный орган координации в стране исследований и использования их результатов для создания отечественного атомного оружия. На этот раз Берия соглашается послать это сообщение за своей подписью. В мае 1942 года на имя Сталина поступает в ГКО второе письмо Флёрова с настойчивым призывом немедленно начать работы по созданию отечественного атомного оружия. На основе информации, собравшейся у Уполномоченного по науке ГКО, а в конце 1942 года у Сталина, с участием академиков Иоффе, Семенова, Хлопина, Капицы принимается решение о создании центра руководства исследовательской и экспериментальной деятельностью, который под кодовым названием “Лаборатория № 2 Академии наук СССР» заработал в марте 1943 года под руководством И.В. Курчатова. 1943–1945 годы были периодом собирания сил, ресурсов, углубленного исследования проблем создания атомного оружия, а система руководства в государственном масштабе находилась в процессе становления. Уничтожение японских городов Хиросима и Нагасаки американскими атомными бомбами потребовало быстрого перевода всех работ на более высокий уровень организации. 20 августа 1945 года создается Специальный комитет по Проблеме № 1 и при нем Научно-технический Совет, а при СНК СССР (в дальнейшем СМ СССР) — Первое Главное Управление для руководства НИИ, КБ и промышленными предприятиями — участниками работ по использованию атомной энергии для военных целей.
Информация разведки стала играть свою роль практически с момента начала работы Лаборатории № 2. Значение первых же сведений, с которыми знакомился И.В. Курчатов, состояло по его мнению в том, что «они заставляют нас по многим вопросам пересмотреть свои взгляды и указывают на технические возможности решения всей проблемы в значительно более короткие сроки», чем предполагалось. Эта информация имела этапное значение, ибо способствовала оптимизации программы создания собственного атомного оружия.