По справке морского отдела на сентябрь в морской авиации имелось 45 боеготовых лётчиков (в том числе 1 1 в учебных заведениях); принималось во внимание, что в случае необходимости Школа морской авиации им. Троцкого в состоянии подготовить за шесть месяцев 35 человек. К этому времени на Балтике были перевооружены один истребительный отряд на самолёты «Балилла» А-1 и разведывательный отряд на летающие лодки С-16бис. На Чёрном море разведывательный гидроотряд переучивался на С-16бис.
Из отчётов по итогам работы авиации за 1923 г. следовало: разбиты: С-16бис; «Балилла»; Фэйри; по причине пожара в воздухе потеряно три С-16; разбито на посадке два М-9. Итого за год 12 лётных происшествий, из которых три со смертельным исходом.
Приказом РВС СССР No.446/96 от 28 марта 1924 г. Главвоздухофлот переименовали в Управление ВВС СССР (с января 1925 г. – Управление ВВС РККА) с подчинением РВС СССР. На него возлагались задачи по учебной, строевой и боевой подготовке ВВС, снабжения их специальным имуществом.
К апрелю 1924 г. предполагалось увеличить количество самолётов в разведывательных и истребительных отрядах до восьми действующих и четырёх запасных. В октябре 1924 г. принято решение количество самолётов в разведывательных отрядах довести до 10 при пяти запасных, а в истребительных – до 12 самолётов при шести запасных. На 1925 г. предполагалось приступить к формированию аэроминоносных гидроотрядов из шести действующих и трёх запасных самолетов в каждом.
Коренная перестройка Вооруженных сил, известная как «военная реформа, началась в 1924 г. Решением правительства от 15 апреля 1924 г. Рабоче-Крестьянский Воздушный Флот переименовали в ВВС РККА, а Главное управление Воздушного Флота стало называться Управлением ВВС (УВВС) с подчинением Реввоенсовету СССР.
К этому времени Военно-воздушные силы разделились на боевые (сухопутная авиация, морская авиация, части воздухоплавания) и тыловые (аэродромы, склады, учебные заведения и др.) части и учреждения.
Обстановка заставила в очередной раз вернуться к оценке возможностей и подчинению морской авиации. 28 августа 1924 г. за подписью временно исполняющего должность начальника и комиссара управления Алксниса в адрес начальника штаба ВВС СССР поступил доклад.
«Штаб морских сил СССР возбудил ходатайство о пересмотре вопроса организации и подчинения морской авиации и назначения специальной комиссии для всестороннего освещения вопроса о современном положении морской авиации. Организация управления штаба РККА со своей стороны полагает, что в настоящее время морская авиация, в полном смысле, то есть по обслуживанию морских судов в открытом море не имеется, а имеется авиация по охране побережья и по ближней разведке. Отмеченная авиация может быть подчинена Морскому штабу только в оперативном отношении, во всех остальных отношениях должна быть подчинена штабу ВВС Союза».
До 1924 г. практическое управление морской авиацией осуществлял отдел штаба Воздушного Флота Республики. При сокращении управленческого аппарата вооруженных сил вместо этого отдела в штате созданного УВВС ввели должность специалиста по морской авиации с несколькими помощниками, которые выполняли роль связующего звена между военно-морским и авиационным командованием. Конечно, подобное двойственное подчинение морской авиации несколько затрудняло её обеспечение и финансирование.
Морская авиация, в свою очередь, стала включать части разведывательной, истребительной, тяжелой (бомбардировочной) авиации и подразделения корабельной авиации.
В 1924 г. из авиационной бригады и трех эскадрилий были образованы ВВС Балтийского моря. В сентябре того же года штаб начальника Воздушного флота Черного и Азовского морей переименовали в штаб начальника Воздушных сил Черного и Азовского морей, а еще через год – в Управление ВВС Черного моря.
Утверждённый Председатель Реввоенсовета 22 сентября 1924 г. утвердил План развития ВВС РККА. Это довольно обстоятельный документ. В части морской авиации План был согласован с морским командованием и предусматривал лишь базовую авиацию. Вот некоторые выдержки: «УВВС считая необходимым усилить активные средства на подступах к Ленинграду, предусматривает развитие в г. Троцке сухопутной тяжелой авиации, способной действовать по флоту противника. Лишь в июле сего года штаб РККА впервые выдвинул идею развития корабельной авиации (утверждение весьма сомнительное. Прим авт.). причём первый его период с передвижкой на год утвердил председатель РВС т. Фрунзе.