Во время Второй мировой войны на территории Косова и Метохии, а также Македонии работала албанская администрация, была возрождена албанская символика, все делопроизводство и обучение велось только на албанском, населению активно раздавались земли, оставленные сербами. Фашистский режим способствовал созданию этнически чистого – албанского – Косова. Албанцы принимали самое активное участие в жестоких акциях физического уничтожения и изгнания сербов из края. В конце 1942 г. была создана националистическая организация «Бали Комбетар» («Народный фронт»), ставившая задачу борьбы за Великую Албанию, объединяющую территории Греции, Македонии, Сербии и Черногории, населенные албанцами. Достичь этого они стремились путем физического уничтожения сербов. Не менее известна своей жестокостью 21 горная Ваффен-дивизия СС «Скандербег», сформированная 1 мая 1944 года. Солдаты были преимущественно мусульмане-сунниты. Офицерский корпус – около 500 человек – полностью состоял из немцев.
Когда 8 сентября 1943 г. было объявлено о капитуляции Италии, «Бали Комбетар» (БК) остался союзником Германии в борьбе против антифашистской коалиции с единственной целью – сохранить Великую Албанию. В конце 1944 – начале 1945 г. БК развернула в Космете широкомасштабную партизанскую войну, которую удалось подавить силами пяти армейских дивизий Народно-освободительной армии Югославии. Центр сопротивления балистов находился в Дренице. В 1998 г. центром активного сепаратистского движения также стала Дреница, здесь ныне действующим президентом РК Х. Тачи была создана самая мощная мафиозная структура – «Дреницкая группа».
Именно во время и после Второй мировой войны в результате этнических чисток и депортаций сербов, а также разрешенной правительством Тито массовой колонизации переселенцами из Албании, закрепился формировавшийся в период османского владычества этнический дисбаланс. По переписи 1948 г. численность албанцев равнялась 498242, или 68,45%, сербов – 171911, или 23,62%, черногорцев – 28050, или 3,85%. К 1990-м годам в Косово произошла полная албанизация – более 90% населения края составляли албанцы. В настоящее время край является этнически «чистым» – албанцы составляют 93% населения. Однако природа сепаратистских настроений, разделяемых большинством населения края, имела не только этнические, но и религиозные основания – косовские албанцы (в отличие от албанцев, проживающих в то время в Албании) в подавляющем большинстве исповедовали ислам. В то же время без активной (финансовой, политической, военной) поддержки радикальных террористических групп, боровшихся за отделение края от Сербии, со стороны западных стран возникновение Республики Косово и сценарий «А» были бы невозможны.
Высокая вероятность реализации сценария определена: