Более громкий террористический акт произошел через неделю, 3 мая 1906 года. Узнав, что в полночь через Нижнеднепровск проедет поезд с комиссией, возглавляемой министром путей сообщения, анархисты решили устроить взрыв. К железной дороге отправились Павел Гольман, Семен Трубицын и Федосей Зубарев. Поезд задерживался (кстати, возглавлял комиссию не министр, а начальник Приднепровской дороги) и анархисты решили бросить бомбу в вагон первого класса показавшегося курьерского состава. Зубарев бросил бомбу, повредившую стенку вагона, но состав не остановился и промчался мимо. Однако, при взрыве пострадал Павел Гольман, которого пришлось доставить в больницу.
Спустя восемь дней, 11 мая, Федосей Зубарев предпринял еще один террористический акт. Он изготовил две бомбы, снабженные часовыми механизмами, и установил их возле казачьих казарм в Амуре. Расчет был сделан на то, что после взрыва первой, относительно небольшой бомбы, казаки выбегут на улицу искать нападавших, и тут взорвется вторая, куда более мощная, бомба. На деле же все вышло совсем не так. Услышав первый взрыв, казаки не выбежали на улицу, а спрятались в помещениях казарм. Поэтому последовавший за первым взрыв восьмикилограммовой бомбы не принес жертв, а лишь свалил часть забора вокруг казарм.
В ответ на боевые вылазки анархистов власти предприняли серию обысков и арестов. 13 мая, на массовке в самом Екатеринославе, полиция арестовала 70 человек, в том числе почти всех активистов собственно городской группы. Задержанных разместили в бывших казачьих казармах, так как Екатеринославская тюрьма была перенаселена и уже не могла вместить новых арестантов. Казачьи казармы охранялись хуже тюрьмы и совершить из них побег было легко. В конце концов, 1 июля двадцать один заключенный бежали из казарм с помощью часового солдата.
Следующее крупное вооруженное столкновение с представителями власти произошло 26 июля. В этот день в степи за рабочей Чечелевкой походила массовка, собравшая около 500 человек. Когда массовка закончилась и сочувствующие рабочие разошлись, осталось 200 человек, непосредственно участвовавших в анархистском движении. Они проводили собрание, а после его окончания также двинулись в сторону города. Возвращавшаяся группа из тридцати анархистов внезапно столкнулась на степной дороге с двигавшимися навстречу конными драгунами численностью в 190 человек. Использовав темноту, удобное расположение кустов вдоль дороги, анархисты открыли по драгунам огонь и успешно отбились, убив девятерых и ранив четверых солдат. Со стороны анархистов пострадал лишь легко раненый Зубарев. Зубарь, вооруженный бомбой и браунингом, заскочил в первый попавшийся дом и потребовал оказать ему медицинскую помощь.
Лето 1906 года в Екатеринославе отличалось небывалым всплеском террористической активности анархистов, причем практически все нападения и покушения оказывались удачными и проходили без потерь со стороны анархистов. Первое место среди террористических актов анархистов в это время занимали нападения на полицейских чинов и доносчиков. Так, до августа 1906 года в Екатеринославе и окрестностях были убиты организатор охранного отделения на Амуре Кальченко, начальник стражников Морозов, трое околоточных надзирателей и десять городовых, еще десять сотрудников полиции получили ранения.
Помимо нападений на полицейских существенную роль играли и акты экономического террора, осуществлявшиеся против директоров, инженеров и мастеров. В то же время экспроприаций за лето 1906 года было проведено всего четыре, но зато все крупные: на товарной станции Амур захвачен 1171 рубль; в конторе лесопильни Копылова – 2800 рублей; в казенной палате – 850 рублей и при выезде в Мелитополь – 3500 рублей.
Однако, в августе 1906 года группу постигли и потери двоих видных активистов. 5 августа, в девять часов утра, в земскую больницу, где под охраной полиции находился арестованный за участие во взрыве курьерского поезда раненый Павел Гольман, явилось семеро анархистов во главе с другом Гольмана Семеном Трубицыным. Они обезоружили городового и ворвались в палаты с криком «Где Гольман?». Павел выбежал сам, отбросил костыли, сел на извозчика и уехал на Амур. Однако, через несколько часов полиции удалось выйти на след Гольмана: увезшего его извозчика вычислили по номеру и выпытали у него адрес дома, куда он доставил беглеца и сопровождавших его анархистов. Дом на Амуре, в котором скрывался Гольман, окружили. К этому времени товарищи оставили Павла в доме одного, а сами отправились искать ему убежище. Увидев, что дом окружила полиция, Гольман стал отстреливаться, убил стражника и, видя бесперспективность своего положения, застрелился.