Карнак стал священным местом еще до того, как было создано Новое Царство. Археологи обнаружили, что храмы существовали здесь во времена правления царя Синвосра I (1971 — 1926 гг. до и. э.). Но именно в период развития Нового Царства Карнак стал религиозным центром Египта. Египтяне поклонялись сотням богов, но одним из самых важных был Амон — бог солнца. Солнце играло решающую роль в жизни египтян, поскольку от него зависел урожай зерна, и египтяне поклонялись нескольким различным богам солнца. Однако Амон был самым могущественным; во времена правления Синвосра ему был присвоен титул Царя Богов. Амон оставался главным богом солнца в течение сотен лет.
Карнак достиг пика своего развития в период правления Рамсеса II (1290 — 1224 гг. до н. э.) — того самого фараона, который сражался с хеттами в Кадеше. Рамсес был одним из самых долгих правителей Египта, и этот период был отмечен созданием многих строительных и архитектурных проектов. Он расширил храм Амона в Карнаке и завершил Великий Гипостильный Зал — один из крупнейших в мире одиночных залов, которые когда-либо были построены. Строительство Великого Гипостильного Зала началось еще во время короткого правления Рамсеса I (1307–1306 гг. до н. э.) и было продолжено его сыном Сети I (1306 — 1290), однако все же не было завершено. Строительные работы были закончены при Рамсесе II, так что именно ему принадлежит заслуга в строительстве этого зала!
Жрецы были одними из самых могущественных людей в Египте. Очень часто храмы были закрыты для всех, кроме царя и жрецов. Люди верили, что жрецы имеют особые отношения с богами, а поскольку фараон сам был богоподобным существом, они имели такие же отношения и с фараоном. Еще одним фактором, который давал большую власть жрецам, была огромная свита Амона. Они молились по всему Египту и тысячи людей работали в храмах в качестве слуг бога. И действительно, найдены папирусы времен Рамсеса III, в которых говорится о том, что у Амона было более 80 тысяч слуг и рабов. Храмам принадлежали огромные участки земли, а также рогатый скот и другие животные, которые приносились в жертву Амону. В руках жрецов было все богатство храмов, что делало их еще более могущественными.
Полное согласие между фараоном и жрецами способствовало спокойному развитию государства и усилению позиций Египта во всем мире. Но временами жрецы пытались захватить власть в свои руки. В 1080 году до н. э. Верховный Жрец Амона Хрихор объявил себя царем и попытался сделать Египет религиозным государством. Резные барельефы на стенах Карнака изображают Хрихора делающим жертвоприношения богам. Хрихор изображен стоящим на том месте, где обычно находился фараон. Действия Хрихора ослабили положение Египта. Это обстоятельство, а также тот факт, что Египет начал терять контроль над богатыми провинциями, например, Нубией, привело к нескольким вторжениям в эту страну врагов. Египет вслед за Ливаном был захвачен кушитами и ассирийцами. С этого времени Египет никогда не был по-настоящему независимой страной, а всегда подвергался агрессии.
Амон вначале был богом одной провинции Фивы и ко времени создания Нового Царства стал одним из национальных богов. По мере того, как Фивы превращались в мощный город, все большее и большее влияние приобретал и Амон, пока не стал самым главным богом Египта. По мере того, как он приобретал все большую значимость, его изображение менялось. Во времена Среднего Царства он был богом-создателем, и его изображали в виде гуся, а затем в виде барана. Иногда его представляли в виде человека с бараньей головой. На вершине своего могущества Амон стал богом солнца и богом фараонов. На некоторых изображениях он показан в виде человека, носящего корону и держащего скипетр и анх — египетский символ жизни. На более поздних изображениях он показан охраняющим фараона.