Остальным конвоям повезло больше. Несмотря на постоянные атаки с воздуха и из-под воды, они все-таки добирались до цели. Например, утром 6 сентября в море вышел конвой из 4 судов, которые сопровождали не меньше 12 эсминцев. Днем его прикрывали с воздуха 7 Ju-88, 5 Макки-200 и 1 Кант Z.506. «Бофорты» с Мальты сумели прорваться сквозь воздушное прикрытие и торпедировали транспорт «Манара». Хотя он не затонул, его пришлось отбуксировать в Грецию. Когда на следующий день конвой атаковала подводная лодка «Ультиматум», преждевременный взрыв торпеды предупредил итальянцев. Они уклонились от остальных торпед, но и «Ультиматум» сумела уклониться от контратаки эсминцев. Весь день и всю ночь самолеты пытались остановить конвой — днем американские «Либерейторы», ночью торпедоносцы КВВС, однако они лишь повредили 1 эсминец близкими разрывами бомб.
8 сентября Роммель писал:
«Ситуация со снабжением превратилась в кризис, в основному потому, что отправленные припасы никак не могут достичь цели. За первые 8 месяцев 1942 года мы получили примерно 120000 тонн, только 40 % наших минимальных потребностей. Все больше и больше судов гибнет, все меньше и меньше выделяют итальянцы для перевозок в Африку. Количество потопленных кораблей постоянно растет. С февраля до конца июля противник потопил 10 кораблей. С конца июля до середины октября — 20».
Таким образом, командующий Танковой Армией невольно признал значение морской мощи. А ведь после своей ослепительной победы под Тобруком он закрыл глаза на этот фактор. Теперь Роммель обнаружил, что попался в сети, которые сам же и расставил, когда потребовал отложить захват Мальты. «На совести Мальты находятся жизни многих тысяч германских и итальянских солдат», — написал он. Гораздо правильнее будет возложить гибель этих солдат на совесть тех, кто не сумел организовать вторжение на Мальту — прежде всего на итальянское верховное командование в первые месяцы войны, а потом на Гитлера и германское верховное командование. Но в самый роковой момент после Тобрука в этом был виноват и сам Роммель.
Несмотря на обещания Кавальере и Commando Supremo, ситуация со снабжением в сентябре улучшилась совершенно незначительно. В африканских портах разгрузилось больше транспортов, и потери сократились до 20 %. Однако Роммель обнаружил, что большая часть доставленного предназначена итальянской дивизии, расквартированной в Киренаике. Вдобавок итальянцы просто захватили изрядную часть остального, и Танковая Армия почти ничего не получила. Африканскому Корпусу теперь не хватало даже продовольствия, что сказывалось на здоровье солдат.
Еще больше усложняло проблему появление у союзников тяжелых бомбардировщиков. Они начали постоянные дневные налеты на порты Северной Африки под сильным истребительным прикрытием. Эти налеты были гораздо более эффективны, чем ночные беспокоящие удары. 23 сентября во время атаки в Бенгази был уничтожен транспорт с боеприпасами. Его взрыв разрушил главный причал в порту.
25 сентября по приказу Гитлера Роммель вылетел в Германию для лечения. Генерал Штумме, прибывший с русского фронта, должен был в его отсутствие исполнять обязанности командующего. И в Риме, и в ставке Гитлера Роммель пытался убедить вождей в необходимости решить проблему снабжения. Но в «Волчьем Логове» он окунулся в «атмосферу чрезвычайной уверенности». Гитлер заверил его, что данная проблема будет решена в ближайшие недели использованием большого количества самоходных паромов Зибеля. Фюрер продемонстрировал сводки, показывающие быстрый рост производства вооружений. Он пообещал Роммелю отправить в Африку бригаду новейших реактивных минометов и 40 тяжелых танков «Тигр». За ними должны были последовать несколько подразделений штурмовых орудий.
Но Роммеля не убедили эти пылкие заверения. В то время, когда он находился в «Волчьем Логове», конвой из 2 новейших итальянских судов был остановлен у побережья Греции. Быстроходные транспорты «Франческо Барбаро» и «Унионе» 26 сентября вышли в Тобрук в сопровождении 6 эсминцев. Но в очередной раз повторились неприятные события. На следующий день конвой был обнаружен самолетом-разведчиком, который навел на него подводную лодку «Амбра». Одна из торпед попала в «Барбаро», и судно потеряло ход. Эсминец потащил его на буксире в Наварин, пока остальные охотились за подводной лодкой. В сумерках лейтенант Мэйдон сумел провести вторую атаку. «Барбаро» пошел на дно вместе с 547 тоннами бензина, 21 танком, 151 автомобилем и 1217 тоннами боеприпасов. Тем временем летчики начали охоту за вторым транспортом. Вскоре после полуночи «Унионе» получил попадание торпеды. Транспорт погрузился носом до самого флагштока, и экипаж остался на судне только по приказу командира эскорта. Был заведен буксир, и, в конце концов, «Унионе» добрался до Наварина. В подобных обстоятельствах это можно считать достижением. Но 3562 тонны бензина и 192 автомобиля в Африку не прибыли.