(до июля 1942 г. заказ № 389) После вступления в строй вошла в состав 34-го ДПЛ ВМР Куре. 31.12.1943 г. 34-й ДПЛ передали в непосредственное подчинение командующему Шестым флотом. В конце января 1944 г. Ro-39 вышла из Куре и направилась к атоллу Вотье, имея на борту (в палубных контейнерах) около 20 т продовольствия. 2.02.1944 г. в 10 милях к востоку от атолла Вотье ПЛ обнаружил и потопил американский ЭМ Walker. По другим данным, в конце 1943 г. корабль перешел на атолл Трук и в январе 1944 г. направился в центральную часть Тихого океана для борьбы с судоходством противника. 2.02.1944 г. в 10 милях к востоку от атолла Вотье Ro-39 обнаружил (при помощи гидроакустических приборов) и глубинными бомбами потопил со всем экипажем американский ЭМ Walker.
Ro-40
(до июля 1942 г заказ № 390) После вступления в строй вошла в состав Одиннадцатой эскадры Шестого флота. С 9-го по 22.01.1944 г. Ro-40 перешла на атолл Трук. 2.02.1944 г. она направилась к Маршалловым о-вам для борьбы с судоходством противника. 16.02.1944 г. в 45 милях к северо-западу от атолла Кваджелейн ПЛ была потоплена американскими ЭМ Phelps и ТЩК Sage.
Ro-41
(до июля 1942 г. заказ № 391) После вступления в строй вошла в состав Одиннадцатой эскадры Шестого флота. С 20.02. по 3.04.1944 г. Ro-41 патрулировала в центральной части Тихого океана. 7.09.1944 г. она вновь направилась в центральную часть Тихого океана. 3.10.1944 г. ПЛ (капитан-лейтенант Сиидзука) у о. Моротай атаковала американское соединение из двух АВ Fanshaw Вау и Midway в охранении четырех эскортных миноносцев. Из четырех выпущенных торпед, одна попала в эскортный миноносец Shelton, и он вскоре затонул. Три оставшиеся миноносца, ошибочно контратакуя, потопили американскую ПЛ Seawolf, а Ro-41 благополучно ушла от преследования. 11.10.1944 г. она перешла в район к востоку от Филиппин и 16.10.1944 г. возвратилась в Куре, где в ноябре 1944 г. на верфи флота установили РЛС тип 3 мод. 3 модиф. 1 и провели текущий ремонт механизмов, переделали ограждение рубки. 16.03.1945 г. ПЛ направилась к о. Окинава для спасения пилотов сбитых самолетов и борьбы с судоходством противника. 23.03.1945 г. в 320 милях к юго-западу от о. Окинава корабль был обнаружен и потоплен со всем экипажем американским ЭМ Haggard.
Ro-42
(до июля 1942 г. заказ № 392) После вступления в строй вошла в состав 34-го ДПЛ ВМР Куре. 31.12.1943 г. 34-й ДПЛ передали в непосредственное подчинение командующему Шестым флотом. В декабре 1943 г. Ro-42 перешла на атолл Трук. 10.01.1944 г. она направилась к Новым Гебридам для борьбы с судоходством противника. 14.01.1944 г. ПЛ (капитан-лейтенант Вада) потопила американский портовый ТН YО 159 и 8.02.1944 г. возвратилась на атолл Трук. 31.05.1944 г. корабль направился к атоллу Кваджелейн для борьбы с судоходством противника. 11.06.1944 г. к востоку от атолла Кваджелейн Ro-42 обнаружил и потопил со всем экипажем американский ЭМ Bangust.
Ro-43
(до июля 1942 г. заказ № 393) После вступления в строй вошла в состав Одиннадцатой эскадры ПЛ Шестого флота. 15.02.1944 г. Ro-43 вышла из Куре и направилась в центральную часть Тихого океана для борьбы с судоходством противника и 29.03.1944 г. пришла на атолл Трук. 9.06.1944 г. ПЛ направилась к Марианским о-вам для противодействия наступлению противника в центральной части Тихого океана и 8.08.1944 г. возвратилась в Куре. С 16.10. по 3.12.1944 г. и с 13.01. по 8.02.1945 г. корабль патрулировал в районе Филиппинских о-вов. В декабре 1944 г. в Куре на верфи флота смонтировали РЛС тип 3 мод. 3 модиф. 1. 15.02.1945 г. он направился к о. Иво Дзима для спасения пилотов сбитых самолетов и борьбы с судоходством противника. 21.02.1945 г. Ro-43 (лейтенант Цукитама) к юго-востоку от о. Иво Дзима атаковала конвой и торпедой повредила американский ЭМ Renshaw из состава его охранения. 26.02.1945 г. в 50 милях к западу от о. Иво Дзима ПЛ обнаружил и потопил самолет с американского эскортного АВ Anzio.