После смерти последней из сестер Ховрино было «отписано на государя», в связи с чем производилась тщательнейшая опись. Согласно этой описи, занесенной в отказные и отписные книги по городу Москве (книга № 32, листы 428–442), «в селе две церкви деревянные во имя Николая Чудотворца да придел великомученика Георгия, другая Знамения Богородицы да два придела, один св. Петра, Алексея и Ионы московских чудотворцев, другой Сергия Радонежского чудотворца». Вместе с описью церковного убранства упоминались и четыре отлитых бывшими владельцами колокола. «Да в селе два пруда, а в них рыба: караси и лини, да анбар мельничной, а в тем одни жернова на ходу со всяким мельнишным заводом. Да в том же селе двор вотчинников, а в нем внове хоромного строения; 5 житен на глухих подклетях, а в них семеры двери и те двери обиты полостью; крюки луженые белые подложены сукном красным, да в тех же хоромах 27 окошек с оконницы стекляны и с слюдяными и с ставни, и в одном житье два образа неокладных да деревянной крест прорезной, 2 стола, в том числе один писан; да постав, а в нем посуда медная и деревянная, стеклянная и глиненая, да в том же житье две шкатулки заперты; два житья заперты нутреным замком; а приказной человек и староста сказали: ключей у них нет; да две светлицы ветхи. Две избы поваренные, а меж ними поварня, а над ними сушило да погреб, на погребах сушило».
Но едва ли не самый большой интерес в ховринских документах этих лет представляет опись продуктов, хранившихся в погребах при поварне. «На погребице 3 кади меду, да две кади муки пшеничной за печатьми, соли 4 пуда, масло коровье гривенок с 30, котел медной ведер в 16, таган железной, да на полатях 7 четьи толокна, 16 четьи ржаной муки, 7 четьи круп овсяных, да соленых 74 полотка гусиных, да 60 полотков утиных, да русских сухих 149 кур, да старых провесных гусиных 28 полотков, говяжьих старых и новых 12 языков, 2 места говядины соленой; в погребе две бочки пива одна в 15 ведр, другая в 10 ведр да боченок меду». Остальное ховринское имущество состояло из коровьего денника, конюшни, конюшенной избы, скотного двора, пяти житниц с хлебом и двадцати восьми крестьянских дворов. Почти сразу после составления описи Ховрино указом Петра I было передано в том же 1700 году Ф. А. Головину.
О переходе Ховрина к Головиным сообщали не вызывающие никаких сомнений документы, однако точка зрения, установившаяся у прежних историков, была иной. Тот же А. Барсуков в третьем томе своего труда о Шереметевых допускал ошибку в происхождении Ховрина среди шереметевских владений. Из-за неправильного прочтения хранившегося в архиве С. Д. Шереметева под № 158 акта исследователь считал село приданым не жены, но матери В. Б. Шереметева и соответственно высказывал убеждение, что владелицей села должна была быть одна из Головиных. А. Барсуков не составлял исключения среди историков Москвы, считавших и само село, и его название связанными с фамилией Ховриных-Головиных. Разве не могла одна из Головиных принести село в приданое своему мужу Шереметеву или Третьякову? Тем неожиданнее появившееся в некоторых справочных изданиях последних лет утверждение, что известно Ховрино с XV века, а своим названием обязано некоему торговому гостю, сурожанину — выходцу из Крыма Г. С. Сафарину по прозвищу Ховра. Отсутствие документальных подтверждений этой версии заставляет обратиться к традиционному пути — идти от Головиных, тем более что ни в каких списках служилого дворянства, ни в боярских книгах крымского гостя и его потомков не было.
В документах, связанных с Москвой, предки Головиных появляются вскоре после Куликовской битвы. О выехавшем в последнем десятилетии XIV века на службу к московскому князю греке Степане Васильевиче ходили разные толки. Одни называли его князем, хотя наследники Ховры подобным титулом не пользовались. Для других он был владельцем Балаклавы и Мангупы. Но все сходились на том, что «нововыезжий» грек располагал очень значительными средствами, почему тут же и занял видное место при великом князе. Существовали разночтения и в отношении его прозвища: Ховра, Хомра, Комра. Первый вариант имел русский перевод: ховра — свинья, неряха, ховрить — грязнить, неряшничать. Родословная книга и вовсе утверждала прозвище за сыном Степана — Григорием. Григорий Степанович Ховра был известен тем, что построил в Симоновом монастыре каменную соборную церковь Успения, одну из самых больших в Москве после кремлевских соборов. Строительство закончилось в 1405 году, и с того же времени монастырь стал усыпальницей семьи.