В 1976 было 160 больничных учреждений на 16 тыс. коек, т. е. 11,3 койки на 1 тыс. жителей (58 больниц на 5,1 тыс. коек, т. е. 4,8 койки на 1 тыс. жителей, в 1940). Внебольничную помощь оказывали 241 амбулаторно-поликлиническое учреждение, 21 диспансер; функционировали 58 женских консультаций, 88 детских поликлиник и амбулаторий. Создана сеть санаторно-противоэпидемических учреждений, в том числе 23 санаторно-эпидемиологические станции и дезинфекционная станция. К 1 января 1978 функционировали 215 аптек и 281 аптечный пункт. В лечебно-профилактических учреждениях работали (1976) 5.5 тыс. врачей, т. е. 1 врач на 264 жителей (1,1 тыс. врачей, т. е. 1 врач на 1 тыс. жителей, в 1940) и 14,8 тыс. лиц среднего медицинского персонала (1,5 тыс. в 1940). Медицинские кадры готовят медицинский факультет Тартуского университета и 3 медицинских училища (гг. Таллин, Тарту, Кохтла-Ярве). Проблемы медицинской науки, кроме медицинского факультета, разрабатывают 2 научно-исследовательских института: экспериментальной и клинической медицины; эпидемиологии, микробиологии и гигиены, а также научно-исследовательская лаборатория металлоостеосинтеза, имеющая клинику. С 1958 издается журнал «Ныукогуде Ээсти тервисхойд» («Здравоохранение Советской Эстонии»).
Курорты: климатический и грязевой —
Расходы на здравоохранение и физкультуру в 1976 составили 70,1 млн. руб. (5,5 млн. в 1945).
По территории Э. проходит 7 туристских маршрутов всесоюзного и 10 республиканского значения. Наиболее популярные места отдыха и туризма — Таллин, Тарту, Пярну, Выру, Нелиярве, Отепя, рр. Нарва, Эмайыги, Пирита, озера Чудское, Кубия, Выртсъярв. Развит пешеходный, лыжный, водный, вело-, мото-, автотуризм. В 1976 имелось свыше 20 различных турбаз, около 16 клубов туристов, 6 экскурсионных бюро. В 1977 Э. посетило около 1 млн. туристов, в том числе около 133 тыс. иностранных из 41 страны.