Заметим в скобках, что столь тесной связи с прусским королевским домом, как у иоаннитов, у Тевтонского (Немецкого) Ордена — вопреки измышлениям позднейших фальсификаторов истории! — не существовало никогда! Комменды и Герренмейстер бранденбургских иоаннитов верно несли военную службу королю Пруссии в Силезских войнах и в Семилетней войне. Тем не менее, после гибели комтура бранденбургских иоаннитов принца Луи Фердинанда Прусского от палаша наполеоновского кирасира в бою с французами под Заальфельдом и разгрома прусских армий под командованием двух других иоаннитских комтуров — герцога Брауншвейгского и князя фон Гогенлоэ — Наполеоном I Бонапартом под Иеной и Ауэрштедтом в роковом для Пруссии 1806 году, в условиях острейшей нехватки финансовых средств, король Фридрих Вильгельм Ш был вынужден 30 октября 1810 года распорядиться о секуляризации всех владений церкви, монашеских и духовно-рыцарских Орденов. Тем самым Орден иоаннитов лишился источников к существованию в Бранденбургской марке.
Королевским эдиктом от 23 января 1811 года полномочия Герренмейстера и капитула иоаннитов перешли к прусской короне и были аннулированы. Учрежденный вместо упраздненного Бальяжа Бранденбургского 23 мая 1812 года «Королевский Прусский Орден иоаннитов» (Koeniglich Preussischer Johanniter Orden) стал простым объединением бывших членов Бранденбургского бальяжа, как физических лиц, чем-то в роде «закрытого клуба ветеранов», не занимавшегося никакой практической деятельностью. Во главе «Королевского Прусского Ордена иоаннитов» стоял принц дома Гогенцоллернов, в течение последующих 40 лет носивший титул «Гроссмейстера» («Великого Магистра»). На протяжении всего периода существования «Королевского Прусского Ордена» иоаннитский крест оставался формально включенным в систему прусских государственных наград, занимая в наградной иерархии место после ордена Красного Орла, хотя реально новых награждений им не проводилось.
По прошествии сорока лет Орден иоаннитов был восстановлен в Пруссии как рыцарский (но уже не духовно-рыцарский) институт, вернувшийся к своим первоначальным целям христианской благотворительности и милосердия — помощи больным и убогим. Вскоре прусский Орден иоаннитов (по старой памяти, именовавшийся также «Бранденбургским бальяжем») содержал уже десятки больниц и странноприимных домов. Его главой снова стал не «Гроссмейстер», а Герренмейстер, а верховным протектором — прусский король (являвшийся с 1871 года, года объединения Германии, также германским императором).
Члены прусского Ордена иоаннитов подразделялись на:
1) коммендаторов и почетных коммендаторов, входивших, наряду с «Капитаном Ордена (Орденсгауптманом)», то есть старейшим из рыцарей Ордена (Ordenshauptmann), и орденскими чиновниками, в Орденский Капитул под председательством Герренмейстера;
2) «рыцарей (по) справедливости» (Rechtsritter), приносивших при вступлении в Орден иоаннитов уставные обеты и принимавшихся в Орден с соблюдением всех необходимых формальностей, включая инвеституру, посвящение в рыцари троекратным ударом меча в Зонненбурге и т. п.;
3) «рыцарей чести», или «почетных рыцарей» (Ehrenritter).
Таким образом, в отличие от преимущественно католического (Мальтийского) Ордена Святого Иоанна Иерусалимского, структура преимущественно протестантского прусского рыцарского Ордена Святого Иоанна Иерусалимского Госпиталя была гораздо проще — в нем не существовало степеней капитулярных и конвентуальных бальи, бальи Большого Креста, бальи, «рыцарей милосердия» (принимавшихся в Орден «из милости», хотя они не удовлетворяли требованиям орденского Устава), «магистральных рыцарей» (принимавшихся в Орден по прямому указанию Великого Магистра), «обетных рыцарей», «облатов», донатов (жертвователей) и т. д.
Никто из прусских иоаннитов не мог стать «рыцарем (по) справедливости», не будучи евангелического (лютеранского) исповедания и не пробыв предварительно установленное число лет членом Ордена иоаннитов в степени «рыцаря чести (почетного рыцаря)».
Вопрос о приеме новых членов решался Орденским капитулом; при этом играли важную роль знатность рода, безупречный образ жизни, возраст (не моложе 30 лет) и социальное положение. Каждый «рыцарь чести» при вступлении в прусский Орден иоаннитов уплачивал вступительный взнос в сумме 1000 марок, после чего уплачивал ежегодный взнос в размере 60–90 марок, но уже не в центральную орденскую кассу, а в кассу того Орденского товарищества (Ordens-Genossenschaft), в которое входил по месту жительства. Орден имел 15 таких товариществ во всех прусских провинциях, а также в других германских землях — Вюртемберге, Мекленбурге, Гессене, Саксонии и Баварии.
По состоянию на 1 января 1905 года в прусском Ордене иоаннитов (Бальяже Бранденбургском) состояли:
1) Протектор — император Вильгельм II Гогенцоллерн,
2) Герренмейстер — принц Альбрехт Прусский,
3) «Орденский капитан (орденсгауптман)»,
4) 18 коммендаторов,
5) 4 почетных коммендатора (эренкоммендатора, или «коммендатора чести»),
6) 973 «рыцаря (по) справедливости»,