Отдельными 2-цилиндровыми воздушными насосами системы Блайка конденсат (смесь отработанного пара и воды) подавался в подогреватель (экономайзер), где превращался в котельную питательную воду. Отсюда достаточно нагретая и очищенная фильтром питательная вода самотёком поступала в расположенную под МО сборную цистерну (сливной ящик). В сливном ящике остывшая вода посредством нагревательного змеевика снова могла быть подогрета. Отсюда её котельным питательным насосом подавали в котлы. Если паровая машина была не в работе, то воду из конденсатора насосом подавали в подогреватель.
Требуемый для работы паровых машин пар вырабатывался как применяемыми ещё на броненосцах типа «Брандербург» уже устаревшими к тому времени огнетрубными котлами цилиндрического типа с обратным ходом пламени, так и более современными, водотрубными котлами морского типа (системы Шульца) или типа Торникрофта. В топках котлов цилиндрического типа сжигали как уголь, так и смесь угля с гудроном.
Число котельных отделений (КО) и кочегарок, а в них число и тип котлов на кораблях постройки разных верфей были различными. Общим для всех кораблей по расположению было размещение VII-го (торпедного) основного отсека между двумя КО. задним и расположенным ближе к носу. Все КО делились продольной переборкой по ДП пополам на отдельные кочегарки. Кроме естественной тяги в котлах можно было применять искусственную тягу (наддув). Высота дымовых труб над ватерлинией составляла 22 м.
На броненосцах «Кайзер Фридрих III» и «Кайзер Вильгельм И» постройки имперской верфи в Вильгельмсгафене пар вырабатывался двенадцатью котлами. Котлы разместили в трёх последовательно расположенных КО, разделенных по ДП продольной переборкой пополам на шесть отдельных кочегарок с различным числом котлов.
Котлы каждой кочегарки подавали пар по своему паропроводу. Причём все шесть паропроводов, проходящие по три с каждой стороны центрального коридора, подключались к общему бронзовому переходнику, установленному на 36 шп. В свою очередь, этот переходник отдельным паропроводом соединялся с каждой паровой машиной. Паропроводы оборудовали запорными клапанами и клиикетами. Такая же система подключения паропроводов существовала на остальных трёх кораблях, только там проходило по четыре паропровода.
Котельные отделения полностью занимали: заднее – Vl-ii (36-45 шп.. длиной 10.8 м), среднее – VIII-й (48-57 шп., длиной 10,8 м) и переднее – 1Х-й основные отсеки (57-68 шп., длиной 13,2 м). Общая длина КО с примыкающими к ним угольными ямами и бункерами составляла 34,8 м или 30,2 % длины корпуса корабля между перпендикулярами по сравнению с, соответственно, 32,4 м. те же 30% на броненосцах типа «Бранденбург». Заднее КО имело выход дымовых газов на заднюю дымовую трубу, остальные два – на переднюю.
На броненосце «Кайзер Фридрих III» в заднем и среднем КО установили по два на каждом борту (всего восемь, все поперечно расположенные, 32 топки) огнетрубных котла цилиндрического типа, в переднем также по два на каждом борту водотрубных котла типа Торпикрофта с односторонней топкой (всего 8 топок), вырабатывающие пар с рабочим давлением 12 кгс/кв.см. Поверхность нагрева составляла 3390 кв.м.
На броненосце «Кайзер Вильгельм II» в заднем и среднем КО также установили по два на каждом борту (всего восемь, все поперечно расположенные, 32 топки) огнетрубных котла цилиндрического типа, в переднем также по два на каждом борту в.одотрубных котла морского типа (системы Шульца) с односторонней топкой (всего четыре, 8 топок), вырабатывающие пар с рабочим давлением 12 кгс/кв.см. Поверхность нагрева составляла 3560 кв.м.
Установленные на броненосцах «Кайзер Фридрих III» и «Кайзер Вильгельм II» огнетрубные котлы цилиндрического типа с обратным ходом пламени, вырабатывающие пар с рабочим давлением 12 кгс/кв.см., с диаметром корпуса 4,24 м и длиной 3,29 м, были изготовлены из листовой стали, водяная цистерна имела объём 19 куб.м, паросборник 6,83 куб.м.
Установленные на броненосце «Кайзер Фридрих III» водотрубные котлы типа Торникрофта длиной 3,1 м состояли из трёх нижних, горизонтально расположенных, водяных цилиндров диаметром 500 мм и одного верхнего диаметром 1100 мм. Последний являлся паросборником и соединялся с тремя нижними водяными цилиндрами 1212, облуженными кипятильными трубами (38 рядов) внутренним диаметром 28 мм с толщиной стенки 2 мм. Поверхность нагрева составляла 370 кв.м, колосниковой решётки 6,4 кв.м. Высота дымовой трубы от поверхности колосниковой решётки составляла 27,2 м. Они имели следующие показатели: 150,4 л.с./кв.м колосниковой решетки, 3,85 л.с./ кв.м поверхности нагрева и сжигали 58,18 кг угля/л.с.час.