В Нижнем долго обсуждали, кого поставить воеводой над войском. Минин был человеком многоопытным и мудрым. О неудаче в Москве знал в подробностях. Считал, всему виной множество начальников, каждый из которых мнил себя главным, тянул одеяло на себя. Главный воевода должен быть один, и ему беспрекословно подчиняться всё войско. Таким требованиям отвечали не все служивые князья. Одни не обладают полководческими талантами, другие замараны служением Тушинскому вору, а третьи, как Андрей Васильевич Голицын, убиты. Поляки казнили князя с началом народного восстания, он в то время сидел в узилище. Получалось, по всем статьям подходит Пожарский. Не имея войска, смог организовать оборону на Сретенке. С Тушинским вором не связан, молод, осторожен и ни одной битвы не проиграл. К Пожарскому отправилось посольство из Нижнего. Князь принял переговорщиков настороженно, сослался на раны, согласия своего возглавлять войско не дал.
В Мугреево отправился сам Минин. Долго беседовали с глазу на глаз староста и князь. Какие доводы привёл Минин, неизвестно, но князь дал согласие.
Через время из Нижнего прибыло посольство. Во главе дворянин Ждан Болтин, духовную власть представлял Печерский архимандрит Феодосий, а с ним выборные из посадских людей. Князь выразил согласие возглавить войско и поход, но потребовал, чтобы в «товарищах» у него был Кузьма Минин. Это противоречило традициям. Минин – человек невоенный. Посольство согласилось, да и выбора у них не было.
Князь разослал гонцов, к нему стало стекаться ополчение из Дорогобужа, Смоленска. К Нижнему Пожарский уже подъехал в сопровождении небольшого войска. Князь понимал, что основу, ядро рати должны составлять профессионалы-стрельцы, служилые дворяне. Пожарский принципиально не хотел брать наёмников – дорого и могут предать в любой момент. Для начала Пожарский устроил смотр. Войско выглядело плохо – кони далеко не у всех, оружие разномастное, одеты скверно. А как ратнику воевать, если на ногах лапти, а не добротные сапоги? Князь выставил нижегородцам требование – оснастить войско всем необходимым. Минин кряхтел, но требование исполнил.
Поступили сведения, что казаки, признавшие «псковского ворёнка», собираются идти на Ярославль. А город этот, стоявший на водных и сухопутных путях, мыслил сделать местом сбора Пожарский. К Ярославлю на рысях пошёл отряд под командованием двоюродного брата князя, Дмитрия Лопаты-Пожарского. Лопата успел занять город до подхода казаков. Те в бой вступать не решились.
Главное войско во главе с Пожарским выступило из Нижнего 23 февраля 1612 года. Шли по берегу Волги, неспешно, поскольку по пути присоединялись ополчения из других городов. И не везде воеводы городские встречали рать доброжелательно. Первыми к войску присоединилась рать из Балахны с воеводой Матвеем Плещеевым, соратником Прокопия Ляпунова. В Юрьеве примкнули служилые татары со своим мурзой. В Кинешме – народное ополчение. А костромской воевода Иван Шереметев оказал сопротивление, запер городские ворота. Посадские люди ворота открыли, дрекольями и вилами загнали воеводу с несколькими ратниками в собственный дом воеводы да разошлись. Поджечь хотели, а воеводу до смерти прибить. Пожарскому пришлось спасать Шереметева от народного гнева, вывез из города и отпустил восвояси.
Ярославский воевода Андрей Куракин, хотя и признал Семибоярщину и был ею на пост воеводы поставлен, уже был в курсе, как Шереметева едва на вилы не посадили. А потому встретил Пожарского с войском хлебом и солью, по обычаям. Воинство частично в городе разместили, частично в лагере, за посадами.
Дворяне и знатные люди в Ярославле сформировали «Совет всей земли», свои приказы. Князь за время остановки очищал близлежащие земли, посылал отряды. А ещё формировал армию. Ополчение разбил на сотни, во главе служилые дворяне, и обязательно в каждой сотне опытные ратники – дети боярские, стрельцы. Дабы не дрогнули в бою, не побежали. Хотя ополчение из народа настроено было биться всерьёз. Безвременье и безвластие надоели, а пуще защиты от государства нет. Казаки пришли в село – грабят, люди «псковского ворёнка» – грабят, а ежели ляхи нагрянули, так, кроме грабежей, ещё и бесчинствуют, убивают за косой взгляд, либо поклон не до земли, а поясной. Чванливы поляки, высокомерны и жестоки, ополчили против себя всех.
Недалеко от Ярославля засели казаки, представляли угрозу. Направленный в мае 1612 года Лопата-Пожарский казаков разгромил, остатки бежали. Почти сразу прибыла делегация из Переславля-Залесского с жалобами на утеснения от казаков. Пожарский вынужден был послать в город отряд Ивана Наумова.