Работник имеет право оспаривать результат аттестации в комиссии по трудовым спорам (КТС) или в судебном порядке. Комиссия по трудовым спорам является органом по рассмотрению индивидуальных трудовых споров, возникающих в организациях, за исключением споров, по которым ТК РФ и иными федеральными законами установлен другой порядок их рассмотрения (ч. 1 ст. 385 ТК РФ). Если в организации нет комиссии по трудовым спорам, то спор разрешается непосредственно судом. КТС не рассматривает вопрос увольнения работника. Индивидуальный трудовой спор рассматривается комиссией по трудовым спорам, если работник самостоятельно или с участием своего представителя не урегулировал разногласия при непосредственных переговорах с работодателем (ч. 3 ст. 385 ТК РФ). КТС обязана рассмотреть трудовой спор в 10-дневный срок. Разбирать дело в отсутствие работника допускается лишь с его письменного согласия. Если работник не явился на заседание, рассмотрение спора откладывается. При вторичной неявке работника без уважительных причин комиссия может вынести решение вообще не рассматривать заявление работника. Однако это не лишает работника права обратиться в КТС с новым заявлением.
В комиссию по трудовым спорам работник может обратиться в 3-месячный срок с момента проведения аттестации. Решение комиссии по трудовым спорам в 3-дневный срок должно быть исполнено работодателем.
В случае неисполнения решения комиссии в установленный срок работнику выдается удостоверение, являющееся исполнительным документом. Решение КТС работник может в течение 10 дней оспорить в суде.
Суд рассматривает заявления работника, если тот не согласен с решением комиссии по трудовым спорам или обратился в суд, минуя комиссию. При обращении в суд с иском по требованиям, вытекающим из трудовых отношений, работники освобождаются от оплаты пошлин и судебных расходов (ст. 393 ТК РФ). При оспаривании порядка проведения аттестации, поставленных вопросов или сделанных выводов работник имеет право обратиться в суд за разрешением индивидуального трудового спора в течение 3 месяцев со дня, когда он узнал или должен был узнать о нарушении своего права. В случае возникновения спора об увольнении в связи с несоответствием занимаемой должности или выполняемой работе, выяснившемся в результате аттестации — в течение 1 месяца со дня вручения ему копии приказа об увольнении либо со дня выдачи трудовой книжки. В случае оспаривания итогов аттестации, выводов аттестационной комиссии дело может рассмотреть мировой судья (и. 6 ч. 1 ст. 23 Гражданского процессуального кодекса РФ от 14 ноября 2002 г. № 138-ФЗ (далее — ГПК РФ) (с изм. и доп. от 21 июля 2005 г.)). Если оспаривается не только результат аттестации, но и увольнение по результатам аттестации — подобный спор подведомственен районному суду.
Решение о восстановлении на работе незаконно уволенного работника, о восстановлении на прежней работе работника, незаконно переведенного на другую работу, подлежит немедленному исполнению. При задержке работодателем исполнения такого решения орган, принявший решение, выносит определение о выплате работнику за все время задержки исполнения решения среднего заработка или разницы в заработке (ст. 396 ТК РФ).
При обнаружении в вопросном листе конкретных вопросов, ответы на которые работник, занимающий определенную должность, не обязан знать, может быть назначена повторная аттестация. Ответы на вопросы, по которым у специалистов имеются расхождения во мнениях, работник может обосновать с использованием научных публикаций или привлечения в процесс квалифицированных специалистов в качестве сведущих свидетелей. В основе решения аттестационной комиссии могут лежать доказательства, представленные непосредственным руководителем аттестованного (докладные записки непосредственного руководителя и другое), работник же может представить другие доказательства, свидетельствующие, например, о том, что приказ начальника не был исполнен в связи с его незаконностью, опасностью для производства или по другим уважительным причинам; выработка работником продукции соответствует или превышает нормы выработки; технология, по которой работник обнаружил слабые знания, является новаторской и только еще внедряется на производстве. Решение аттестационной комиссии в суде является просто одним из видов доказательств. Оно нуждается в тщательной проверке, и суд вправе при необходимости дать оценку заключению аттестационной комиссии с учетом других доказательств, имеющихся в деле. Работник может представлять и иные доказательства, подтверждающие его профессиональную пригодность.
Аттестованный работник вправе требовать в судебном порядке проведения повторной аттестации независимой экспертной комиссией. Часто в подобных ситуациях работника восстанавливают на работе. Работник может потребовать оплату вынужденного прогула за все время судебной тяжбы, а также компенсацию морального вреда, особенно если кто-нибудь из членов комиссии или руководитель (организации или непосредственный) допустил по поводу результатов аттестации работника прилюдные некорректные высказывания.