В Институте вирусологии имени Д. И. Ивановского проводилась огромная работа по подготовке кадров для научных и практических подразделений академических институтов и медицинских учреждений. Для молодых ученых были организованы стажировки, а также аспирантура и докторантура. Многие из аспирантов и стажеров Института вирусологии впоследствии стали известными учеными, академиками АМН СССР (позже РАМН) и руководителями академических институтов. Среди них особенно яркими фигурами являются Б. Ф. Семенов (Институт вакцин и сывороток им. И. И. Мечникова), С. Г. Дроздов (Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М. П. Чумакова), В. А. Лашкевич (Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М. П. Чумакова), С. Г. Дзагуров (Институт стандартизации и контроля медицинских биологических препаратов им. Л. А. Тарасевича), О. Г. Анджапаридзе (Институт вирусных препаратов, который после смерти ученого носит его имя). В этот же период исследования по кори возглавлял П. Г. Сергиев, одновременно оставаясь директором Института медицинской паразитологии и тропической медицины им. Е. И. Марциновского, а О. В. Бароян, который был ученым секретарем Института вирусологии, позже был назначен директором ИЭМ им. Н. Ф. Гамалеи.
За первые два десятилетия работы специалисты института провели целый ряд важнейших исследований, в которых изучили физико-химические свойства вирионов[16]
и их компонентов у разных вирусов, выявили механизмы проникновения вирусов в клетку организма и способы сохранения генетического материала целого ряда РНК-содержащих вирусов при острых и хронических инфекционных заболеваниях, а также разработали и испытали новые принципы рациональной и нетрадиционной терапии вирусных инфекций. За эти годы Институт вирусологии им. Д. И. Ивановского АМН СССР стал ведущим научным вирусологическим учреждением СССР по проблемам общей и молекулярной вирусологии и по многим направлениям частной вирусологии. Результаты научных разработок в области генной инженерии, создания новых векторных систем и новых методов генетического клонирования информации отдельных вирусных генов, опытов по клеточной инженерии и разработок новых тест-систем для выявления маркеров многих вирусных инфекций человека и животных выдвинули этот научный центр на ведущие позиции в вирусологической науке.В 1987 году директором Института вирусологии был избран академик АМН СССР (позже РАМН, сейчас РАН) Д. К. Львов, который возглавлял институт на протяжении 25 лет. Для нашей страны это были годы серьезных экономических и политических преобразований: перестройка и распад СССР вызвали серьезные экономические проблемы, которые стали большой угрозой для российской науки в целом и вирусологии в частности. Но даже в такое сложное время Д. К. Львов сумел не только сохранить институт, но и создать в нем новые научные подразделения, привлечь для работы талантливых молодых ученых и воспитать достойную смену знаменитым советским вирусологам старшего поколения. Академик Д. К. Львов основал и развил новое научное направление — молекулярная экология и популяционная генетика вирусов, создал научно обоснованную концепцию о циркуляции отдельных вирусов в различных климатогеографических поясах мира и разработал уникальный метод экологического зондирования территории России, который позволил открыть и изолировать в природных очагах более 60 новых вирусов.
В настоящее время директором Института вирусологии им. Д. И. Ивановского является доктор биологических наук, профессор А. В. Пронин. Ученые института занимаются актуальными проблемами вирусных заболеваний, иммунологии инфекционных заболеваний человека и животных, созданием новых иммуномодулирующих препаратов для борьбы с вирусными инфекциями и разработкой методологии оценки благополучия окружающей среды. Одним из важнейших направлений деятельности Института вирусологии являются исследования по биологической безопасности и связанной с ней проблемой новых и вновь возникающих инфекций, способных вызвать эпидемические ситуации, а также исследование инфекций, вызванных вирусами с высокой степенью изменчивости генома. Целью этих исследований является выявление эпидемических штаммов вируса гриппа, прогнозирование и расшифровка вспышек эпидемий и пандемий, вызванных высокопатогенными вирусами гриппа на территории России. Кроме этого проводятся работы по изучению генотипов вирусов гриппа, гепатита С, ВИЧ и арбовирусов.