В последующие десятилетия коллектив института создал технологии производства целого ряда вирусных вакцин. Промышленное производство большинства разработанных вакцинных препаратов осуществлялось на собственных производственных мощностях института (Предприятии по производству бактерийных и вирусных препаратов), и вакцины производства ИПВЭ поставлялись в сотни стран мира. В институте появились новые лаборатории, оснащенные самым современным оборудованием, были построены и сданы в эксплуатацию новые здания для научных и производственных подразделений, а клиническое отделение института перебазировалось на территорию Первой городской инфекционной больницы. В лабораториях молекулярной биологии вирусов, генетики, цитопатологии, интерферона, тропических вирусов, геморрагических лихорадок и других вирусных инфекций специалисты занимались фундаментальными исследованиями и созданием вакцинных препаратов для борьбы с различными вирусными инфекциями. Вскоре Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов АМН СССР стал одним из ведущих в СССР центров медицинской вирусологии, известным далеко за пределами страны.
За советский период деятельности института в его стенах выросла целая плеяда ученых-вирусологов. Среди них был академик АМН СССР и РАН Сергей Григорьевич Дроздов — ученик и преемник М. П. Чумакова, который руководил институтом с 1972 по 2006 год. Мировую известность за свои работы в области вирусологии получили многие сотрудники института, в том числе член-корреспондент АМН СССР и действительный член РАМН М. С. Балаян — первооткрыватель вируса-возбудителя гепатита Е, академик РАН В. А. Лашкевич — автор монографии «Научные основы производства полиомиелитных вакцин», член-корреспондент АМН СССР М. К. Ворошилова — крупный специалист по энтеровирусным инфекциям, член-корреспондент РАН М. И. Михайлов — известный специалист по вирусным гепатитам, а также член-корреспондент РАН В. А. Агол — специалист по молекулярной и клеточной биологии, генетике и молекулярной эпидемиологии РНК-содержащих вирусов, основатель научной школы. Кроме них в Институте полиомиелита в разные годы работали и другие ученые, в том числе будущие руководители крупных советских и российских научных учреждений в области вирусологии и эпидемиологии.
В 1994 году, вскоре после смерти М. П. Чумакова, Институту полиомиелита и вирусных инфекций было присвоено имя его основателя, и он стал называться ИПВЭ им. М. П. Чумакова.
На протяжении последующих десятилетий ИПВЭ им. М. П. Чумакова активно развивался. Специалисты института решали важнейшие задачи в области вирусологии, занимались фундаментальными научными исследованиями, разрабатывали и испытывали новые вакцинные препараты, потребность в которых возрастала с каждым годом. Для обеспечения растущей потребности российского здравоохранения в современных биофармацевтических препаратах нужно было увеличить объемы производства продукции и ускорить процесс введения в обращение инновационных разработок, и в связи в этим назрела необходимость реорганизации деятельности учреждения.
В 2014 году российский ученый, специалист в области промышленной биотехнологии, вакцинологии и организации фармации Айдар Айратович Ишмухаметов выступил с инициативой создания на базе ИПФЭ им. М. П. Чумакова единого научного центра. Он должен был объединить в единое целое научные, технологические и производственные аспекты создания и введения в обращение оригинальных инновационных отечественных иммунобиологических препаратов, таких как вакцины для профилактики полиомиелита, клещевого энцефалита, желтой лихорадки и некоторых других вакцин, включенных в национальные и региональные календари профилактических прививок. А. А. Ишмухаметов предложил концепцию развития центра. Так в 2016 году на базе ИПВЭ им. М. П. Чумакова (института) и ПИПВЭ им. М. П. Чумакова (предприятия) был создан Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М. П. Чумакова РАН (ФГБНУ «ФНЦИРИП им. М. П. Чумакова РАН»), директором которого назначили Айдара Айратовича Ишмухаметова. Была проведена реорганизация бизнес-процессов и введены принципы управления качеством на биофармацевтических предприятиях, вошедших в состав центра. Это позволило в кратчайшие сроки полностью модернизировать предприятие, получить сертификат GMP, решить задачи импортозамещения, разработать новые препараты для борьбы с вирусными инфекциями и провести доклинические и клинические исследования новой продукции. В результате был увеличен объем выпускаемой продукции и экспорт биофармацевтических препаратов, выпускаемых Центром.