В настоящее время ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» является одним из крупнейших научно-исследовательских учреждений в области вирусологии в России и в мире. Основной целью фундаментальных научно-исследовательских работ, которые проводятся в этом учреждении, является получение новых научных знаний в области эпидемиологии, молекулярной биологии, вирусологии, бактериологии, генной инженерии и биотехнологии, а также экологии и биологической безопасности. Прикладные исследования Центра направлены на разработку эффективных средств и методов профилактики, лечения и диагностики инфекционных заболеваний, а также на создание и совершенствование биотехнологий промышленного производства средств противодействия инфекционным патогенам.
Кроме разработки и внедрения в практику российского здравоохранения диагностических, лечебных и профилактических препаратов для борьбы с опасными вирусными инфекциями важнейшими задачами Центра являются фундаментальные исследования возбудителей особо опасных и социально значимых вирусных инфекций и обеспечение постоянной готовности к осуществлению диагностики особо опасных инфекционных агентов — возбудителей заболеваний. В структуре Центра также есть экспедиционные группы для сбора проб в местах вспышек инфекционных заболеваний, в том числе в очагах вспышек гриппа птиц. По всем основным направлениям своей деятельности Центр активно сотрудничает с различными научными и научно-производственными учреждениями РАН, РАМН, РАСХН, Роспотребнадзора, Минздравсоцразвития и МЧС России. В рамках международного партнерства ГНЦ ВБ «Вектор» работает с ведущими зарубежными научными центрами и активно расширяет сотрудничество со странами СНГ в области мониторинга и диагностики вирусов гриппа.
С 1997 года на базе «Вектора» функционирует Сотрудничающий центр Всемирной организации здравоохранения по диагностике ортопоксвирусных инфекций и музей штаммов и ДНК вируса натуральной оспы. Таких центров в мире существует всего два — второй находится в Атланте (США). В этих двух центрах хранятся коллекции штаммов вируса натуральной оспы, которые необходимо сохранять и изучать для научных целей. Никто в мире, кроме этих двух центров, не имеет права работать с вирусом натуральной оспы. В 1986 году, через шесть лет после официального объявления о полном искоренении вируса натуральной оспы во всем мире, ВОЗ рекомендовала уничтожить все коллекции этого вируса и посчитала правильным оставить для научных целей только две коллекции — в научных центрах Кольцово (в ГНЦ ВБ «Вектор») и Атланты (США), что является важным подтверждением международного признания российского научно-исследовательского учреждения.
Для нашей страны чрезвычайно важен тот факт, что российское научно-исследовательское учреждение имеет право работать с вирусом оспы. Специалисты отмечают, что сегодняшняя ситуация, сложившаяся относительно натуральной оспы, является спокойной и тревожной одновременно. С одной стороны, в 1980 году ВОЗ объявила о полном искоренении этого заболевания на всей планете, что является очень позитивным фактом: теперь никто не болеет оспой и не является переносчиком этого смертельного вируса. Но с другой стороны, после полной ликвидации натуральной оспы с 1980 года во всем мире прекращена вакцинация против этого заболевания и резко сокращен объем исследований, направленных на разработку новых диагностических и лечебных препаратов и противооспенных вакцин. Специалисты считают такую ситуацию довольно драматичной, потому что вся популяция человечества, рожденная после 1980 года и не прошедшая вакцинацию, не защищена от природной вспышки заболеваний, подобных оспе, а вакцина от оспы, которая использовалась раньше, в настоящее время уже непригодна для массовой вакцинации из-за высокой частоты поствакцинальных осложнений. Таким образом, крайне важно иметь новую, более безопасную и более эффективную вакцину против оспы и лекарственные препараты с различными механизмами воздействия для лечения этого опасного инфекционного заболевания. ГНЦ ВБ «Вектор» активно занимается данным направлением и разрабатывает целый ряд альтернативных вакцин и лечебных препаратов против оспы.
В ГНЦ ВБ «Вектор» работают высококвалифицированные специалисты в области вирусологии, молекулярной биологии, генной и клеточной инженерии, эпидемиологии и биотехнологии. Около 10 % численного состава сотрудников этого учреждения составляют кандидаты и доктора наук. Центр обладает прекрасной лабораторно-экспериментальной базой, оснащенной самым современным оборудованием, которая позволяет проводить исследования с патогенными для человека и животных вирусами в условиях полной безопасности для персонала и окружающей среды. Специалисты этого учреждения участвуют в оперативных исследованиях образцов и подтверждении диагнозов при вспышках заболеваний неясной этиологии на всей территории России.