Там он монашествовал с 1905 по 1909 год, когда был рукоположен и стал иеромонахом. Сразу после рукоположения он был приглашен у Успенскую церковь Туркестанского архиерейского дома, что находилась в городе Верном. Приглашение туда он получил, в частности, для развития церковной музыки. Вместе с Серафимом он отправился в дорогу. Прощаясь с Феогностом и другими иеромонахами, он не знал, что судьба еще раз сведет его с ними и крепко свяжет в истории православия.
Но не только музыкой занимался отец Анатолий. К моменту его приезда в город Верный, там была основана Иверско-Серафимовская женская община, которая в 1910 году была обращена в женский общежительный монастырь. Одним из самых активных пастырских попечителей общины стал отец Анатолий.
Однако уделять все внимание окормлению насельниц монастыря он не мог. В этот же период вместе с Серафимом он построил скит на Сопке Мохнатой, где разбил цветник. За свой подвижнеческий подвиг в 1912 году отец Анатолий был награжден правом ношения набедренника.
Когда в 1913 году стало ясно, что плохо организованный женский монастырь дает все больше сбоев, духовная жизнь в нем начала угасать, по инициативе отца Серафима иеромонахи забрали своих духовных чад из монастыря в скит на Монатую сопку, а сами отправились искать место для нового скита.
С 1916 года отец Анатолий был поставлен управлять архиерейским хором в Вознесенском Кафедральном соборе города Верный. Но и свой скит в Аксайском ущелье он не забывал, проводя там большую часть свободного от службы времени.
Так же, как и Серафим, Анатолий молился всю ночь. А под утро вдруг услышал крик Серафима: «Беги, Анатолий!» и сразу за этим — выстрелы. Понял он, что Серафим убит. Выскочил из своей кельи и кинулся вниз с горы. До пасеки он добрался чуть живой, вся одежда оборвана, пока катился с горы, весь побился, а перебираясь через реку, чуть не утонул. Насилу откачали его пасечники.
Потом из города приехали Пахомий и Ираклий, подоспели и монахини.
Отец Анатолий, заливаясь слезами, отпевал своих братьев по вере в ските на сопке Мохнатой, а потом еще 40 дней служил в келье Серафима, которую сам когда-то помогал строить. После этого некоторое время жил в городе Верном, служил священником и регентом во Всехсвятском храме Иверско-Серафимовского женского монастыря, где управлял хором и писал музыку. Обитель к тому времени была уже закрыта, но храм еще некоторое время действовал (окончательно закрыт он был лишь в 1937 году).
В середине 20-х годов его просветительская деятельность начала вызывать недовольство советской власти. Дабы не навлечь гнев властей на своих подопечных монахинь, проживающих в ските на сопке Мохнатой, которых все эти годы опекал, он ушел в Абхазию, где жил неподалеку от Сухуми в Кавказских горах, где в глухом ущелье построил себе келью. В течение нескольких лет он вел переписку с верненскими монахинями. А в начале 1930-х годов ими была получена весть об аресте, а годом позже — о расстреле отца Анатолия.
Иеромонах Анатолий причислен к лику святых Новомучеников и Исповедников Российских на Юбилейном Архиерейском Соборе Русской Православной Церкви в августе 2000 года для общецерковного почитания.
Память на Собор новомучеников и исповедников Российских (первое воскресение, начиная с 25 января/07 февраля), преподобномученик.
Преподобномученик схимонах Ираклий
Схимонах Ираклий (мирское имя — Сергей Матях) родителей своих не знал, его еще младенцем подкинули в монастырь, где он и воспитывался.
С иноками, прибывшими из Глинской пустыни, он познакомился в Иссык-Кульском Свято-Троицком монастыре, где Ираклий и Пахомий особо сблизились с Серафимом и Феогностом.