Главный недостаток, изначально заложенный в конструкции и LVT-1, и LVT-2, заключался в кормовом расположении моторного отделения, из-за чего личный состав и грузы загружались в машину и разгружались через борта десантного отделения. В десантном варианте это увеличивало время посадки и высадки, в грузовом — ограничивало номенклатуру перевозимых грузов, тяжелые и габаритные грузы приходилось загружать и выгружать с помощью крановой стрелы, импровизированных пандусов и т. п. Удачным выходом из положения было перемещение моторного отделения вперед и установка в корме откидной аппарели, которая позволила бы загружать грузы прямо с грунта, закатывать в транспортер орудия, прицепы и т. п., ускорила бы разгрузку и высадку десанта. Результатом такой перекомпоновки стал опытный плавающий транспортер СТ-3, принятый на вооружение под обозначением LVT-4 (Landing Vehicle Tracked, Mark 4; о машине, «перехватившей» третий номер, но поступившей на вооружение позднее, будет сказано далее). Откидная аппарель в целом завершила облик плавающего транспортера LVT.
LVT-4 создали на основе LVT-2, но с расположением моторного отделения непосредственно за отделением управления. Стоит отметить, что в связи с введением кормовой аппарели FMC предлагала и другие варианты компоновки: с размещением в бортовых понтонах двух двигателей, работающих на одну коробку передач, установленную в носовой части корпуса; с размещением двигателя и трансмиссии между полом грузового отделения и днищем (это должно было не только высвободить полезную длину машины, но и понизить ее центр масс), с тем же размещением силовой установки и трансмиссии и со смещением закрытой рубки управления к правому борту (что позволило бы размещать в корпусе длинномерные грузы). Но столь радикальные изменения приняты не были, тем более что они требовали выбора других двигателей.
В крыше нового моторного отделения выполнили решетки-жалюзи. Десантное отделение сместилось назад, его заднюю стенку сменила откидная аппарель, управляемая ручной лебедкой. Аппарель представляла собой раму, сваренную из труб и обшитую стальными листами. Разумеется, пришлось принимать меры для герметизации стыков корпуса и аппарели. В результате аппарель с лебедкой прибавили машине более чем тонну собственной массы. Зато машина могла нести в своем более просторном (за счет устранения карданного вала) десантном отделении на 1135 кг (2500 фунтов) больше груза, а возможная длина груза увеличилась на 0,6 м (около 2 футов). В новой модели сохранились элементы конструкции корпуса, двигатель, агрегаты трансмиссии, подвеска, гусеницы LVT-2. Органы управления механика-водителя несколько улучшили.
При грузоподъемности до 4,0 т транспортер мог перевозить до 30 полностью экипированных бойцов, а также легкие машины (например, джип «Виллис») или полевые орудия. В десантном отделении можно было, например, разместить 105-мм гаубицу М2А1 со снятыми колесами. С использованием специальной рампы гаубица в собранном виде могла размещаться на корпусе сверху, опираясь разведенными станинами на борта (ниже ее размещали боекомплект в ящиках) — для снятия с транспортера достаточно было отцепить фиксирующие ее на корпусе растяжки и скатить орудие назад. Хотя в реальных условиях этот прием не использовали — тем более что при таком подъеме центра масс машина просто теряла остойчивость на плаву.