Император пересмотрел и изменил Морской устав Петра Великого (Павловский устав флота почти не изменился до наших дней). Он уделил огромное внимание организации, техническому обеспечению и снабжению флота. Происходили существенные изменения и в гражданской жизни. В 1800 году Павел I запретил ввоз иностранных книг, а также отправку юношей за границу для получения образования. Результатом этих указов стало то, что уменьшилось увлечение дворян всем иностранным. Высшие круги общества с французского языка стали постепенно переходить на русский. Отменили разорительную для крестьян хлебную повинность. В губерниях было предписано губернаторам наблюдать за отношением помещиков к крестьянам. Запретили продавать дворовых людей и крестьян без земли, разделять семьи при продаже. Неудивительно, что ни один закон, ни одно положение, установленное Павлом I, не было отменено впоследствии его сыном Александром I, а большинство законов, разработанных Павлом и им введенных, просуществовало вплоть до 1917 года.
Между тем происходящие по воле Павла I перемены в государстве свидетельствовали – в стране идут реформы. Это не могло устраивать всех. Начинает появляться оппозиция и назревать недовольство политикой нового государя. Как уже говорилось, весьма продуманно создавался образ «императора Павла – самодура, деспота и безумца». Многие указы государя искажались и дискредитировались, насколько это возможно. Князь Лопухин пишет в своих воспоминаниях: «Были около императора люди злонамеренные, которые пользовались его раздражительностью, а в последнее время даже возбуждали ее, чтобы для своих целей сделать государя ненавистным».
Непопулярная среди дворянства политика Павла I в сочетании с его довольно порывистым вспыльчивым характером держали в напряжении весь царский двор. Очень многие подданные Павла Петровича ненавидели своего монарха, чьи непредсказуемые действия таили в себе угрозу устоявшемуся порядку, а значит, и их личному благополучию. Неудивительно, что всю свою жизнь Павел боялся быть убитым в результате заговора. Он никому не доверял. Ему постоянно казалось, что его хотят отравить. Опасаясь отечественных кулинаров, он даже повариху выписал из Англии. Решив защитить себя от измен и мятежей, император велел построить замок-крепость, где он мог бы чувствовать себя в безопасности. Такой замок был построен в Петербурге и получил название в честь архангела Михаила – Михайловский замок. Впрочем, эта и другие предосторожности не помогли. Заговор дворянской верхушки, лишенной императором былой свободы и привилегий, привел к гибели императора. Ровно через 40 дней после переезда в только что выстроенный Михайловский замок император был убит.
В 1797—1799 годах противники политики Павла I сформировали первый заговор, который был раскрыт императором, едва начавшись. В заговоре участвовали наследник престола Александр и его жена Елизавета Алексеевна, а также их друзья.
Несмотря на то что к концу жизни Павел стал особенно мнительным и подозрительным, им было несложно манипулировать, что и делал генерал-губернатор Санкт-Петербурга и любимец императора, граф Пален, умело внушая ему подозрения относительно близких ему людей и добиваясь того, что Павел сам настраивал их против себя. Граф Пален и стал организатором второго заговора, в результате которого император был убит. Наследник престола сын Павла I Александр лично не участвовал в заговоре, но отлично знал о нем. Александр заручился обещанием заговорщиков сохранить жизнь его отцу. Но все получилось не так, как надеялся цесаревич.
В феврале 1801 года Павел I вызвал из Германии 13-летнего племянника Марии Федоровны принца Вюртембергского Евгения. Он был очень расположен к мальчику, высказывал намерения усыновить его и сделать своим преемником на троне. Наследование престола Александром было под угрозой, и заговорщики решили ускорить события.
Павел I словно предчувствовал свою близкую кончину. В последний день жизни, 11 марта 1801 года, государь позвал к себе сыновей – Александра и Константина – и приказал повторно привести их к присяге на верность себе (хотя они уже присягали при его восхождении на престол). Затем он поужинал вместе с сыновьями. Когда ужин кончился и все вставали из-за стола, Павел I вдруг сказал: «Чему бывать, того не миновать», – и ушел в свои апартаменты, ни с кем не простившись.