Для убийства заговорщики приготовили любимое лакомство Распутина – миндальные пирожные, начиненные цианистым калием, а также бутылку вина, в которое был подмешан яд. По приезде Распутина во дворец его принял хозяин Ф. Юсупов, остальные участники заговора ждали наверху, в другой комнате. Пуришкевич, описывая в своем дневнике убийство царского фаворита как подвиг, совершенный заговорщиками для спасения России, тем не менее, отдает должное мужеству Распутина: «Прошло еще добрых полчаса донельзя мучительно уходившего для нас времени, когда наконец нам ясно послышалось хлопанье одной за другой двух пробок, звон рюмок, после чего говорившие до этого внизу собеседники вдруг замолкли. Мы застыли в своих позах, спустившись еще на несколько ступеней по лестнице вниз. Но… прошло еще четверть часа, а мирный разговор и даже порой смех внизу не прекращались. “Ничего не понимаю, – разведя руками и обернувшись к великому князю, прошептал я ему. – Что он, заколдован, что ли, что на него даже цианистый калий не действует!”». Понимая, что на Распутина яд почти не оказывает никакого действия, заговорщики решили застрелить «старца», цинично рассудив, что «это и скорее, и проще». Сначала стрелял Юсупов. Решив, что выстрел в грудь не оставит жертве никаких шансов, князь оставил истекающего кровью Распутина умирать в комнате. Каково же было удивление заговорщиков, когда из столовой, где лежал «старец» раздался звук открывающейся двери, а затем послышались шаги. «То, что я увидел внизу, могло бы показаться сном, если бы не было ужасной для нас действительностью: Григорий Распутин, которого я полчаса тому назад созерцал при последнем издыхании, лежащем на каменном полу столовой, переваливаясь с боку на бок, быстро бежал по рыхлому снегу во дворе дворца вдоль железной решетки, выходившей на улицу… Первое мгновение я не мог поверить своим глазам, но громкий крик его в ночной тишине на бегу “Феликс, Феликс, все скажу царице…” – убедил меня, что это он, что это Григорий Распутин, что он может уйти, благодаря своей феноменальной живучести, что еще несколько мгновений, и он очутится за вторыми железными воротами…» – вспоминал об этом Пуришкевич.
Пытавшийся бежать, смертельно раненный, но все еще живой Григорий Распутин упал только после четвертого выстрела. Когда Пуришкевич добил Распутина, заговорщики сбросили тело царского фаворита с моста в прорубь на Малой Невке. Вскрытие тела показало, что Распутин был жив, когда его спустили в реку! Мало того: дважды смертельно раненный в грудь и шею, с двумя проломами в черепе, он и под водой какое-то время боролся за свою жизнь и успел освободить от веревок правую руку, сжатую в кулак.
Даже после смерти тело Распутина не обрело покоя. Сразу после убийства царица Александра Федоровна поручила одному из видных петроградских архитекторов сделать проект мавзолея в Царском Селе, куда планировалось перенести прах фаворита. А пока устроили временное погребение неподалеку от царских дворцов. Возле могильного холма возвели деревянную часовню, куда почти каждый день ходили молиться члены царской семьи. Однако покоился Распутин там недолго. После Февральской революции его тело выкопали и сожгли на костре.