В 1736 г. с одного из адмиралтейских бастионов в полдень стал производиться пушечный выстрел. А с 1873 г. этот полуденный выстрел стал звучать с Нарышкина бастиона Петропавловской крепости.
На верхнем ярусе башни императрица Елизавета Петровна повелела устроить церковь. Под нее архитектором С. И. Чевакинским в 1747 г. переделан двухсветный зал заседаний Адмиралтейств-коллегии. Проект внутреннего убранства храма, включая картоны резного иконостаса, подготовил его ученик М. А. Башмаков. Иконостас был покрашен в лазоревый цвет, а его резные детали позолочены. Иконы для церкви написал художник М. Л. Колокольников. Появился на башне и колокол, украшенный надписью «Вылит сей колокол при Санкт-Петербурге в Главной Артиллерии 1731 году апреля 5 дня. В нем 59 пудов 35 фунтов».
В начале 1755 г. закончили работы, и в мае церковь освятили в честь Святого пророка Захарии и Святой праведной Елизаветы — родителей Предтечи и Крестителя Господня Иоанна.
Кстати, в этой церкви в 1844 г. отпевали И. А. Крылова. После печального обряда похоронная процессия по Невскому проспекту двинулась к Александро-Невской лавре. Там баснописца похоронили рядом с его другом поэтом и переводчиком Н. И. Гнедичем.
При Екатерине II, после наводнения 1777 г., на углах среднего яруса башни при подъеме воды стали выставлять флаги, а ночью — зажигать огни для оповещения населения об опасности.
По этому поводу ею издан указ вице-президенту Адмиралтейств-коллегии и командиру галерного флота графу И. Г. Чернышеву, в котором предписывалось разработать особые знаки и сигналы о бедствии. В обнародованных правилах говорилось следующее: «Когда в Коломнах и в Галерной гавани вода начинает выходить на берег, то дан будет сигнал: тремя выстрелами из пушек, и будет поднято на шпице со всех четырех сторон по красному флагу, а ночью три фонаря; также пойдет барабанщик бить в барабан; в случае же сильной опасности, для всех жителей из Адмиралтейства крепости будет сделан сигнал пятью выстрелами из пушек и выставлены будут на адмиралтейском шпице со всех сторон белые флаги, а ночью по два фонаря».
В мае 1783 г. в Адмиралтействе произошел сильный пожар, который угрожал перекинуться и на Зимний дворец.
Напуганная им Екатерина II решила даже перевести верфи в Кронштадт, а на этом месте построить здание для Сената. К этому времени в Кронштадте уже существовала крупнейшая в Европе верфь. Ее интенсивное развитие началось после постройки и открытия в 1752 г. морского канала, получившего имя Петра Великого. В доках кронштадтской верфи одновременно могло чиниться более десяти кораблей, а после упомянутого адмиралтейского пожара в 1783 г. здесь началось строительство еще шести доков.
Однако решение вопроса затянулось. Чиновникам явно не хотелось покидать Петербург. Чтобы этого избежать, они представили императрице огромную смету на переезд — 9 млн руб., которую она сочла неподъемной для государственного бюджета. В результате с территории Адмиралтейства при Екатерине убрали только подсобные предприятия. В Кронштадт, например, перевели Канатный двор. Основное же производство продолжало действовать и после смерти императрицы. А во избежание новых пожаров выделили дополнительные средства на противопожарные мероприятия.
…Во времена царствования Анны Иоанновны и Елизаветы Петровны флоту внимания почти не уделялось, и верфи Адмиралтейства преимущественно простаивали. Построенные Петром суда оставались у причалов и гнили. Процесс этот был довольно скорым, поскольку строились они в спешке, из недостаточно выдержанного, сырого леса. Ситуация изменилась только с восшествием в 1762 г. на российский престол Екатерины II.
Во второй половине XVIII в. на оживших Адмиралтейских верфях строились как небольшие суда, так и 100–130-пушечные корабли. В 1764–1771 гг. вместо одиннадцати старых эллингов построили шесть модернизированных новых и устроили четыре подъемных крана. Из них два крана были передвижными.
Это позволяло одновременно строить здесь до 10 крупных судов, но фактически строилось только по 3–4 многопушечных корабля в год. Всего в период с 1762 по 1800 г. на Адмиралтейских верфях построили более 120 кораблей, из которых многопушечными являлись лишь 32 корабля. Для проводки столь крупных кораблей от Адмиралтейства до Кронштадта в 1768 г. в Чекушах на Васильевском острове организовали особую верфь по строительству специальных плоскодонных судов — камелей.
Для ремонта судов на верфях имелось четыре сухих дока и один мокрый док. Но занимались в Адмиралтействе не только кораблестроением. Ежедневно в полдень около башни при Екатерине II для горожан стал играть оркестр. Его выступления прекратились только в начале XIX в. — началась очередная перестройка здания Адмиралтейства.