В конце 80-х годов в масштабе Союза ССР был создан Госкомитет по охране природы. По образцу этого комитета были созданы комитеты в союзных республиках. По своему замыслу комитеты должны были стать координаторами всей природоохранной деятельности в стране, т. е. едиными центрами комплексного управления охраной природы взамен многочисленных ведомственных структур. В силу объективных и субъективных причин эту задачу все же решить не удалось. В 1991 г. Комитет по охране природы был упразднен, а вместо него было создано Министерство экологии и природных ресурсов (Минэкологии). В него вошли комитеты по охране и использованию недр и рыболовства. Но, к сожалению, и этот эксперимент не удался. В 1992 г. Министерство экологии и природных ресурсов было переименовано в Министерство охраны окружающей среды и природных ресурсов Российской Федерации. В 1993 г. был создан Госкомитет по экологии и природопользованию, став самостоятельным государственным органом управления. И в 1996 г. был создан Комитет по охране окружающей среды и опять он был упразднен. По существу, громадный орган оказался неэффективным в управлении природопользованием и охраной окружающей среды. Практика показала, что оно неспособно было решать поставленные задачи перед обществом, перед гражданами, перед государством.
В настоящее время происходят изменения структуры органов государственного управления и их компетенции; изменения в разграничении предмета ведения между Федерацией и ее субъектами; в повышении роли местного самоуправления. В этой связи государство должно больше брать ответственность на себя перед обществом за благоприятное состояние окружающей среды.
В современной литературе и законодательстве все больше внимания уделяется термину просто «управление», а «не государственное управление», иначе говоря, опускается термин «государственное управление». Это связано, прежде всего, с понижением правового положения круга субъектов системы управления природопользованием и охраной окружающей среды. Вместе с тем в рамках государства реализация природоохранного законодательства осуществляется государственными органами. Именно государству в лице его представительных органов принадлежит важнейшая роль в укреплении экологического правопорядка в стране. Управление природопользованием и охраной окружающей среды основано на конституционных положениях и подразумевает, прежде всего, исполнительную деятельность государственных органов по практической реализации, принадлежавших государству полномочий в обеспечении рационального и научно обоснованного использования природных ресурсов, а также соблюдения законности в регулировании экологических отношениях. Механизм управления природопользованием и охраной окружающей среды должен учитывать и специфику природных ресурсов, как наиболее важных объектов природы. Взаимоотношения производителей продукции с органами по управлению природопользованием и охраной окружающей среды должны строиться таким образом, чтобы они не противоречили друг другу. Так, землеустройство является одной из функций государственного управления и реализации землеустроительного процесса, которое представляет собой внутрихозяйственные действия и зависит от того, насколько успешно решен этот вопрос. В этой связи управление природопользованием и охраной окружающей среды есть управление всех природопользователей, включая и землеустроителей.
Не следует забывать о том, что под управлением понимается и организаторская деятельность органов государственной и исполнительной власти и местного самоуправления, направленная на обеспечение наиболее рационального использования природных ресурсов и всемерную охрану окружающей среды. Не только из теории, но и из многолетней практики известно, что любой строй успешно развивается лишь тогда, когда большинство населения реально управляет государством, когда миллионы людей активно участвуют в жизни страны. В пятом разделе Экологической доктрины Российской Федерации от 18 сентября 2002 г. указывается, каким путем должно идти развитие государственного управления охраной окружающей среды и природопользованием.