Эпигенетика

K23ac | Hs | — | Активация транскрипции | Hake and Allis, 2006

K27me | Dm | me1, me2, me3 | Репрессия транскрипции | McKittrick et al., 2004

K36me | Dm, Hs | me1, me2, me3 | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004; Hake and Allis, 2006

K37me | Dm | me1, me2 | — | McKittrick et al., 2004

K79me | Dm, Hs | me1, me2 | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004; Hake and Allis, 2006

S31ph | Млекопитающие | — | Митоз-специфичное фосфорилирование | Hake et al., 2005

CEN-H3/ CENP-A

Сайт | Модель | Энзим | Функция | Ссылка

S7ph | Hs | — | Митоз | Zeitlin et al., 2001

Дополнительные модификации CENP-A: S17ph.

Сокращения для модельных организмов:

(An) Aspergillus nidulans, (At) Arabidopsis thaliana, (Ce) Caenorhabditis elegans, (Dm) Drosophila melanogaster, (Hs) Homo sapiens, (Mm) Mus musculus, (Nc) Neurospora crassa, (Rn) Rattus norvegicus, (Sc) Saccharomyces cerevisiae, (Sp) Schizosaccharomyces pombe, (Tt) Tetrahymena thermophila, (Xl) Xenopus laevis.

Модификации гистонов — по номенклатуре, предложенной Тернером (Turner, 2005).

В таблицах перечисляются все известные модификации гистонов и известные энзимы с первичными ссылками (до мая, 2006 г.). Дополнительные модификации с пока еще неизвестными функциями перечислены под таблицами. Эти модификации взяты из разных источников: обзорных статей, информации от Abeam Cambridge, UK и Upstate Charlottesville, USA, а также из неопубликованных данных лаборатории Рейнберга (Reinberg).

Эта таблица была составлена на основе оригинального варианта, взятого из (Lachner et al., 2003) и значительно расширенного Roopsha Sengupta и Mario Richter (Лаборатория Jenuwein, IMP Vienna). Д-р Patrick Trojer (Лаборатория Reinberg, HHMI, New Jersey) проверил содержимое таблиц.

Эта таблица была проверена и дополнена информацией, предоставленной д-ром Steven Gray (Dept, of Clinical Medicine, Institute of Molecular Medicine, St. James Hospital, Dublin).

ЛИТЕРАТУРА

Adhvaryu K.K., Morris S.A., Strahl B.D., and Selker E.U., 2005. Methylation of histone H3 lysine 36 is required for normal development in Neurospora crassa. Eukaryot. Cell 4: 1455-1464.

Ahn S.H., Cheung W.L., Hsu J.Y., Diaz R.L., Smith M.M., and Allis C.D., 2005. Sterile, 20 kinase phosphorylates histone H2B at serine 10 during hydrogen peroxide-induced apoptosis in S. cerevisiae. Cell 120: 25-36.

Aihara H., Nakagawa T., Yasui K., Ohta T., Hirose S., Dhomae N., Takio K., Kaneko M., Takeshima Y., Muramatsu M., and Ito T., 2004. Nucleosomal histone kinase-1 phosphorylates H2A Thr 119 during mitosis in the early Drosophila embryo. Genes Dev. 18: 877-888.

Ajiro K., 2000. Histone H2B phosphorylation in mammalian apop-totic cells. An association with DNA fragmentation. J. Biol. Chem. 275: 439-443.

Akhtar A., and Becker P.B., 2000. Activation of transcription through histone H4 acetylation by MOF, an acetyltransferase essential for dosage compensation in Drosophila. Mol. Cell 5: 367-375.

Allard S., Utley R.T., Savard J., Clarke A., Grant P., Brandi C.J., Pillus L., Workman J.L., and Cote J., 1999. NuA4, an essential transcription adaptor/histone H4 acetyltransferase complex containing Esalp and the ATM-related cofactor Tralp. EMBO J. 18: 5108-5119.

Anest V., Hanson J.L., Cogswell P.C, Steinbrecher K.A., Strahl B.D., and Baldwin A.S., 2003. A nucleosomal function for IkB kinase-a in NF-KB-dependent gene expression. Nature 423: 659-663.

Bannister A.J., Zegerman P., Partridge J.E., Miska E.A., Thomas J.O., Allshire R.C., and Kouzarides T., 2001. Selective recognition of methylated lysine 9 on histone H3 by the HP1 chromo domain. Nature 410: 120-124.

Bauer U.M., Daujat S., Nielsen S.J., Nightingale K., and Kouzarides T., 2002. Methylation at arginine 17 of histone H3 is linked to gene activation. EMBO Rep. 3: 39-44.

Beisel C, Imhof A., Greene J., Kremmer E., and Sauer F., 2002. Histone methylation by the Drosophila epigenetic transcriptional regulator Ash 1. Nature 419: 857-862.

Berger S.L., 2002. Histone modifications in transcriptional regulation. Curr. Opin. Genet. Dev. 12: 142-148.

Bernstein B.E., Humphrey E.X., Erlich R.L., Schneider R., Bouman P., Liu J.S., Kouzarides T., and Schreiber S.L., 2002. Methylation of histone H3 Lys 4 in coding regions of active genes. Proc. Natl. Acad. Sci. 99: 8695-8700.

Bird A.W., Yu D.Y., Pray-Grant M.G., Qiu Q., Harmon K.E., Me-gee P.C., Grant P.A., Smith M.M., and Christman M.F., 2002. Acetylation of histone H4 by Esal is required for DNA double-strand break repair. Nature 419: 411-415.