В 1184 г. сюда переселяется маркиз Обиццо д’Эсте и сразу включается в борьбу за власть. Он ищет себе сторонников в соседних городах и заручается поддержкой папы. Возглавив Синьорию, он стал городским тираном, закрепив власть своего семейства в Ферраре на 400 лет. При правлении д’Эсте, которые приложили много сил, чтобы сделать город красивым и процветающим, Феррара переживает свой расцвет. В городе появляются новые здания, процветают наука и искусство. В 1385 г. Николо II начал строительство величественного замка д’Эсте, по его приглашению в городе появляется Петрарка, основывается литературный кружок, явившийся ярким образцом культуры раннего ренессанса. Альберто V в 1391 г. основал университет, наделенный теми же правами и привилегиями, что и Болонский. Традиция привлечения к своему двору ярчайших представителей итальянской литературы была продолжена и их потомками, так, при Альфонсо II Торквато Тассо написал в Ферраре свою знаменитую поэму «Освобожденный Иерусалим». Николо III способствовал созыву в Ферраре в 1483 г. церковного собора, на котором присутствовали византийский император Иоанн II Палеолог и папа и который был посвящен вопросу воссоединения западной и восточной церквей. Это событие сделало д’Эсте важнейшими союзниками пап и подняло их международный престиж, которому поспособствовал также и Борсо д’Эсте, добившийся в 1471 г. для д’Эсте титула герцогов Феррарских. При Леонелло д’Эсте архитектор Росетти перестроил город в духе ренессанса. Семье д’Эсте удалось породниться со знатными домами Европы, так, Альфонсо I был мужем Лукреции Борджиа, племянницы папы Александра VI, а Эрколе II был женат на дочери короля Людовика XII Рене Французской, которая поддерживала протестантов. Прогрессивные взгляды д’Эсте проявились также в том, что они привлекали в город евреев, которые жили в своем квартале, гетто, и пользовались правами городских жителей.
Власть последнего герцога Чезаре д’Эсте пала в 1598 г., после чего город перешел к папам, которые стали уделять ему значительно меньше внимания, чем прежние правители. Феррарой стали управлять назначаемые из Рима кардиналы-губернаторы, прекратились дренажные работы, возникли эпидемии малярии, евреи были изгнаны из Феррары, город стал приходить в упадок.
В 1796 г. Феррара была оккупирована французами, затем вошла в состав Цизальпийской республики. После падения Наполеона, в 1815 г., город был возвращен папам, но здесь находился австрийский гарнизон. В 1860 г. Феррара вошла в состав Итальянского королевства.
Большинство зданий Феррары построены из красного кирпича, самое величественное ее сооружение – огромный замок д’Эсте, строительство которого велось на протяжении нескольких веков. Старейшая часть замка возведена Никколо II в конце 14 в. Выросший посреди широкой городской площади, застроенной невысокими домами, поднимается прямо из воды окружающего их широкого рва мощный четырехугольник укрепленных огромными башнями высоких стен, создавая разительный контраст между суровым герцогским замком и окружающей его городской застройкой, напоминая, что в те времена власть даже самых уважаемых и популярных правителей была весьма непрочной и их жизни всегда угрожала опасность. Над арками завершающих стены машикулей надстроены более поздние крытые галереи, по углам усиленные мощными квадратными башнями, к которым пристроены более низкие башни. От одной из башен ведет через ров подъемный мост, с двух сторон защищенный небольшими квадратными башнями разной высоты, так, что со стороны они образуют три ступени. Крытый переход соединяет старый замок с новым, стены которого, увенчанные зубцами в виде ласточкиных хвостов, ограничивают обширный внутренний двор с внешними ренессансными лестницами и лепными порталами входов. Над замком возвышается мощная квадратная башня с машикулями, являя символ могущества герцогской семьи.
Полукруглая арка, фланкированная двумя колоннами со статуями герцогов Феррарских, открывает проход от замка к белокаменному фасаду собора Девы Марии и св. Георгия, построенному в 12 в. в великолепном романском стиле. Три равновысоких треугольных фасада собора, фланкированные прямоугольными пилястрами, по горизонтали рассечены тремя ярусами изящных полукруглых аркад на тонких колоннах. Фасады украшают аркады, заключенные в стрельчатые ниши, а под фронтонами проходит ряд тонких колонн. Арку входа обрамляет двухъярусный треугольный портал с арочной галереей, резным скульптурным карнизом и тимпаном.