План содержит и реорганизацию российской юридической системы: расширение компетенции и ответственности судей, их защиту от возможного давления со стороны преступников; лучшее дотирование, чтобы избежать взяточничества (от которого должны отпугнуть и строгие наказания); реальные властные полномочия для инстанций, непосредственно занимающихся преступниками (суды быстрого судопроизводства и право применения оружия в отношении наркодельцов); введение электронной сети информации при спецслужбах и федеральных и местных органах юстиции. Что касается необходимых для этого средств, то предполагается строже, чем до сих пор, наказывать за уклонение от уплаты налогов. Лебедь хочет усовершенствовать систему наказаний. Нужно воспрепятствовать выезду из страны лиц, совершивших преступление, требует он. Он хочет добиться, чтобы коррупция квалифицировалась как преступление против государства, чтобы наказывались как явные, так и скрытые взятки.
Однако парламент отказывается утвердить его поправки к законам, разработанные юридическими экспертами, относительно организованной преступности и коррупции, а организации по правам человека возражают против этого, потому что в них предусмотрены и выселение людей, и арест домовладельцев.
На реформу армии Лебедь смотрит как на составную часть концепции национальной безопасности. Он формулирует новую военную доктрину. При этом бывший командующий армией исходит из 73 кризисных очагов в мире, примерно в трети из них уже начались вооруженные конфликты. Лебедь указывает на рост напряженности в потенциально конфликтных областях. Большинство их находится на территории бывшего Советского Союза.
Главной причиной кризисных ситуаций являются «правовой нигилизм», «агрессивный национализм» и притязания на территории или нерешенные вопросы статуса социально-экономического развития в регионах СНГ и Российской Федерации. К этому относились и дискриминация меньшинств, и споры из-за собственности между субъектами и Федерацией.
В то время как министр обороны Родионов видит опасность в ближайшем будущем «внутри» из-за слабости и недостаточной ударной силы современной армии, Лебедь полагает, что угроза идет от границ России: на юге и на востоке. На юге — в Закавказье, Центральной Азии, так как в этих регионах политические конфликты подогреваются этническими и религиозными разногласиями. Лебедь опасается, что Таджикистан с Ираном и Пакистаном будут втянуты в конфликт с Афганистаном, и на Узбекистан и исламскую часть Казахстана может перекинуться то, что угрожает безопасности России.
Для России, считает Лебедь, представляет опасность угроза турецкого влияния на Северном Кавказе и в Закавказье с тех пор, как к власти в Турции пришла исламская партия, рассматривающая названные области как сферы своего влияния. Все это может привести не к глобальным, а к местным конфликтам, которые нужно пресечь в зародыше. В военном отношении целесообразно было бы использовать в этих областях только мобильные отряды для устрашения организаторов, ограничения или нейтрализации конфликтов. Лебедь и Родионов сходятся во мнении относительно того, что на юге России реальной угрозой может стать ислам, на Востоке из-за неплотного заселения больших территорий — Китайская Народная Республика. На западе действующие пограничные войска должны бы быть противопоставлены приближающемуся к границам России НАТО. В настоящее время ни одна российская дивизия не может быть приведена в боевую готовность в течение двух-трех часов. Поэтому армия должна стать меньше, но боеспособнее.
Говоря о политике, Лебедь и Родионов высказались против того, «что — как уже практиковалось много лет — для видимости сохранения российского престижа или иллюзии величия повсюду в мире мы вмешиваемся в решение проблем». Что касается НАТО, оба говорят о партнерстве с ним, в которое входит и обмен, так как это углубляет доверие и снижает напряженность.
Однако когда Лебедь хочет приступить к осуществлению реформы армии, он наталкивается на ограничение свободы действий. То, что премьер-министр не собирается увеличивать ассигнования на армию, уже давно стало ясно. Но на пути Лебедя стоят и административные препятствия. Как секретарь Совета безопасности и советник президента по вопросам национальной безопасности, а также председатель комиссии по вопросам назначения на высшие должности в армии летом он был поставлен Ельциным чуть ли не выше министерства обороны, генерального штаба, министерства внутренних дел, федеральной службы безопасности, пограничных войск и других силовых ведомств.
Однако через месяц президент противопоставил Лебедю Совет обороны, состоящий из нескольких человек. Лебедю придется не только делить с ним функции и власть, но и оказывать уважение верхушке Совета обороны — президенту Ельцину, премьер-министру Черномырдину и тому самому Батурину, предшественнику Лебедя на посту советника по вопросам национальной безопасности. Таким образом, с конца июля Батурин — начальник Лебедя, а не подчиненный.