19 февраля 1942 г. «Щ-403», высадив группу разведчиков, ночью в надводном положении выходила из Порсангер-фьорда. Неожиданно она встретила вражеский минный заградитель «Бруммер» и тральщики «М-1502» и «М-1503». Противник открыл по лодке огонь. При срочном погружении на мостике остался тяжелораненый командир капитан-лейтенант С.И. Коваленко. В момент погружения лодку таранил тральщик «М-1503». «Щ-403» получила многочисленные повреждения, но принявшему командование ст. лейтенанту П.В. Шипину удалось привести лодку в базу.
28 марта 1942 г. командиром лодки был назначен капитан-лейтенант (впоследствии капитан 3 ранга) К.М. Шуйский.
Для прикрытия конвоев QP-13 и PQ-17, 26 июня «Щ- 403» совместно с другими лодками вышла в море к побережью Северной Норвегии.
11 августа «Щ-403» на позиции в Варангер-фьорде обнаружила два судна, вышла в атаку и четырехторпедным залпом потопила танкер «Георг Л.М. Русс» (2890 брт). Вражеские корабли стали преследовать лодку, за два с половиной часа на нее было сброшено более 100 бомб. Однако лодке удалось оторваться от противника и благополучно вернуться в базу.
14 декабря у о-ва Лилле-Эккерё «Щ-403» обнаружила транспорт противника в охранении тральщика. Лодка произвела по транспорту четырехторпедный залп. По не вполне достоверным данным, транспорт (7000 т) был потоплен.
Выйдя вскоре после полуночи 12 июля 1943 г. из Екатерининской гавани, «Щ-403» 17 июля у входа в Конгс-фьорд встретилась с двумя вражескими тральщиками и катера и с дистанции 12 кбт. произвела залп. Две из трех выпущенных торпед достигли цели, тральщик «М-346» затонул.
Через три дня в том же районе гидроакустик обнаружил следовавший на восток неприятельский конвой в составе транспорта и пяти кораблей охранения. Сблизившись с ним на дистанцию 9 кбт, командир произвел четырехторпедный залп. Через 2 мин на подводной лодке услышали два сильных взрыва. Считалось что атакованное судно водоизмещение до 6 тыс. т затонуло. Израсходовав боеприпас, «Щ-403» направилась в базу и 23 июля ошвартовалась в Полярном.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 24 июля 1943 г. «Щ-403» была награждена орденом Красного Знамени.
2 октября «Щ-403» вышла на позицию к Тана-фьорду. По истечении срока автономности лодка не вернулась в базу. 2 ноября приказом командующего флотом «Щ-403» была исключена из состава флота.
Подводная лодка совершила 14 боевых походов (165 суток), 10 торпедных атак, в результате которых потоплены 2 судна и 1 корабль.
Заложена 25 декабря 1934 г. в Ленинграде на заводе № 189 (Балтийский завод) под наименованием «Щ- 316». 27 декабря 1935 г. спущена на воду. 1 октября 1936 г. вошла в состав КБФ.
16 мая 1937 г. лодка была переименована в «Щ- 404» и в период с 28 мая по 27 июня 1937 г. по Беломорско-Балтийскому каналу перешла в Заполярье и 30 июня вошла в состав СФ.
В апреле-мае 1939 г. совместно с другими кораблями СФ лодка обеспечивала в Норвежском море связью беспосадочный перелет В. Коккинаки по маршруту Москва-Америка.
Во время советско-финляндской войны 1939–1940 гг. «Щ-404» несла дозор на подходах к главной базе.
22 июня 1941 г. встретила под командованием капитан-лейтенанта (затем капитана 3 ранга) В.А. Иванова в составе 3-го дивизиона бригады подводных лодок в Полярном.
С началом военных действий «Щ-404» перешла в Иоканьгу, чтобы прикрывать вход в Горло Белого моря. Совершив четыре выхода в дозор, в октябре лодка вернулась в Полярный.
15 декабря «Щ-404» вышла в первый боевой поход на коммуникации противника. 29 декабря у м. Нордкин она обнаружила конвой (транспорт и три сторожевых корабля). Лодка атаковала двумя торпедами транспорт. По не вполне достоверным данным, он был потоплен. Около часа лодка подвергалась преследованию.
Для прикрытия конвоя PQ-13, 29 марта 1942 г. «Щ- 404» вышла на позицию в район Тана-фьорда. 31 марта лодка атаковала конвой противника (транспорт, 2 тральщика). По не вполне достоверным данным, транспорт (5000 т) был потоплен. 1 апреля в районе Тана-фьорд, м. Маккаур лодка встретила конвой (транспорт, 2 тральщика и сторожевой катер) и с дистанции 8-10 кбт. атаковала его тремя торпедами. Транспорт «Михаэль» (2722 брт) был потоплен. После выхода торпед лодка подвсплыла, а при уходе на глубину коснулась грунта. Противник сбросил на нее 58 глубинных бомб. 3 апреля «Щ-404» сняла с побережья противника нашу разведывательную группу и 6 апреля вернулась в базу.
2 июня немецкая авиация совершила массированный налет на Мурманск. «Щ-404» получила повреждения.