Командир 16-й сд генерал-майор Илья Михайлович Любовцев[97]
. Одним из последних кадровых перестановок было назначение заместителя командира 16-й сд полковника А. В. Богданова заместителем командира 179-й (литовской) сд 29-го СК. На его место был назначен с должности командира 225-го сп 23-й сд полковник Яков Афанасьевич Паничкин[98]. Начальником штаба дивизии был полковник Афанасий Иванович Софронов. Стрелковыми полками командовали: 156-м — полковник Порфирий Григорьевич Бородкин[99], 167-м — полковник Андрей Антонович Бабенков[100], 249-м — полковник Георгий Прокофьевич Кондрашев[101]. Артиллерийскими полками командовали: 224-м лап — полковник Тимофей Игнатович Кулешов, 232-м гап — майор Александр Михайлович Беляев.После согласия эстонского руководства с советским ультиматумом, на территорию Эстонии была введена 8-я армия Красной армии. Ее управление было размещено в Тарту. В состав армии входили: 65-й СК (11-я, 16-я и 90-я сд, 18-я лтбр), 1-й СК (24-я и 56-я сд), 19-й СК (42-я и 49-я сд), 13-я лтбр[102]
. К 1 августа на территории Прибалтики был развернут Прибалтийский особый военный округ НКО СССР[103]. После вступления Эстонской ССР в состав СССР с ее территории были выведены войска 1-го и 19-го СК и 13-я лтбр.Эстонская армия переформировывалась в 22-й территориальный стрелковый корпус[104]
. В Таллинском районе формировались и размещались управление 22-го ТСК с корпусными частями и 180-я территориальная сд. В состав 22-го ТСК вошли части корпусного подчинения: 614-й корпусной артиллерийский полк; 150-й отдельный зенитный артиллерийский дивизион; 202-й отдельный саперный батальон; 415-й отдельный батальон связи; 22-я корпусная авиационная эскадрилья. Управление корпуса формировалось на базе штаба Эстонской армии и военного министерства, обс — на базе отдельного батальона связи, осапб на основе саперного батальона 3-й пд, кап на базе 2-го артдивизиона, автотанкового и кавалерийского полков. Корпусной озадн формировался из дивизиона зенитной артиллерии.180-я тсд была сформирована в августе — сентябре 1940 года из 1-й и 3-й дивизий Эстонской армии. 21-й сп формировался на базе 1-го пп 1-й пд, 42-й сп — 4-го и 5-го отдельных пехотных батальонов и 1-й противотанковой роты, 86-й сп — 10-го отд. батальона, скаутского отд. батальона, караульного батальона 3-й пд и 4-й противотанковой роты. Артиллерийские части формировались: лап — на базе 1-го и 2-го артиллерийских дивизионов 1-й пд; гап — 1-й, 2-й и 3-й противотанковых рот, 4-го адн 2-й пд, 5-го отд. адн; одн ПТО — 1-й и 3-й птр. Отдельные части формировались: орб — за счет кавалерийского полка; обс — на базе батальона связи армии, осапб — саперного батальона 3-й пд, озадн — дивизиона зенитной артиллерии, кадры мсб оаб — за счет гарнизонных амбулаторий в Пярну и Йыхви и автотанкового полка[105]
.В связи с тем, что главным противником СССР была Германия, управление 8-й армией осенью 1940 года было передислоцировано в Елгаву и приняло под свое командование части и соединения Красной армии в северной Литве. В Эстонии оставался 65-й СК. 16-я сд размещалась в Хаапсалу, где провела зиму 1939–1940 годов, а также в казармах 3-й пехотной дивизии бывшей Эстонской армии в Таллине. 11-я сд располагалась в казармах 1-го пп 1-й пд Эстонской армии в Нарве. На Моонзундских островах продолжалось обустройство 3-й осбр. В Вильянди, в казармах 4-й пд, располагалась 90-я сд.
В мае 1941 года в войсках Красной армии произошли следующие изменения. 18-я лтбр передислоцировалась в КОВО и на ее базе формировалась 37-я танковая дивизия 15-го МК. 90-я сд была передислоцирована в Литву, в район севернее Таураге. Её постоянные военные городки и склады мобилизационного запаса продолжали оставаться в Эстонии. Началось выдвижение в лагеря частей и соединений, дислоцирующихся в Эстонии. 15 мая начала выдвижение основная часть соединений и частей: в Куртнаский лагерь выдвигалась 11-я сд, в Валклаский лагерь 16-я сд, в Печерский лагерь управление 22-го ТСК с корпусными частями. 18 мая начала выдвижение по железной дороге в Печерский лагерь 180-я тсд.
Значительный урон, приведший к снижению боеспособности 22-го СК и ухудшению в целом внутриполитической обстановки в Эстонии, нанесли аресты командного состава корпуса. Всего было арестовано и уволено: