В 16.03, при даче полного хода для замера потребляемой мощности, отключился статический преобразователь, системы "Поиска" перешли на аварийное питание. Экипаж доложил об отдаче носового и кормового якорей и всплытии, однако с "Рудницкого" ГА не видели. Тогда, в 16.35, по приказу с базового судна, экипаж отдал контейнер с твердым балластом, после чего "Поиск", наконец, показался на поверхности. Однако экипаж сообщил, что не может продуть главный балласт…
Только через час катер подтащил аппарат к судну-носителю, на ГА завели подъемные стропы и приподняли его из воды. В 17.45 из аппарата вышел экипаж. Когда над поверхностью появился весь "Поиск", выяснилось, что оба "отданных" якоря висят на месте! По-видимому, тросы резали гидравлическими резаками, а ведь гидравлика не работала…
Люк был опечатан, и ответственный сдатчик назначил комиссию для разборки инцидента. В нее вошли представитель военной приемки, члены испытательной партии и экипаж погружения.
Осмотр показал, что напряжение вспомогательной батареи – 24 В, в норме, а основной батареи – 215 В, но при подключении потребителей падает до 80 В.
При вскрытии контейнера с основной батареей запахло горелой пластмассой. Обнаружили две сгоревшие шины в нижнем ряду аккумуляторов и одну – в верхнем. При разборке батарей установлено, что одна из сгоревших шин нижнего ряда имела ранее незначительное повреждение изоляции, и ее из-за отсутствия мастики "вылечили" герметиком, который после двух погружений выгорел, сгорела и контактирующая с ней межконтейнерная шина. В верхнем ряду шина имела пробой изоляции на границе с изоляцией борна аккумулятора, в результате выгорел и борн до соединения с пластинами аккумулятора.
В последующие дни в базе переложили слаботочный кабель в прочном корпусе, заэкранировав его стальными трубами с обязательным заземлением – он создавал помехи магнитометру.
К 17 сентября закончили работы по "лечению" и зарядке аккумуляторных батарей и подготовились к работе гидроакустики при выходе на лежащую на грунте подводную лодку – составили схему маневрирования и план-часовик погружения. Однако в этот день страны НАТО начали маневры. На Черноморском флоте также были объявлены учения. Все корабли были выведены на внешний рейд и рассредоточены на якорных стоянках, "М.Рудницкий" встал напротив Качи. Работы с подводной лодкой отменили. На СС проводились учения по борьбе за живучесть корабля.
Лишь 21 сентября к 10 утра пришли в устье бухты, где был установлен квантовый дальномер и контрольные вехи. ГА был спущен на воду, притоплен и начал выполнять галсы между вехами на трех режимах хода. На первом же галсе движение прекратилось, и "Поиск” начал дрейфовать. Его командир доложил, что сработал датчик слабины якорного троса и счетчик показывает длину вытравленного троса за 500 м, а на барабане было всего-то 100 м!
С борта "Рудницкого" спустили катер с членами сдаточной команды. Добровольцы-ныряльщики сообщили, что носовой якорь оборван. По- видимому, он самопроизвольно, под собственной тяжестью вышел из клюза, экипаж этого не заметил, а глубины в бухте 5 – 15 м, и имеются каменные гряды. Видимо, при пересечении одной из них вышедший из клюза якорь зацепился и оторвался.
На аппарат была дана команда продолжать работу. К 16 часам определили поправки к лагу, ввели в него и еше раз определили максимальную скорость – 3,05 уз. Вечером, погрузив ГА в трюм, СС ушло на рейд Качи. Сдаточная команда 23 сентября была отпущена на берег. "Рудницкий" вернулся в Севастополь только 26 сентября, продолжая участвовать во флотских учениях.
Намеченный на 3 октября очередной выход не состоялся – было получено штормовое предупреждение, неожиданное для сдаточной команды.
4 октября в 7.00 СС вышел из базы. Сдаточная команда и испытательная партия догоняли его на катере. На борту носителя для руководства работой с подводной лодкой находился командир бригады А.Ф.Старовойтов. Был назначен экипаж погружения – командир, помощник по НИР, представитель завода-строителя и ответственные сдатчики гидроакустических станций ”Луч-2Г' и "Крильон". В 9 утра пришли в полигон, к 12 подошла подводная лодка. Волнение 2-3 балла, дымка. К 13 часам спустили ГА, и подводная лодка погрузилась в 12 кабельтовых от СС.
К 14 часам ГА погрузился, произвел вывеску и приступил к поиску. В 14.32 с "Поиска" доложили: "Обнаружена цель станцией бокового обзора "Крильон”, дистанция 750 м”. Через 11 минут с дистанции 500 м цель была также обнаружена станцией "Луч-2Г". В 15.15 экипаж увидел цель визуально и начал программу ее классификации и обследования. К 16.00 работа была закончена, ГА всплыл, был принят на борт "Рудницкого", и к вечеру судно вернулось в базу. Проведенная работа была зачтена.
Следующий выход состоялся 5 октября для испытаний навигационной гидроакустической станции "Экватор", тарировки индукционного лага навигационного комплекса "Мста-2" и проверки работы системы автоматики "Циркон".