Величайший русский полководец генералиссимус А.В. Суворов любил и уважал Ф.Ф. Ушакова как «грозу турок, потрясшего Константинополь и Дарданеллы». Между этими двумя выдающимися русскими полководцами было много общего. Ф.Ф. Ушаков, так же как и А.В. Суворов, в больших чинах оставался простым русским человеком, с почтением вспоминал русскую провинцию, где он родился, любил богослужения и, если была хоть малейшая возможность, ежедневно выстаивал все церковные службы. Но он был лишен радостей семейной жизни, у него никогда не было жены, детей. Этот страшный для турок Ушак-паша чуть-ли не побаивался женщин, не знал, как себя лучше вести в женском обществе, чувствовал себя неловко, краснел и т. п. Ф.Ф. Ушаков не любил придворную жизнь, полную лжи и двуличия, лести, преклонения перед начальством.
Далеко не все начальники понимали его воинскую гениальность. Екатерина II, Г.А. Потемкин, А.В. Суворов осознавали это, а были и те, кто сполна не понимал этого или завидовал ему. Среди последних – особенно в конце 1780-х гг. – был контр-адмирал граф Марк Войнович (человек малоспособный и крайне завистливый), а потом – и император Александр I, который не понял и в должной мере не оценил заслуги Ушакова. Александр I назначил великого флотоводца на второстепенную должность главного командира Балтийского гребного флота и начальником флотских команд в Петербурге, а в 1807 г. этот 30-летний император уволил 62-летнего Ушакова в отставку. Во время Отечественной войны 1812 г. 67-летнего Ушакова избрали начальником ополчения Тамбовской губернии, но он из-за болезни отказался от должности. Когда он вышел в отставку и жил на покое в имении, то постоянно жертвовал деньги бедным, больным, раненым морякам и солдатам. К старости, когда почти все его боевые соратники умерли, а большинство знавших и окружавших его людей не помнили, не знали, не ценили его заслуги перед Родиной, Ушаков стал даже чуждаться людей, жил одиноким и почти всеми забытым в своей деревне. В эти годы он особенно стремился помогать тем, кому в жизни приходилось еще хуже, чем ему. В 1813 г. он раздал нуждающимся практически все свои сбережения, сам довольствовался самым малым. Уже при жизни его многие считали святым человеком, бессребреником. Ушаков, все свои силы, энергию, знания, здоровье отдавший служению Родине, ради выполнения воинского долга оставшийся без семьи, старый и больной оказался государству и большинству соотечественников не нужен.
Ф.Ф. Ушаков умер в возрасте 72 лет в деревне Алексеевка (ныне Темниковского района Республики Мордовия). Он был похоронен близ г. Темникова в Рождество-Богородицком Санаксарском монастыре. (Он был племянником почитаемого старца Феодора Санаксарского.) Гораздо позже именем Ушакова назвали бухту в юго-восточной части Баренцева моря и мыс на северном побережье Охотского моря. Имя Ушакова носили боевые корабли русского и советского Военно-морского флота. В 1944 г. были учреждены военный орден Ушакова двух степеней и медаль. В 2004 г. Ф.Ф. Ушаков был канонизирован. После того как в Саранске построили и освятили (2006) новый 9-купольный, очень высокий (63 м) и красивый, на 3 тысячи верующих, собор, в него перенесли из Рождество-Богородицкого Санаксарского мужского монастыря святые мощи Ф.Ф. Ушакова.