Всеми средствами пытались церковники отвлечь народ от классовой борьбы. В 1896 году при соборе была создана организация церковных активистов «Православное Исаакиевское братство», призванная под прикрытием «богоугодных» дел проводить религиозно-нравственную воспитательную работу среди трудового населения и особенно рабочих.
Значительная часть членов этой организации приходилась на долю представителей крупного чиновничества, дворянства и буржуазной интеллигенции. Материальные средства организации складывались из взносов ее членов и других поступлений. Деятельность братства заключалась в выдаче денежных пособий, распространении среди населения бесплатной «духовно-нравственной» литературы, проведении чтений и поучительных бесед. При братстве Исаакиевского собора была основана библиотека специально подобранных книг с читальней и утверждена церковно-приходская школа для «бедных девочек прихода». Исаакиевский собор широко использовал свой авторитет среди верующих, свой аппарат, свою материальную базу и другие возможности для активной антинародной деятельности.
Когда началась первая мировая империалистическая война, собор был одним из крупнейших центров монархической обработки трудящихся. В здании собора и на площади перед ним служили торжественные молебны о «ниспослании победы русскому воинству». Собор стал распределительным центром, из которого отправлялись на фронт походные церкви, молитвенники, иконы и кресты.
После Февральской буржуазно-демократической революции 1917 года выступления церковников собора были направлены на поддержку Временного правительства. Глубоко реакционный характер носила организация похорон казаков, расстреливавших демонстрантов во время июльских событий 1917 года. При отпевании их в соборе присутствовали члены Временного правительства во главе с Керенским, который выступил с речью. Похороны были превращены в контрреволюционную демонстрацию.
После победы Великой Октябрьской социалистической революции Совет Народных Комиссаров принял декрет «Об отделении церкви от государства и школы от церкви», явившийся одним из важнейших мероприятий Советской власти. Духовенство Исаакиевского собора, как и вся церковь, яростно сопротивлялось проведению в жизнь этого постановления. Выполняя указания патриарха Тихона, разославшего по церквам специальные инструкции «О поведении и взаимоотношениях с Советской властью», церковники пытались сеять антисоветские настроения среди населения, особенно среди молодежи. Под руководством ключаря собора В. Плотникова в Петрограде была создана организация по обучению детей и молодежи «закону божьему». При соборе функционировали «детские кружки» и «сестричества». Службы в дни церковных праздников приобретали откровенно контрреволюционный, антисоветский характер. В соборе устраивались различные совещания и собрания по поводу борьбы церкви против Советской власти.
В конце 1919 года имущество собора было передано организованной группе верующих, так называемой «двадцатке».
В 1921 - 1922 годах страна переживала тяжелое бедствие - голод в Поволжье. По просьбе населения голодавших районов Советское правительство издало декрет об изъятии церковных ценностей для закупки за границей хлеба. Духовенство ответило на этот гуманный документ призывом к борьбе против Советской власти. Патриарх Тихон выпустил воззвание, в котором писал: «Мы не можем одобрить изъятие из храмов, хотя бы через добровольные пожертвования, священных предметов, употребление коих не для богослужебных целей воспрещается канонами вселенской церкви и карается как святотатство». И здесь же воистину «гибко» замечал, раскрывая истинное положение дела: «Важно не то, что давать, а кому давать… Будьте же мудры, как змеи», - поучал Тихон, обращаясь к духовенству.
В Петрограде центром борьбы против декрета правительства стал Исаакиевский собор. 5 марта 1922 года, в «неделю православия», верующих созвали особыми листовками из всех районов юрода в собор на так называемое «торжество православия». После обедни в алтаре было созвано тайное совещание представителей духовенства. Митрополит Вениамин призвал всех присутствующих не отдавать церковные ценности, а настоятель Исаакиевского собора протоиерей Богоявленский полностью поддержал его. Был намечен конкретный план действий по укрытию ценностей, предусматривавший и вооруженное сопротивление. Во время изъятия ценностей церковники сделали попытку спровоцировать вооруженное выступление верующих. Чекистами было обнаружено в соборе оружие.
В результате работы комиссии 5 и 8 мая 1922 года в Исаакиевском соборе было изъято более 48 килограммов золота, 2 тонны 220 килограммов серебра и 796 драгоценных камней. Церковники, активно сопротивлявшиеся акту изъятия ценностей и допустившие антисоветские действия, были преданы суду.