Между тем натиск португальцев на Гуджарат усилился. В 1535 г. Бахадур был вынужден дать португальцам право построить в Диу крепость в обмен на обещание оказывать ему помощь против врагов. Однако, когда в Гуджарат вторглись могольские армии, португальцы нарушили свое обещание. Для дальнейших переговоров с ними Бахадур-шах прибыл на флагманский корабль португальского вице-короля, где был предательски убит. После его смерти в Гуджарате разгорелась борьба между феодальными группировками. В результате этих феодальных смут Гуджарат был легко завоеван Моголами и вошел в состав их империи.
Португальцы, многие годы снаряжавшие экспедиции, чтобы открыть путь в Индию, в 1498 г. под началом Васко да Гамы достигли Каликата, небольшого княжества и важного порта на Малабарском побережье. Пока португальцы плыли вдоль берегов Африки, они выменивали золото и слоновую кость у африканских племен на куски сукна, вино, бусы и тому подобные безделушки. Однако, прибыв в Индию, португальцы с удивлением увидели, что грубо сделанные, на индийский взгляд, европейские товары не имеют для сказочно богатой индийской знати никакой цены. Оказалось, что торговать европейцам нечем.
С другой стороны, военной техникой португальцы намного превосходили индийцев, особенно небольшие и постоянно враждовавшие между собой княжества Малабара. Португальские корабли, обогнувшие Африку, по своим размерам и скорости движения не шли ни в какое сравнение с небольшими индийскими судами, рассчитанными в основном на каботажное плавание. Дисциплинированные португальские отряды, вооруженные корабельными пушками и ручным огнестрельным оружием (аркебузами, а потом мушкетами), легко побеждали многочисленные индийские войска, у которых все оружие составляли или «небольшой меч и круглый щит» или «маленькое копье» (по словам одного немецкого купца, прибывшего в Индию с эскадрой Альмейды в 1505 г.). Таким образом, хотя португальцам нечем было торговать, они были в состоянии забирать индийские товары силой. Их целью было — господство в восточных морях, жестоко расправляясь со своими соперниками — восточными купцами на море и в портах Индии, Аравии и Африки, всюду, где велась торговля индийскими товарами. Разобщенность малабарских княжеств позволила португальцам укрепить свои позиции путем натравливания одного государства на другое и поощрения феодальных усобиц в прибрежных княжествах. На всякую попытку сопротивления португальцы отвечали обстрелом портовых городов и прибрежных деревень из корабельных орудий, а затем высаживали солдат, грабили, сжигали поселения, убивали людей, вырубали пальмовые рощи и уничтожали все, что не могли захватить с собой.
Обстрел и разрушение портов проводил еще Васко да Гама во время первого посещения Индии. В результате последующих военных экспедиций — Кабрала (1500 г.), Васко да Га-мы (1502 г.) и д'Альбукерки (1510–1511 гг.) — португальцам удалось захватить опорные пункты и биджапурский остров Гоа, ставший центром всех португальских владений на Востоке. Эти португальские крепости, рассеянные по побережью Персидского залива, начиная от Ормуза, и далее по берегам Африки и Аравии, вдоль западного и восточного побережий Индии, на Цейлоне, в Малаккском проливе, на Молуккских островах, в нынешнем Таиланде и даже в Китае, служили стоянками для ремонта португальских кораблей, надежно защищаемыми складами для товаров (в первую очередь пряностей и хлопчатобумажных тканей), ежегодно пересылаемых в Португалию, и местами размещения португальских войск. Во внутренние районы Индии португальцы проникнуть не смогли. В своих индийских владениях они жестоко эксплуатировали индийское население, хотя в захваченных ими деревнях вблизи Гоа стремились сохранить сельскую общину. Религиозная нетерпимость португальцев (португальцы разрушали индусские храмы, а учрежденная в 1560 г. в Гоа инквизиция начала жестокие религиозные преследования) настраивала против них местное население.
Монополия португальцев на морскую торговлю в этом районе подорвала налаженные торговые связи Индии с другими странами Востока, отрезала глубинные районы от остального мира и задержала их развитие. Ожесточенные войны, разрушение портов и уничтожение населения Малабара привели к тому, что это богатое побережье стало одной из отсталых местностей Индии, где долго еще сохранялись примитивные социально-экономические отношения. Ослаблен был и Гуджарат.
Пока португальцы сражались только с местными армиями, они благодаря своему преимуществу в вооружении не только отстаивали, но даже расширяли свои владения. Однако как только их господство на море оказалось подорванным в результате появления в Индийском океане и на южных морях голландских судов, португальцы уже не могли противостоять армиям местных правителей. Те стали отнимать у них один опорный пункт за другим.