В Арагонии, однако, трибуналы продолжали расследовать такого рода преступления, а португальская инквизиция считала, что за них следует наказывать смертью или каторгой. Когда инквизитор Эредиа ревизовал в 1597 году трибуналы Барселоны, Вича и Урхеля, он нашел, что из 68 дел 15 касаются обвинения в «противоестественных преступлениях»; впоследствии все эти дела были прекращены. В Валенсии на разных аутодафе в 1598—1602 годах за противоестественные половые сношения осудили 37 человек, из них семь монахов.
На аутодафе в Лиссабоне в 1723 году за «противоестественный грех» был вынесен приговор — десять лет каторжных работ и удары плетьми.
Как бы там ни было, очевидно, что в целом прелюбодеяние, двоеженство, склонение к соитию во время исповеди, мужеложство наказывались гораздо менее сурово, чем неосторожно сказанное слово, которое можно было истолковать как ересь.
Об этом свидетельствует, например, случай с почтенным дворянином Альваро де Монтальваном. Этот семидесятилетний старик в ответ на речь священника о блаженстве загробной жизни позволил себе заметить, что об этом мы доподлинно знать ничего не можем. Сказанное стало известно инквизиции, и Альваро арестовали. После проведенного по всем правилам следствия 18 октября 1525 года несчастного старика приговорили к конфискации имущества и вечному тюремному заключению; последнее, правда, вскоре заменили домашним арестом. В 1571 году священник Лидуэньа де Озорио обмолвился, что епископы Тридентского собора заслуживают сожжения, так как взяли на себя роль папы. За это валенсийский трибунал приговорил его к «сильному отречению», лишению сана, шестилетнему заключению и вечному изгнанию из Валенсии. В 1582 году адвокат Пабло Эрнандес добровольно признался суду, что однажды в пылу спора сказал, будто не все канонизированные действительно святые. Он был приговорен к «легкому отречению», штрафу в 6000 мараведи; причем этот приговор должны были прочитать в церкви во время мессы. Эрнандес пожаловался на приговор Супреме, которая отменила публичное чтение в церкви, но увеличила штраф до 20000 мараведи.
Наказания за еретические высказывания были крайне разнообразны, как, собственно, и сами высказывания, могущие послужить причиной обвинения. Во всех мыслях, словах, выступлениях и сочинениях лучшей части испанского общества, в особенности в теологических трудах, инквизиция искала повод для привлечения их авторов к ответственности. Все это крайне печально отражалось на духовной жизни Испании.
К той же группе преступлений принадлежало богохульство. С первых же дней своего основания инквизиция стала требовать для себя права наказывать богохульников, которых считала еретиками. В 1534 году мадридские кортесы жаловались королю Карлу V на то, что инквизиция арестовывает людей, которые во время игры в карты или вообще в пылу гнева позволяют себе богохульственные выражения; особенно беспокоило жалобщиков, что эти аресты и последующее, пусть даже самое легкое наказание трибуналом отражаются не только на непосредственном виновнике богохульства, но и на его потомстве, которое таким образом теряет «чистоту крови» в нисходящем поколении. Ввиду этого кортесы ходатайствовали перед Карлом, чтобы богохульство строжайшим образом наказывалось светскими судами, но отнюдь не инквизицией.
Король не дал прямого ответа на это ходатайство, ограничившись заявлением, что инквизиция может наказывать лишь за такое богохульство, в котором присутствует ересь. После этого пыл инквизиции в отношении богохульников несколько остыл; тем не менее в доступных нам отчетах об аутодафе случаи богохульства время от времени продолжают встречаться.
Когда инквизиция только была введена в Кастилии, преследование гадателей и магов не входило в ее компетенцию. Но в 1500 году вышел королевский эдикт, который предписывал коррехидорам и судейским чинам следить за тем, чтобы в их округах не было людей, занимающихся гаданием о будущей жизни; если таковые найдутся, их следовало арестовать, причем светские лица отдавались юрисдикции светского суда, духовные — духовного. Однако инквизиция, стремившаяся забрать себе побольше власти, тут же попыталась заявить свое право расследовать все дела подряд — как лиц светских, так и лиц духовных. В 1501 году сарагосский трибунал арестовал несколько некромантов и обратился к Супреме с вопросом, как поступить с имуществом арестованных. Так как дело, по-видимому, впервые рассматривалось инквизицией, великий инквизитор, сам высказавшись за конфискацию, отправил все-таки свое постановление на утверждение короля. Фердинанд известил архиепископа о необходимости обсудить этот вопрос на общем собрании компетентных лиц, и это собрание решило, что конфискованное имущество гадателей и магов должно принадлежать королю.