В 1454 году Хаджи Гирей, очевидно боясь удара в спину перед войной за власть в Северном Причерноморье и Крыму, заключил союз с турками, только что захватившими Константинополь. Сохранилось донесение из Каффы в Геную от 11 сентября 1454 года: «Он-Хаджи Гирей, препятствуя морскому сообщению, дошел до того, о чем никогда и не слыхивали: имея собственные фусты (вид галеры – А. А.) и располагая собственными кораблями, он с их помощью нарушает торговлю и перевозит товары и рабов». В июле 1456 года к Каффе подошел турецкий флот из 56 бирем, морская пехота которого совершила две вылазки. С другой стороны появился шеститысячный татарский отряд во главе с Хаджи Гиреем, предложившим правителям Каффы заключить союз с ним и турецким султаном. Союз был заключен на всех условиях крымского хана, дань генуэзцев татарам и туркам была значительно увеличена. Тогда же в нижнем течении Днепра татарами были построены крепости Кызыкермен и Джанкермен.
В 1455 году войско крымского хана Хаджи Гирея с литовской помощью разгромило войско Большой Орды. Хан Сейид-Ахмет был захвачен в плен и отвезен в Ковно, где вскоре Умер. С этого времени междоусобная война между двумя ханствами длились до начала XVI века, ведясь на обширных территориях. В следующей битве на Дону в 1465 году войска Хаджи Гирея и литовские отряды разгромили войско хана Большой Орды Махмуда. Махмуда бежал в Астрахань, где ему удалось создать Астраханское ханство. Ханом Большой Орды стал его брат Ахмат.
После смерти Хаджи Гирея в 1466 году власть в Крыму была у Нур-Девлета, вскоре оказавшегося заточенным в генуэзской крепости Солдайе. В 1468 году крымским ханом стал Менгли Гирей, сын Хаджи Гирея, сразу же заключивший мирный договор с Каффой. В 1474 году войско Ахмата разбило крымских татар Менгли Гирея. Крымский хан ушел в Турцию. Новым ханом Крымского юрта стал сын Ахмата Джанибек. Менгли Гирей вспомнил о договоре 1454 года, подписанным его отцом Хаджи Гиреем. За возвращение ханства он пообещал отдать султану Таманский полуостров и генуэзские колонии в Крыму. Менгли Гирей тайно вернулся в Крым собирать преданные ему отряды. 31 мая 1475 года турецкая эскадра под командованием главного везиря Кедук-паши в Кафинском заливе высадила десант, поддержании с берега татарским отрядами Менгли Гирея. На пятый день в результате предательства Каффа пала. Город получил турецкое название Кефе и стал центральным опорным пунктом Турции в Крыму. В результате кровопролитных сражений турецкие войска разгромили и оккупировали княжество Феодоро и все города южного побережья Крыма. С генуэзским присутствием на Крымском полуострове было покончено. Турки захватили также Таманский полуостров.
По другой версии захвата Оттоманской Портой Крымского полуострова Менгли Гирей в начале 1475 года был заточен в Мангупскую крепость. У крымского хана были прочны дружественные связи с генуэзцами, и турецкие властители боялись их объединения в случае турецкого нападения. Турки договорились с беем рода Ширин Эминеком и совместны ми усилиями уничтожили владения генуэзцев в Крыму. I июле 1475 года Менгли Гирей был освобожден из тюрьмы чтобы подписать договор с главнокомандующим турецких войск в Крыму и верховным визирем Гедик-Ахмед-пашой. В декабре 1475 года, после полугодичной осады и пяти штурмов турецкие войска уничтожили княжество Феодоро и убили его князя Александра. Крымское ханство превратилось в вассала Турции. Менгли Гирей был щедро одарен султаном и утвержден крымским ханом. Территория княжества Феодоро и южный берег Крыма от Кефе до руин Херсонеса стал «султанским санджаком», состоящим из Мангупского, Судакского, Кефейского и Еникальского кадылыков и вошел в состав Турции. Сохранившееся христианское население Крыма было обложено большим количеством налогов и повинностей, турецкие власти усилили политику мусульманизации. Турецкий султан Мехмед захотел взять под свой контроль и земли Большой Орды. В 1476 году Оттоманская Порта объединила Большую Орду и Крымское ханство в один улус, Менгли Гирея сместили и крымским ханом стал сын властителя Большой Орды Ахмата Джанибек. Однако Ахмат и Джанибек, хотевшие восстановления Золотой Орды, не захотели полностью подчиниться Турции и в 1478 году с помощью крымской знати Джанибек был изгнан из Крыма. Крымским ханом вновь стал Менгли Гирей, подтвердивший договор 1475 года. В Стамбуле постоянно жили члены семьи Гиреев, из которых султан мог в любой удобный для него момент подобрать замену строптивому крымскому хану, а в резиденции постоянного представителя Стамбула в Крыму Кефе находился большой турецкий гарнизон. Крымскому ханству была оставлена внутриполитическая автономия и право дипломатических отношений с иностранными государствами.