Строительство батарей и заграждений велось силами гвардейских полков и подразделений флота. Ежедневно на работы выходило до 10 тысяч человек. Только в январе-феврале 1856 года было забито свыше 80 тысяч свай. К весне 1856 года все батареи были закончены. В марте того же года начались мирные переговоры между Россией, Францией и Англией, и работы по усилению обороны Кронштадта были приостановлены. Зато возобновилось гражданское и промышленное строительство. В 1858 году состоялось открытие Кронштадтского пароходного завода, который был признан одним из лучших в Европе предприятий подобного рода.
Построены были здания театра, Морского собора (заложен в 1903 году), продолжались работы по замощению улиц и площадей.
Кронштадт сильно пострадал в годы революции и Гражданской войны. Обветшала и пришла в негодность почти половина зданий города — как деревянных, так и каменных. В катастрофическом положении оказался городской водопровод и канализация. Силы на восстановление городского хозяйства нашлись в конце двадцатых годов прошлого века. Первенцем строительства стал четырехэтажный дом, построенный в 1931 году на месте сгоревшего трактира «Германия». Затем последовали еще корпуса жилого городка для рабочих Морского завода, появились новые больница и поликлиника, школа, еще ряд жилых домов.
...Началась Великая Отечественная война, и город снова вспомнил о своем главном предназначении: быть щитом Петербургу и России. Фашисты могли видеть из захваченного Петергофа не только строения, но и пешеходов на улицах Кронштадта. Весь период Ленинградской блокады Кронштадт подвергался массированным бомбардировкам и артобстрелам и был сильно разрушен, но, тем не менее, продолжали действовать ремонтная база кораблей Балтийского флота, лаборатория по размагничиванию судов и база подводных лодок, топивших вражеские транспорты и боевые корабли в Финском заливе и Балтийском море. Орудия кронштадтских моряков прикрывали ледовую Дорогу жизни, по которой поддерживалась связь осажденного Ленинграда со всей страной.
После войны город был полностью восстановлен буквально в течение пяти лет. Тем не менее на его территории присутствует значительная часть жилья, построенного до 1917 года, и дома сталинской постройки 30-х годов прошлого века, несколько кварталов панельных и кирпичных пятиэтажных домов 1950—1960-х годов. Строительство нового жилья на острове практически не ведется.
В советское время и вплоть до 1996 года Кронштадт был закрытой территорией, здесь базировался Военно-морской флот страны. И хотя сейчас ограничения сняты, район по-прежнему считается территорией военных. Почти треть территории острова занимают воинские части, завод «Арсенал» и Кронштадтский морской завод.
На территории города расположены специализированные высшие учебные заведения, такие как Морской кадетский корпус, Мореходная школа, филиал Университета водных коммуникаций, общетехнический факультет Северо-Западного политехнического университета, филиал Академии сервиса и экономики.