Имелись и серьёзные провалы, – например, из-за предательства и бегства 05.09.1945 г. в Оттаве шифровальщика И. С. Гузенко с секретными документами, от действий других «перебежчиков» и от американской контрразведки, – например, в рамках операции «Венона». Некоторые разоблачённые советские агенты согласились сотрудничать с американской контрразведкой, например, Гарри Голд, Рут и Дэвид Грингласс, спасая свою жизнь, выдали известных им советских агентов Этель и Юлиуса Розенбергов. Были провалы и в результате отдельных ошибок советских разведчиков и руководителей разведки, которых не удалось избежать. Так, в нарушение конспирации и агентами, и руководством резидентуры (давшей канал связи), агент Голд вышел на Грингласса, и эта связь между разными ветвями разведки в нарушении правил конспирации, по воспоминаниям Судоплатова П. А., привела и к провалу обоих агентов. Судоплатов отмечает, что осуждение Розенбергов по «атомному шпионажу» было необоснованным. Информация от них по ядерному проекту имела второстепенный характер, а более ценную информацию они предоставили по химии и радиолокации (см. [16], с. 346). Хронологически этот выход Голда на Грингласса случился летом 1945 года. А «нервные» и поспешные действия центра в Москве и резидентурах могли быть связаны с желанием быстро получить сведения о первых американских испытаниях атомной бомбы. Сообщение от разведчиков о том, что испытание будет проведено 10-го июля, не подтвердилось из-за того, что оно было перенесено из-за плохих погодных условий. Такая ситуация поставила под сомнение источник информации и могла вызвать нервную реакцию Берии. Но когда испытание было проведено 16-го июля, эти сомнения исчезли вместе с сомнениями, что атомную бомбу вообще можно создать. Этот пример показывает, что причиной провала агентов бывают и поспешные, плохо рассчитанные действия руководства разведки, которые ставят агентов под удар. Такие действия связаны с необходимостью быстрого получения информации, ценность которой падает в случае её запаздывания. Серьёзно подвела и Элизабет Бентли – курьер, возлюбленная и доверенное лицо Джейкоба Голоса, – руководителя оперативной группы НКВД в США. После смерти Голоса, она в ноябре 1945 года выдала ФБР список из 30 имён американцев, сотрудничавших с советскими спецслужбами – в том числе Лаклин Кери (бывшая помощница президента Рузвельта) и Харольд Гласер – сотрудницу министерства финансов.
В группу Ю. Розенберга входили коммунисты Альберт Сарант и Джоэл Барр, которые, спасаясь от преследования, эмигрировали сначала в Чехословакию, а потом в СССР. Они были выдающимися инженерами, которые вложили много труда в создание советской электроники и вычислительной техники, создали первые управляющие микро-ЭВМ (ниже о них сказано в главе о развитии вычислительной техники).
Клаус Фукс избежал гибели на электрическом стуле в США, видимо, потому, что он сам работал на английскую разведку, передавая ей секреты Манхэттенского проекта, которые американцы скрывали от всех, – даже от Великобритании. И потому, что он признался в своей деятельности в пользу СССР (что Ким Филби посчитал ошибкой). Видимо, здесь была заключена сделка со следствием, условием которой был отказ от его депортации в США и смягчение наказания британским правосудием. По официальной версии британских властей, Фукса «разговорил» лучший в стране психолог по проведению допросов Уильям Скардом. Условием сделки была, видимо, и невыдача Фуксом агентов-связников и резидента, а источником информации был он сам. После освобождения Клаус Фукс женился, стал членом Академии наук ГДР и заместителем директора Института ядерной физики, членом ЦК СЕПГ и лауреатом Государственной премии.