Поэтому, правительство Ближней Думы начинает проводить серию грандиозных реформ, имевших своей целью усилить и сплотить страну перед серией тяжелейших войн. Они, в основном, пришлись на 1550-е гг. В 1550 г. создается пока довольно небольшое стрелецкое войско.
Стрельцы получали коней и оружие от государства, но жили в своих домах, а не в казармах, и жалование им выплачивалось нерегулярно. Поэтому последние фактически были воинами лишь во время войны, а в мирное время они жили в городах и занимались ремеслами и торговлей. Тем не менее, боеспособность стрельцов, которых в XVI–XVII вв. становилось все больше, была выше, чем у дворянского и, тем более, у народного ополчения. Тогда же было проведено расширение прав сельских и городских общин. Теперь они сами ведали раскладкой податей, ловили разбойников и т. д. Кроме того, правительственная администрация – наместники и волостели – теперь имели право вершить суд только вместе с выборными представителями общины (целовальниками или излюбленными головами). Кормления, т. е. содержание местных властей за счёт населения, которые приводили к страшному произволу, были отменены, вместо них был введен небольшой налог. В результате управление на местах как бы «вернулось в древность». Возможно, оно было менее эффективным, чем в те времена, когда находилось в руках государственной администрации, но эти реформы снижали уровень социальных противоречий перед началом тяжелейших войн и вызвали настоящее ликование в народе. Последний фактор в сложившихся условиях был, видимо, важнее, чем даже собственно эффективность управления. Так же можно объяснить и консервацию архаики в XVI—XVII вв. вообще. В феврале 1549 г. был созван первый в истории Руси Земский Собор. Соборы сыграли определённую роль в истории страны. Они могли принимать только единогласное (соборное, как тогда говорили) решение.2 октября 1552 г. 150-тысячное русское войско, используя военно-инженерные новинки дьяка Ивана Выродова, в союзе с отрядами поволжских народов штурмом берёт Казань.
Ненависть к казанским ханам толкнула на союз с «белым царём» даже некоторые башкирские орды. Главнокомандующим русским войском тогда был князь А. Б. Горбатый-Шуйский. В 1556 г. хан Большой Ногайской Орды Исмаил во главе 30 тысяч ногайцев с участием небольшого русского отряда взял для Руси Астрахань, потому что ногайцы и астраханские татары были старыми врагами, и на этом сыграла русская дипломатия. В 1557 г. в состав Руси формально входят Кабарда и Северная Осетия. Таким образом, несмотря на тяжелейшие жертвы, наша страна в середине XVI в. разрывает кольцо врагов, избавляется от набегов с востока и юго-востока, уничтожает работорговлю, проникает в Предкавказье и Зауралье, полностью получает Великий Волжский речной путь, что приводит к бурному расцвету торговли с Востоком. Земли Поволжья заселяются представителями самых различных сословий, что смягчает социальные противоречия в русском обществе, создаются мощные Донское и Терское казачьи войска. В конце правления Ивана IV усилиями казаков во главе с Ермаком Тимофеевичем была присоединена Западная Сибирь. В 1598 г. в состав Руси вошла Восточная Башкирия. Ошеломляющий же успех Ермака легко объясним его мудрой политикой в отношении сибирских народов. Он обложил их небольшой податью (ясаком), под угрозой смертной казни запретил своим людям грабежи покорённых племён, чем выгодно отличался от завоевавшего перед этим данные земли хана Кучума.