Новая Сечь располагалась на изгибе р. Подпильной и существовала в 1734—1775 гг. Российская администрация сразу же создала возле Новой Сечи крепость с армейским гарнизоном — так называемым «Новосеченский ретраншемент». Летом 1734 г. киевский генерал-губернатор И. Б. Вейсбах провел в Лубнах переговоры с казаками, по итогам которых императрица признала за Новой Сечью права на все прежние владения Запорожья. Эти земли получили официальное название — Вольности Войска Запорожского. Казакам возвращались права самоуправления и вновь выдавалось жалованье из российской казны за военную службу.
Произошли существенные изменения во внутреннем устройстве Сечи. Так, быстро снижалось значение войсковой рады и возрастала роль старшины, которая на своих узких радах решала все текущие дела. Так же, как в Гетманщине в свое время, происходило закрепление выборных должностей за одними и теми же лицами, хотя формально войсковые рады избирали должностных лиц на один год. Например, Петр Калнышевский был кошевым атаманом в 1762 г. и в 1765—1775 гг. Власть кошевого атамана крепла, и он по своим полномочиям, богатству и влиянию становился фигурой на Сечи, подобной И. Мазепе на Левобережье. Также возросла роль куренных атаманов, подобно полковникам в Гетманщине.
Основным занятием казаков Новой Сечи была военная служба и охрана границ с Османской империей. Активным было их участие в войнах с Турцией в 1735—1739 гг. и 1768—1774 гг. Вместе с тем преобладающее развитие получила новая для Сечи тенденция — росла роль семейных казаков-домохозяев, а также происходило хозяйственное освоение владений с помощью поселенцев извне. Большое значение для развития земледелия и промыслов во владениях Сечи имел приток беглых крепостных. К 1775 г. на землях Вольностей Войска Запорожского проживало до 100 тыс. человек (с учетом окраин, которые были отняты правительством для создания новых подчиненных ему областей — Новой Сербии, Славяно-Сербии, Новороссийской губернии).
Несмотря на то что и ранее Сечь не была однородной, в новых условиях все более значимый характер приобретало социальное расслоение, подобно тому процессу, что происходил в Малороссии. Это провоцировало многочисленные восстания, чему содействовали прочные связи, которые существовали между сечевиками и гайдамаками Правобережной Украины. Известны восстания на Сечи в 1749, 1754, 1758, 1759, 1761 и 1768 гг. Значительных размеров достигло возмущение в начале 1768 г.: под воздействием «Колиивщины» сечевики восстали во время очередных перевыборов старшины на войсковой раде. Запорожская сирома выгнала кошевого П. Калнышевского со старшиной и разграбила их имущество. Восставшие планировали уйти в Турцию вместе с артиллерией и казной, но были перехвачены и разбиты российскими войсками.
Растущая пророссийская позиция сечевой старшины, обособившейся от рядового казачества, позволила еще в 1750—1764 гг. управление Запорожьем безболезненно передать в руки гетмана К. Разумовского.
Конец запорожской вольницы
Для России огромное значение приобретало экономическое освоение плодородных владений Вольностей Войска Запорожского. Особенно значимым этот фактор стал с середины XVIII в., что было связано с достижением Россией (и ее украинских территорий) необходимого уровня социального и военно-технического развития, которое позволяло превозмочь многовековое давление кочевых народов степной зоны Евразии, прежде всего крымских татар. В 1752 г. на территории Бугогардовской и Кодакской паланок была образована Новая Сербия, населяемая сербами, венграми, молдованами, болгарами, греками. В 1753 г. на левом берегу Днепра возникла Славяно-Сербия. В 1754 г. по соседству с крепостью Святой Елизаветы появился Новослободский полк. Во взаимных земельных спорах новообразованных районов и Новой Сечи российское правительство неизменно игнорировало права сечевиков.
Тревожным для сечевиков стал 1764 г., когда из состава Новой Сербии, Славяно-Сербии и «Заднепровских мест» была образована Новороссийская губерния с центром в Кременчуге. Она существовала в 1764—1783 гг. и стала своеобразным инструментом интеграции Запорожья в состав России. В 1775 г. губерния была разделена на три провинции: Кременчугскую, Екатерининскую и Елисаветградскую. Губернская администрация рассматривала область Вольностей Войска Запорожского как «порожние» (т. е. вольные) земли и всячески содействовала притоку поселенцев в регион. В 60-х гг. XVIII в. началось переселение в Новороссию масс немецких колонистов, хотя до конца XVIII в. решающее значение в деле освоения края имел приток поселенцев из украинских земель, Молдовы, российских старообрядцев. Если в 30-х гг. XVIII в. наступление на владения Сечи обеспечила возникшая тогда Украинская укрепленная линия, то окончательному поглощению края способствовало сооружение в 1770 г. на его южных границах (от Днепра до Азова) Днепровской линии из семи крепостей. По образному выражению, Сечь была «убрана в мешок», который осталось лишь «завязать».